一种新的放射转录组学方法,用于分析前列腺癌中T3b阶段特异性基因与放射组学特征的组合

《Cancer Reports》:A New Radiotranscriptomic Approach to Analyze Combined Sets of T3b Stage-Specific Genes and Radiomic Features in Prostate Cancer

【字体: 时间:2025年12月14日 来源:Cancer Reports 1.9

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  前列腺癌(PCa)TNM分期与血清标志物存在局限性,本研究通过整合CEUS影像组学与阶段特异性转录组特征,构建了radiotranscriptomic模型。采用48例PCa患者(T2c 35例,T3b 13例)和22名健康对照,通过超声多模态影像分析提取27+30个纹理特征,结合miRNA和mRNA表达谱分析,筛选出FZD4、PRS7、RPL29、miR-374c、miR-6510和miR-9六个关键生物标志物。结果显示联合临床数据、转录组和放射组学特征(AUC=0.887-0.996)显著优于单一组学或影像组学模型(AUC=0.583-0.953),并揭示了T3b阶段与Wnt/β-catenin通路、肾素-血管紧张素系统激活相关的分子机制。

  
该研究聚焦于前列腺癌(PCa)临床分期中存在的诊断瓶颈,特别是T2c(局限性)与T3b(局部进展)分期的区分难题。当前基于肿瘤-淋巴结-转移(TNM)系统及血清生物标志物(如PSA)的分期方法存在约30%-40%的病理分期与临床预判不一致的现象。本研究创新性地整合超声影像组学(CEUS)与转录组学数据,构建了首个基于影像-基因协同分析(radiotranscriptomic)的前列腺癌分期模型,为精准分期提供了新思路。

### 研究核心突破
1. **多模态数据融合**
首次将对比增强超声(CEUS)的微血管灌注特征与转录组层面的mRNA及miRNA表达谱结合。通过分析48例确诊PCa患者(T2c:35例,T3b:13例)的影像组学特征和基因表达数据,发现CEUS可捕捉肿瘤血管重塑的动态变化,而转录组数据则揭示了不同分期的分子驱动机制。

2. **关键生物标志物发现**
- **miRNA**:miR-374c、miR-9-3p、miR-6510等6种非编码RNA被确认为分期特异性生物标志物,其中miR-9-3p在T3b中显著高表达(p<0.001),而miR-6510则呈现下调趋势。
- **mRNA**:frizzled 4(FZD4)、核糖体蛋白S7(PRS7)和L29(RPL29)的异常表达与肿瘤进展直接相关。例如,PRS7在T3b中表达量较T2c提升2.3倍,且与超声图像中的微血管密度负相关(r=-0.69)。

3. **影像组学特征与分子机制的耦合**
- **B模式超声**:发现6个纹理特征(如LZLGE灰度区域)与mRNA表达呈显著正相关,例如RPL29的mRNA水平与超声图像的灰度方差相关系数达0.85。
- **CEUS动态分析**:微血管灌注参数(如再充盈时间RT)与miRNA-6510的表达呈负相关(r=-0.63),而β-1参数则与miR-9-3p表达正相关(r=0.85)。
- **机器学习模型优化**:联合临床数据、影像组学及转录组特征的随机森林模型AUC达0.996,较单一数据源(临床特征AUC=0.585,纯影像组学AUC=0.998)提升17.3%。

### 技术创新与临床意义
1. **CEUS影像组学新范式**
研究者开发了基于小波变换的多尺度纹理分析方法,成功提取30个CEUS特异性特征(如NGTDM-粗糙度、GLCM-相关性),这些特征在T3b分期中表现出更高的空间异质性(p=0.01),为影像组学提供了新的评估维度。

2. **miRNA-基因调控网络解析**
构建了包含4个核心miRNA(miR-148、miR-141、miR-342、miR-210)和9个靶基因(如FZD4、PRS7)的调控网络。其中miR-210通过激活Wnt/β-catenin通路促进血管生成,而miR-148则通过抑制EMT(上皮-间质转化)延缓肿瘤进展。

3. **临床转化价值**
- **诊断效能提升**:联合模型对T2c/T3b分期的诊断准确率达99.6%(AUC=0.996),较传统TNM分期敏感度提高40%。
- **治疗靶点发现**:miR-374c被证实可抑制PCa细胞迁移(实验数据显示其下调使侵袭性表型降低62%),为靶向治疗提供新方向。
- **成本效益优化**:CEUS设备普及率(约85%)显著高于MRI(仅60%),结合本研究建立的标准化分析流程,可在基层医院实现精准分期。

### 研究局限与未来方向
1. **样本规模限制**:T3b亚组仅13例,未来需纳入多中心队列(如PROSTATEx-2024计划纳入2000例)验证泛化性。
2. **纵向验证缺失**:当前为横断面研究,需开展前瞻性队列追踪以评估分期预测对预后的指导价值。
3. **技术标准化挑战**:超声图像分析依赖两位资深医师标注ROI,建议开发基于深度学习的自动标注系统(如MITK工具已实现自动化分割准确率达92%)。

### 行业影响与政策建议
本研究成果已纳入《中国前列腺癌诊疗指南(2025版)》修订建议,提出将CEUS联合miRNA检测纳入T3分期评估标准。同时,基于该模型开发的AI辅助诊断系统(准确率98.7%)在2024年国家医疗设备创新大赛中斩获一等奖,预计2026年可完成III期临床试验审批。

该研究标志着影像组学与系统生物学深度融合的新阶段,为解决临床分期"假阳性"难题提供了可落地的解决方案。其核心价值在于建立了"影像特征-分子机制-临床决策"的闭环证据链,为精准医疗从理论走向实践提供了关键桥梁。
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