基于分子扩散与降维计算的空间转录组学阵列重建技术

　　编辑推荐：空间转录组学(ST)因成像限制难以大规模应用。研究人员开发了一种无需成像的计算方法，通过分子扩散模型和降维技术重构空间条形码位置，经真实成像数据验证具有高保真度，并可扩展至厘米级组织。该技术突破设备限制，为ST的高通量、可及性研究提供新范式。

　　空间转录组学(Spatial Transcriptomics, ST)能精确定位组织内基因表达，但传统技术受限于成像设备的通量和成本。这项研究提出了一种革命性的"无成像"策略——通过追踪分子扩散轨迹结合降维算法(如t-SNE/UMAP)，逆向推算出原始空间条形码的分布。实验证实，该计算重建方法与光学成像的"金标准"高度吻合，且成功应用于厘米级大样本，突破了传统ST的尺度限制。这项技术将加速器官发育、肿瘤微环境等研究，让实验室无需昂贵设备即可开展大规模空间组学分析。