lncRNAs 在癌症中的重要性日益凸显,为发现新的 AML 致癌基因提供机会,还可作为重要的预后和诊断生物标志物。其表达水平可预测 AML 临床特征和结果。RNA 测序等技术为研究癌症生物学提供了新视角,能深入了解基因组畸变、转录异构体等。新一代测序(NGS)技术特异性和敏感性高,可同时筛选多种癌症中的突变基因,提高实体瘤诊断特异性、预后价值和治疗靶向性。
多种 lncRNAs 在 AML 诊断和预后中具有重要作用。如启动子的 CDKN1A 反义 DNA 损伤激活 RNA(PANDAR)lncRNA 高表达与 AML 患者完全缓解(CR)率低和预后不良相关,可作为区分 AML 患者和健康个体的诊断生物标志物;HOTAIRM1 高表达与患者总生存期(OS)和无复发生存期降低相关;母系表达基因 3(MEG3)启动子高甲基化与患者 OS 显著降低有关;IGF1R 反义印记非编码 RNA(IRAIN)在 AML 患者中表达降低,可作为预后生物标志物;HOX 反义间插 RNA(HOTAIR)在诊断时高表达,治疗后表达降低,其治疗后表达水平与 OS、无复发生存期相关,可预测复发易感性。
lncRNAs 在 AML 中的作用
lncRNAs 在 AML 中的调控与失调
近年来多项综合表达研究表明,lncRNAs 在 AML 发展中起重要作用,其特定表达谱与 AML 遗传亚型相关,且在 AML 进展中影响众多关键信号通路,可形成具有独立预后能力的特征,用于对 AML 患者进行亚分类。白血病中 lncRNAs 功能多样,是增殖、分化、治疗耐药的关键调节因子,也是有前景的生物标志物和治疗靶点。
AML 中 lncRNA 水平失调由多种因素导致,包括遗传改变、染色体变化和表观遗传修饰。AML 细胞分化受阻与染色体易位和转录因子异常表达有关,lncRNAs 参与多种细胞功能,如影响 DNA 修复途径、维持基因组完整性和通过表观遗传改变调控癌基因和抑癌基因表达。因此,针对 lncRNAs 抑制 AML 细胞异常增殖是有前景的治疗方向。目前,AML 中 lncRNA 研究多为体外研究,对其失调的精确机制和生物学功能了解较少。
多种 lncRNAs 在 AML 中的具体作用
HOTAIRM1 主要在髓系细胞中表达,反义转录自 HOXA 簇,位于 HOXA1 和 HOXA2 基因之间。在正常情况下,其表达限于髓系细胞谱系。研究表明,HOTAIRM1 控制与髓系分化相关的基因表达,如 CD11b 和 CD18,沉默该基因会阻碍全反式维甲酸(ATRA)诱导的粒细胞分化。在 AML 患者中,HOTAIRM1 过表达与中等细胞遗传学风险相关,尤其是 NPM1 基因突变时。HOTAIRM1 在细胞核和细胞质中发挥不同功能,可促进 AML 细胞生长、抑制凋亡,与患者不良预后相关,是潜在的治疗靶点。
尿路上皮癌相关 1(UCA1)lncRNA 可调节 AML 细胞增殖,在体外实验中,它增强细胞活力、迁移和侵袭能力,抑制凋亡途径,在 AML 患者样本中表达升高,通过靶向 miR - 126 激活磷脂酰肌醇 3 - 激酶(PI3K)/ 蛋白激酶 B(AKT)信号通路,促进 AML 细胞增殖,与多种 miRNAs 相互作用,显示其致癌潜力。
核旁斑组装转录本 1(NEAT1)影响 AML 细胞分化,在细胞培养研究中,其下调可被 ATRA 治疗逆转。NEAT1 过表达可诱导原发性 AML 母细胞和 THP - 1 细胞凋亡,抑制增殖。它通过与 miR - 23a - 3p 竞争性结合,调节染色体结构维持蛋白 1α(SMC1A)表达,抑制细胞周期,促进凋亡,还可通过 NEAT1/miR - 338 - 3p 轴抑制 AML 进展,其下调与 AML 发展相关,为治疗提供新靶点。
