基于蜕皮壳光谱分析的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)在节肢动物鉴定中的应用研究

《Biological Procedures Online》:Assessment of MALDI-TOF MS for Arthropod Identification Based on Exuviae Spectra Analysis

【字体: 时间:2025年04月06日 来源:Biological Procedures Online 3.7

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  目前节肢动物鉴定存在难题,传统形态学方法耗时且依赖专家,分子方法成本高、耗时长。为解决这些问题,研究人员开展基于节肢动物蜕皮壳的 MALDI-TOF MS 生物分型研究。结果显示该技术鉴定效率高,能克服传统方法局限,为节肢动物研究提供新途径。

  在奇妙的生物世界里,节肢动物可是个大家族,它们种类繁多、数量庞大,约占动物物种总数的 79%。其中一些节肢动物可不得了,像蚊子、蜱虫等,它们不仅会吸食血液,还担当着传播病原体的 “坏角色”,引发各种人类和动物疾病,给健康带来极大威胁。所以,准确识别这些节肢动物,把传播疾病的 “坏家伙” 和其他区分开来,就成了防控疾病的关键第一步。
一直以来,人们常用形态学方法来鉴别节肢动物,就是通过观察它们的外形特征来判断种类。但这方法问题不少,不仅花费时间长,还特别依赖那些经验丰富的昆虫学家,而且一旦节肢动物的身体有损伤,鉴别起来就更困难了。后来,分子鉴定方法出现了,它虽然精准可靠,不受发育阶段的影响,可也有自己的 “短板”,比如获取结果耗时久,试剂成本还特别高,这就限制了它的广泛应用。

有没有更好的办法呢?来自艾克斯 - 马赛大学(Aix Marseille Univ)等机构的研究人员决定一探究竟。他们开展了一项关于利用 MALDI-TOF MS 技术,基于节肢动物蜕皮壳光谱分析进行物种鉴定的研究。研究结果令人惊喜,MALDI-TOF MS 技术在鉴定节肢动物方面表现出色,能克服传统形态学和分子鉴定方法的诸多局限。这一成果发表在《Biological Procedures Online》上,为节肢动物的研究、疾病防控和害虫治理开辟了新的道路。

研究人员为了开展这项研究,用到了几个关键技术方法。首先是 DNA 提取和定量分析,从不同节肢动物的蜕皮壳和新鲜标本中提取 DNA 并进行定量;其次是 PCR 扩增,针对不同节肢动物家族,使用特定引物对线粒体细胞色素氧化酶亚基 I(COI)、核糖体 16 - 18S 亚基序列进行扩增;然后是 MALDI-TOF MS 分析,对样品进行处理后获取蛋白质质谱,并进行数据库比对分析 。

下面来看看具体的研究结果:

  • 节肢动物蜕皮壳的收集:研究中涉及的节肢动物蜕皮壳均来自实验室养殖的种群。由于缺乏针对蜕皮壳的分类检索表,无法通过形态学分析验证其身份。不同节肢动物蜕皮壳大小差异明显,蚊子、臭虫和虱子的蜕皮壳比锥蝽和蟑螂的小很多。为防止 DNA 和蛋白质降解,收集后迅速冷冻保存。
  • 节肢动物蜕皮壳的分子生物学分析:从 9 种节肢动物的蜕皮壳(每种 12 个)和新鲜标本(每种 5 个)中提取 DNA。结果发现,新鲜标本提取的 DNA 量显著高于蜕皮壳。在分子鉴定中,新鲜样本的 PCR 扩增成功率为 100%,而蜕皮壳样本仅 50%。测序成功的蜕皮壳样本更少,仅占 10.2%,这表明基于蜕皮壳的分子鉴定存在较大困难。
  • MALDI-TOF MS 分析
    • 样本制备条件优化:根据节肢动物家族不同,采用不同策略分析蜕皮壳。对蚊子、臭虫和虱子,分析整个蜕皮壳;对锥蝽和蟑螂,则分别分析腿部和胸部加头部的蜕皮壳,最终选定腿部进行后续分析,并确定了最佳的样本处理参数。
    • MS 光谱的重现性和特异性评估:对 342 个蜕皮壳样本进行 MALDI-TOF MS 分析,89.8% 的样本获得了高强度的 MS 光谱。通过多种分析方法证实,MS 光谱在种内具有重现性,种间具有特异性,同一科的物种光谱在聚类分析中也聚集在一起。
    • 基于蜕皮壳 MS 光谱的节肢动物物种鉴定评估:创建参考数据库后,对除数据库样本外的 MS 光谱进行查询,289 个光谱全部正确鉴定,且 85.8% 的样本 log 评分值(LSV)大于 1.8,表明鉴定可靠。不过,仍有部分样本的 LSV 未达到阈值。
    • 同一物种不同身体部位蜕皮壳 MS 光谱的相似性:对于大型蜕皮壳的物种,研究发现腿部和胸部加头部的蜕皮壳 MS 光谱虽有差异,但也有许多共享峰,即使使用仅含腿部光谱的数据库查询胸部加头部光谱,仍能正确鉴定所有物种,不过部分胸部加头部光谱的 LSV 未达阈值。


研究结论和讨论部分再次强调了该研究的重要意义。MALDI-TOF MS 生物分型技术可用于多种节肢动物家族的鉴定,基于蜕皮壳的分析具有种内重现性和种间特异性,能实现准确鉴定。这一技术克服了传统形态学鉴定因缺乏鉴定关键而难以实施,以及分子生物学因蜕皮壳 DNA 量低而面临的局限。然而,研究也指出,未来还需对野外收集的蜕皮壳进行评估,考虑蛋白质降解对 MS 谱的影响,以进一步验证该技术的可靠性。总之,这项研究为昆虫学研究、节肢动物疾病媒介监测和害虫管理提供了创新且有前景的方法。

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