转录组分析揭示循环肿瘤细胞特征:助力晚期前列腺癌精准诊疗

《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》:Transcriptional profiles of circulating tumor cells reflect heterogeneity and treatment resistance in advanced prostate cancer

【字体: 时间:2025年04月04日 来源:Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 11.4

编辑推荐:

  为解决前列腺癌(PC)治疗和监测中雄激素受体(AR)通路相关问题,尤其是新兴的侵袭性变异前列腺癌(AVPC)和治疗诱导的神经内分泌前列腺癌(NEPC)的诊断难题,研究人员开展对循环肿瘤细胞(CTC)转录谱的研究,结果显示可借此区分 PC 分子亚型,对监测晚期 PC 患者意义重大。

  前列腺癌(Prostate Cancer,PC)是男性常见的恶性肿瘤之一,在其治疗和监测过程中,雄激素受体(AR)信号通路起着关键作用。前列腺特异性抗原(Prostate Specific Antigen,PSA)作为常用的监测指标,在雄激素非依赖疾病中却并不可靠 。随着治疗的推进,如使用雄激素受体通路抑制剂(ARPI)治疗晚期 PC 时,会产生治疗诱导的 AR 非依赖性 PC,其中就包括侵袭性变异前列腺癌(AVPC)和神经内分泌前列腺癌(NEPC)。然而,在日常临床实践中,雄激素非依赖疾病进展的诊断往往滞后,仅依靠 PSA 监测难以满足需求,急需新的生物标志物来改善对 AVPC 和 NEPC 的诊断,避免无效治疗,为患者制定更合适的治疗策略。
在此背景下,德国汉堡埃彭多夫大学医学中心(University Medical Center Hamburg-Eppendorf)的研究人员开展了一项研究,旨在探索通过分析循环肿瘤细胞(Circulating Tumor Cells,CTCs)的转录谱来区分 PC 的分子亚型,进而为晚期 PC 患者的监测提供更有效的手段。该研究成果发表在《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》上。

研究人员为开展此项研究,主要运用了以下关键技术方法:

  1. 样本采集:前瞻性收集了 103 例转移性前列腺癌(mPC)患者的血液样本,并以年龄匹配的男性供者血液作为阴性对照。
  2. CTC 富集:采用 CellSearch 系统和 AdnaTest Prostate Cancer Select Kit 对 CTCs 进行富集。CellSearch 系统基于上皮细胞黏附分子(Epithelial Cell Adhesion Molecule,EPCAM)等标记进行检测,AdnaTest 则除了 EPCAM,还利用表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)和人表皮生长因子受体 2(Human Epidermal Growth Factor Receptor 2,HER2)进行 CTCs 富集,且 AdnaTest 可用于后续基因表达分析。
  3. 基因表达分析:通过半定量逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)分析选定的相关转录本,并在已发表的数据集和细胞系中进行验证。同时运用监督和无监督方法对患者样本的转录谱进行分析。

研究结果如下:

  1. CTCs 检测:利用 CellSearch 分析发现,NEPC 组和 AVPC 组的 CTC 阳性率和计数均显著高于转移性激素敏感性前列腺癌(mHSPC)组,且两者间无显著差异;DNPC 患者 CTC 均为阳性且计数高。比较 CellSearch 和 AdnaTest 两种方法,发现 AdnaTest 在检测低细胞数样本时更敏感12
  2. NEPC 检测标记物面板开发:经筛选确定了包含 13 个 NE 标记和 4 个与干性及治疗抵抗相关的标记物面板。在细胞系和已发表的转录组数据集中验证后,排除部分有非特异性信号的标记,最终 22 个标记用于后续分析。对比不同的 CTC 富集方法,发现基于 EPCAM 的 AdnaTest 在检测 NE 标记物时表现更优34
  3. 富集 CTCs 的基因表达分析:对 99 例样本的标记物面板基因表达进行测定,发现不同临床分组间多种基因表达存在显著差异。例如,AR 在 AVPC 组的表达显著高于 NEPC 组和 mHSPC 组;NEPC 组中,AR 靶基因和细胞周期调节因子表达下调,多个 NE 标记物表达上调。通过无监督聚类分析,基于基因表达谱确定了四个不同的分子簇,分别为 ARhigh簇、CTClow簇、纯 NEPC 簇和 amphicrine 簇,这些簇与临床分组相似56
  4. 基于 CTC 基因表达预测 NEPC:以阳性 NE 标记物数量作为指标,可在一定程度上区分 NEPC 与其他亚型。进一步利用随机森林模型训练分类器,能更准确地预测 NEPC 样本。在区分 NEPC 和 mHSPC 时,AUC 可达 95.5%;区分 NEPC 和 AVPC 时,AUC 为 88.2% 。不过,双阳性样本的分类准确性仍有待提高78
  5. 治疗诱导的 NEPC 病例的纵向 CTC 分析:对 1 例 mHSPC 转变为 NEPC 的患者进行纵向分析发现,在疾病进展过程中,CTC 计数和标记物表达发生变化,且与组织学染色结果一致,表明该检测方法对早期检测 NEPC 具有一定的适用性910

在研究结论和讨论部分,研究表明 CTC 计数在 AVPC 中显著高于 mHSPC,可作为 AVPC 检测标准的补充,但需结合分子分析。研究人员利用基因表达分析成功预测 NEPC 样本,且发现 KLK3 基因表达在 NEPC 患者的 CTCs 中显著降低,再次证明简单的 PSA 测量不适用于监测治疗诱导的 NEPC。研究还验证了基于 EPCAM 的 AdnaTest 在检测 NE 标记物方面的优势。

该研究的重要意义在于,揭示了 CTCs 转录谱在监测转移性前列腺癌患者中的价值,能够识别治疗相关的分子亚型,为早期检测治疗诱导的 NEPC 提供了可能,有助于临床医生及时发现对雄激素受体通路抑制剂的耐药情况,从而为患者分配更合适的替代治疗方案,在临床实践中具有重要的应用前景 。

下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究

10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!

欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书

单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析

下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》

相关新闻
    生物通微信公众号
    微信
    新浪微博

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号

    生物通精彩推荐 • 多发性骨髓瘤:从复杂病理到创新疗法的突破 ——2025 年研究新进展 • 综述:铁载体的分类、微生物摄取机制及其在医疗领域的应用