西方狩猎采集者遗传成分对意大利人群长寿的贡献:一项古基因组学视角下的进化遗传学研究

《GeroScience》:Western Hunter-Gatherer genetic ancestry contributes to human longevity in the Italian population

【字体: 时间:2025年12月14日 来源:GeroScience 5.4

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  本研究针对人类长寿遗传基础的进化起源问题,通过整合古基因组数据与意大利百岁老人队列,首次系统评估了古代祖先成分对极端长寿的贡献。研究人员通过PCA、f4-统计、逻辑回归及染色体绘画(ChromoPainter)等多重分析,发现百岁老人携带更高比例的西方狩猎采集者(WHG)相关 ancestry,且该信号独立于意大利人群遗传结构。结果表明,WHG 这一末次盛冰期后扩张的古老遗传成分,可能通过特定促长寿SNP(如 rs7412 等)的富集,对现代人群健康衰老产生持续影响,为长寿的群体特异性进化机制提供了新证据。

  
人类能否活过百岁,不仅取决于现代生活方式,更可能深植于数万年前的祖先基因库中。随着古基因组学技术的突破,科学家们开始追溯现代复杂性状的进化根源。长寿作为典型的复杂性状,其遗传机制在传统全基因组关联分析(GWAS)中已被广泛探索,但古代人口迁移与混合如何塑造当今长寿人群的遗传背景,仍属未知。尤其在欧洲,新石器时代农业革命与青铜时代游牧人群的迁徙,深刻重构了当地遗传格局,而不同祖先成分(ancestry)对健康衰老的贡献差异,正是理解长寿进化史的关键。
为解答这一问题,来自博洛尼亚大学等机构的 Stefania Sarno、Vincenzo Iannuzzi 及 Cristina Giuliani 等研究人员在《GeroScience》发表论文,首次将意大利百岁老人(CENT, n=333)与地理匹配对照(ITA, n=690)的基因组数据,同代表欧洲主要古代祖先的103个古基因组(包括西方狩猎采集者WHG、安纳托利亚新石器时代农民Turkey_N、亚姆纳亚草原牧民Yamnaya_EBA及伊朗新石器时代成分Iran_N)进行比较,系统评估了古老遗传成分对极端长寿的贡献。
关键实验方法概述
研究基于Illumina CoreExomeChip芯片数据,经质控后获得498,285个常染色体SNP。通过主成分分析(PCA)将现代与古代样本投射至欧西亚遗传背景;利用f4-统计与监督式混合分析(ADMIXTURE)量化祖先成分差异;采用染色体绘画(ChromoPainter)技术推断现代个体基因组中的古代祖先片段;最后针对15个独立促长寿SNP(源自Giuliani等2018年研究)进行祖先特异性负荷检验(burden test),所有分析均校正意大利人群南北遗传结构(PC1)。
研究结果
1. 百岁老人与WHG祖先具有显著遗传亲和性
PCA与欧几里得距离分析显示,CENT组相较于ITA组更接近WHG祖先 centroid(p=9.44e-03),而与其他祖先(Turkey_N、Iran_N、Yamnaya_EBA)无显著差异。f4-统计进一步证实该趋势(Z=6.08),且女性亚组分析结果一致。
2. WHG成分独立于人群结构与长寿状态正相关
逻辑回归模型显示,WHG ancestry 每增加1个标准差,百岁老人概率提升38%(OR=1.38, p=1.23e-02)。残差预测分析进一步表明,CENT的WHG成分显著高于基于遗传结构(PC1)的预期值(p<0.01),且该信号在女性中更强(OR=2.38)。
3. 染色体绘画揭示CENT富集WHG来源SNP
ChromoPainter分析显示,CENT组携带显著更多的WHG ancestry SNP(p=5.02e-05),而其他祖先成分无差异。
4. 促长寿SNP的WHG等位基因负荷更高
在15个独立促长寿SNP中,CENT组的WHG等位基因累积数量显著高于ITA(p=9.96e-04),提示WHG祖先可能通过特定遗传变异促进长寿。
结论与意义
本研究通过古基因组学视角,首次揭示WHG这一末次冰盛期后扩张的古老遗传成分,对当代意大利人群长寿具有显著贡献。该发现不仅解释了此前基于现代人群的百岁老人遗传结构重叠现象(如CENT与中/南部意大利人遗传相似性),更提示新石器时代后的炎症相关基因适应性进化(如APOEε4等位基因频率差异)可能对现代慢性病易感性产生负面影响。研究创新性地将长寿遗传学置于进化框架下,强调人口历史与自然选择共同塑造了群体特异性长寿机制,为精准医学中的祖先背景评估提供了理论支持。未来需扩大古基因组样本量与地理覆盖,进一步解析WHG相关通路(如免疫调节、代谢适应)在极端长寿中的具体作用。
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