巴西与亚洲牛种基因组选择印记的比较研究：揭示适应性进化的遗传基础

　　编辑推荐：来自巴西的研究团队利用XP-EHH、Rsb和Fst方法，在Nelore、Gir和Red Sindhi牛种中检测到62-72个选择印记(SS)基因，揭示了不同地理种群在生产力、耐热性、免疫等性状上的遗传分化，为热带牛种育种提供了分子靶点。

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　　基因组学与生物信息学的突破性进展，让科学家们能够解码牛种遗传结构，追踪选择压力塑造的基因组演化轨迹。这项研究聚焦巴西与亚洲大陆的Nelore、Gir和Red Sindhi三大牛种，通过跨群体扩展单倍型纯合度分析(XP-EHH)、位点特异性单倍型纯合度比值(Rsb)以及等位基因固定指数(Fst_ST)三大方法，在50-kb非滑动窗口框架下系统扫描选择印记(SS)。结果发现：Nelore(62个)、Gir(57个)和Red Sindhi(72个)品种的特异性选择基因中，既包含影响生产性能(如乳蛋白合成相关基因)和繁殖力(如卵泡发育调控因子)的关键靶点，也鉴定出调控耐热性(HSF⁴通路)、免疫应答(TLR家族)以及性情特质(5-HT受体)的适应性基因。特别值得注意的是，巴西种群在MC1R(被毛颜色)和ATP1A1(热应激响应)等位点上展现出显著选择信号，暗示热带环境压力驱动了独特的遗传适应。这些发现为理解人工选择如何重塑牛种基因组提供了分子证据，并为培育抗逆性强、高生产力的热带牛种奠定了理论基础。

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