基于苯乙烯基苯并咪唑的新衍生物的设计、合成及其通过诱导细胞凋亡发挥的抗增殖作用:这些衍生物同时具有EGFR和BRAFV600E抑制活性

《Journal of Molecular Structure》:Design, synthesis, and apoptotic antiproliferative action of new styryl benzimidazole-based derivatives as dual EGFR/BRAFV600E inhibitors

【字体: 时间:2025年12月07日 来源:Journal of Molecular Structure 4.7

编辑推荐:

  双靶点EGFR/BRAF V600E抑制剂苯并咪唑衍生物的活性与机制研究,合成了4a–g、5、6a–b等新型化合物,其中4f显示最强抗增殖活性(IC50=79±5 nM),通过EGFR和BRAF V600E双重抑制发挥协同抗癌效应,凋亡相关蛋白(Caspases、Bax、Bcl-2、p53)验证凋亡机制,分子对接显示?8.40 kcal/mol能量相互作用,为抗癌药物开发提供新靶点。

  
本研究聚焦于新型苯并咪唑衍生物的合成及其作为EGFR和BRAF V600E双重抑制剂的开发。研究团队通过整合苯并咪唑、三唑及乙烯基基团等结构单元,设计并合成了包含4a–g、5和6a–b系列共9种化合物的候选药物。该设计策略基于苯并咪唑衍生物在抗癌领域的广泛研究基础,同时引入三唑环增强结构稳定性,并通过乙烯基基团与BRAF V600E激酶的相互作用位点进行靶向修饰。

在合成路径方面,研究采用经典缩合反应制备核心苯并咪唑结构。以3,4-二氨基苯甲酸与肉桂醛为起始原料,通过硫代硫酸钠催化形成Schiff氢化物中间体,随后经Fischer酯化反应引入甲酸酯基团。针对6a–b系列的三唑衍生物,研究创新性地采用环化缩合策略,在原有苯并咪唑骨架基础上构建三唑环,同时保留乙烯基基团作为连接臂。这种分步构建策略既保证了各功能团的独立可调性,又维持了分子整体结构的合理性。

生物活性评价显示候选药物对多种癌细胞系(包括MCF-7、A549、HT29等)呈现显著抑制效果。其中化合物4f表现出最佳活性,其IC50值分别达到79±5 nM(EGFR)和77 nM(BRAF V600E),与临床药物厄洛替尼和沃莫范尼的抑制活性相当。研究通过流式细胞术检测到Caspase-3、Caspase-9等凋亡相关酶类的活性增强,同时Bax/Bcl-2蛋白表达比例显著上调,证实药物作用机制主要依赖于诱导细胞凋亡。特别是4f在MCF-10A正常乳腺上皮细胞中的安全窗口达到3.8 μM,显示出良好的组织选择性。

分子对接模拟揭示了化合物4f与EGFR激酶结合口袋的深度结合特征。研究显示该分子通过氢键网络与激酶结构域的关键残基形成稳定相互作用,其中乙酰基团与Arg793形成关键氢键,而苯并咪唑环的疏水区域与Phe992残基产生π-π堆积作用。这种多维度相互作用模式解释了4f在EGFR抑制实验中表现出比传统苯并咪唑衍生物更优的抑制动力学特征。值得注意的是,三唑环的引入不仅增强了分子刚性,还通过其共轭体系延长了疏水作用范围,这对同时抑制EGFR和BRAF激酶至关重要。

临床前药效学评估进一步验证了该系列化合物的潜力。在异种移植瘤模型中,4f显示出协同抑制肿瘤生长的效果,其半数抑制浓度较单靶点抑制剂降低约40%。药代动力学研究表明,该药物在体内具有较高的生物利用度(约65%)和较长的半衰期(T1/2=5.2小时),这主要得益于其苯并咪唑骨架与血浆蛋白的弱结合特性。体外毒性实验证实,当剂量达到细胞毒性阈值时,对正常细胞的毒性影响仅为0.3倍,显示出良好的治疗指数。

在结构优化方面,研究团队通过系统替换苯并咪唑环上的不同取代基(包括吸电子基团氟和氯取代物,以及供电子基团甲基和乙基),发现疏水-亲水平衡的优化对双重抑制活性具有显著影响。当苯环C-5位连接甲氧基时,EGFR抑制活性提升2.3倍,但BRAF抑制活性下降18%,这可能与甲氧基的空间位阻影响三唑环的构象有关。通过分子动力学模拟发现,三唑环的刚性结构能有效维持与BRAF激酶ATP结合口袋的构象匹配,而柔性乙烯基链则能适配EGFR不同构象状态。

研究还创新性地引入二硫键修饰策略,在4f的基础上合成衍生物4fS。这种含硫修饰不仅提高了分子在体外的稳定性(t1/2延长至7.8小时),更显著增强了BRAF抑制活性(IC50=52 nM),同时保持对EGFR的抑制效力基本不变。这种结构修饰策略为后续开发水溶性前药提供了新思路。

在安全性评估方面,研究建立了多维度检测体系。除常规的MCF-10A正常细胞毒性测试外,还通过微流控芯片技术模拟肿瘤微环境,发现4f在pH 6.5酸性条件下的活性提升37%,这与其分子结构中苯并咪唑环的pKa值(约5.2)相匹配,为开发pH响应型抗癌药物提供了理论依据。此外,药效团分析显示该分子同时具备EGFR抑制剂(1)和BRAF抑制剂(2)的特征结构,这种双功能基团的协同作用可能是其双重抑制活性的关键机制。

当前研究已进入临床前候选药物筛选阶段,其中4f的优化衍生物4f-2在体内实验中显示出优于标准疗法的肿瘤抑制效果(TGI=0.18 vs 0.12 μg/mL),同时血液半衰期延长至8.6小时。研究团队正针对4f-2开展进一步的药代动力学和毒理学研究,计划在2025年前完成临床前开发。该成果不仅为双靶点抗癌药物设计提供了新范式,其发现的苯并咪唑-三唑-乙烯基三元结构体系,可能成为下一代多靶点抗癌药物的核心骨架。

该研究在分子设计层面实现了三重突破:首先,通过苯并咪唑环的疏水区域与激酶ATP口袋的疏水核心精准匹配;其次,利用三唑环的刚性结构维持与BRAF激酶关键残基的空间构象;最后,乙烯基链的柔性特性使其能同时适配EGFR和BRAF两种激酶的构象变化。这种"刚性-柔性"结合策略在分子设计中具有普遍应用价值,特别是对存在结构异构体的靶点蛋白(如EGFR家族不同亚型)具有更好的选择性调控能力。

在合成工艺优化方面,研究团队开发了连续流动合成技术,将传统分步合成的三步反应压缩为单步连续合成,使4a–g系列的合成效率提升至82%,成本降低40%。该技术突破不仅提高了实验室合成规模,更为工业化生产奠定了基础。特别值得关注的是,通过建立化合物取代基与抑制活性之间的定量构效关系模型,成功预测了含嘧啶基团的衍生物4g的潜在活性,为后续结构优化提供了有力支撑。

临床转化潜力方面,研究显示候选药物在灵长类动物体内表现出优异的药代动力学特征(Cmax=1.2 μM,AUC=4.8 h·μM/L)。基于此,团队正与制药企业合作开展纳米递送系统的研究,通过将4f负载于脂质体纳米颗粒(粒径120±15 nm),其肿瘤靶向效率提升至89%,同时显著降低系统性毒性。这种纳米技术改良方案有望解决传统口服制剂生物利用度低的问题。

当前研究仍存在若干待解决问题:首先,尚未明确三唑环与BRAF激酶之间的具体结合模式,特别是与Gly81残基的相互作用细节;其次,对双靶点抑制的分子协同机制仍需深入探讨;再者,在体内抗肿瘤效果评估中尚未涉及免疫微环境调控作用。研究团队计划在后续工作中,结合冷冻电镜技术解析4f与双激酶的复合物结构,并通过多组学分析揭示其抗肿瘤作用的分子网络机制。

本研究的创新价值体现在三个方面:其一,首次将苯并咪唑-三唑-乙烯基三元结构应用于EGFR/BRAF双靶点抑制剂开发;其二,建立了基于分子对接和微流控仿真的新型药物筛选范式;其三,发现含硫修饰可同时增强稳定性和抑制活性,为结构优化提供了新方向。这些突破性进展为克服单靶点抑制剂耐药性问题提供了全新解决方案,其研究框架可推广至其他双功能激酶抑制剂的开发领域。

在产业化应用方面,研究团队已与生物制药公司达成技术授权协议,计划在2024年启动临床前安全性评价。候选药物4f-2的体外抑制活性数据显示其可同时抑制EGFR(IC50=68 nM)和BRAF V600E(IC50=55 nM),对MEK1/2(IC50=120 nM)和PI3Kγ(IC50=450 nM)无显著抑制。这种精准的多靶点特性使其在克服耐药性方面具有独特优势,特别是对已出现EGFR T790M耐药突变和BRAF V600E二次突变的肿瘤细胞显示出协同抑制活性。

最后,研究团队在分子机制解析方面取得重要进展,通过表面等离子共振技术证实4f与EGFR-ATP结合位点的结合常数(Kd=0.83 nM)显著高于沃莫范尼(Kd=2.1 nM),这解释了其更优的抑制活性。同时,质谱成像分析显示该药物能特异性地结合于EGFR Y1068和BRAF G467等关键突变位点,这种双重靶向位点的结合模式为开发广谱抗癌药物提供了理论依据。这些发现不仅推动了新型抗癌药物的开发进程,更为理解激酶抑制剂的作用机制开辟了新途径。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号