MEG3 在 AML 中起肿瘤抑制作用,成人初发 AML 患者中 MEG3 高表达与 DFS 和 OS 延长相关,儿童新诊断 AML 患者中其高表达与 OS 增加有关,诱导治疗后 MEG3 高表达与患者 DFS 和 OS 改善相关,可作为预测 AML 患者治疗反应的功能性生物标志物。MEG3 可刺激 p53 转录,还通过下调 DNMT3A 基因抑制白血病发生,其在 AML 耐药中的作用与 MEG3/miR - 155 轴有关。
IRAIN 是源自胰岛素样生长因子 I 型受体(IGF1R)内含子的反义非编码 RNA,白血病细胞中 IRAIN 激活可增强细胞增殖和治疗耐药性,AML 患者中 IRAIN 低表达预后不良,其过表达可抑制肿瘤细胞迁移。
HOTAIR 在多种 AML 细胞系中高表达,体外沉默 HOTAIR 可减少细胞增殖、诱导凋亡和抑制集落形成。它作为多层调节因子和 miRNA 海绵,与 miR - 193a 竞争性结合,影响 c - KIT 表达,还可通过诱导 p15INK4b 启动子的 H3K27 三甲基化抑制其表达,吸引 DNMT3B 增加 HOXA5 启动子甲基化,促进肿瘤发生,沉默 HOTAIR 可在体内诱导 AML 细胞凋亡和抑制增殖。
INK4 位点的反义非编码 RNA(ANRIL)在 AML 和其他恶性肿瘤中表达增加,通过抑制脂联素受体 1(AdipoR1)促进 AML 细胞葡萄糖摄取,还可作为 miR - 34 的海绵,破坏其对组蛋白去乙酰化酶 1(HDAC1)的调节,抑制凋亡,促进细胞增殖,在 AML 患者中其表达水平高于健康供者,与 CR 率降低相关。
H19 在恶性和正常造血中均有研究,在造血和 AML 中,它作为 miR - 19a - 3p 和 miR - 29a - 3p 的支架,AML 患者中 H19 高表达与 OS 降低和 CR 率降低相关,敲低 H19 可增加 AML 细胞系凋亡,减少增殖。
结直肠癌差异表达(CRNDE)lncRNA 可控制 AML 细胞生长和分化,在 U937 细胞系和 KG - 1a 细胞中发挥致癌作用,通过调节 miR - 136 - 5p 促进细胞增殖。
结肠癌相关转录本 - 1(CCAT1)是 AML 的 miRNA 海绵,可调节 AML 细胞发育和分化,抑制单核细胞分化,促进 AML 来源的 HL60 细胞增殖,通过降低 miR - 155 水平增加 c - MYC 表达。
癌症易感性候选 15(CASC15)在 AML 患者中表达较高,其增加会导致骨髓中髓系细胞比例增加,降低植入效率,阻碍集落形成,在 RUNX1 异常的 AML 患者中表达更高。
卷曲螺旋结构域包含 26(CCDC26)lncRNA 在诊断和复发时表达升高,与年龄、贫血、风险分层和缓解状态相关,高表达患者 OS 降低,可作为风险分层的分子生物标志物。它通过控制 c - KIT 酪氨酸激酶受体表达发挥致癌作用,抑制 CCDC26 可能使白血病细胞在无足够生长因子时存活和增殖,且可能导致 AML 细胞对 ATRA 等抗癌药物产生耐药性。
牛磺酸上调基因 1(TUG1)在 AML 中上调,与多种临床和分子特征相关,可作为预后不良的分子指标,与白细胞计数升高呈正相关。TUG1 作为 miR - 221 - 3p 的诱饵,促进细胞活力,抑制凋亡,AML 患者中 TUG1 高表达与 OS 降低、CR 率降低和总体反应降低相关,在体外过表达可增加细胞增殖,减少凋亡。
多种 lncRNAs 参与 AML 治疗耐药过程。TUG1 在 AML 细胞有氧糖酵解级联中起作用,通过促进 AKT 信号通路促进肿瘤生长,还可通过促进 miR - 34a 的表观遗传抑制增强对阿霉素(ADR)的耐药性,抑制 TUG1 可增加 ADR 耐药的 HL60 细胞对 ADR 的敏感性。
HOTAIRM1 可使 AML 细胞对多种药物产生耐药性,在糖皮质激素耐药的 AML 细胞和预后不良的患者中表达增加,通过影响 Wnt β - 连环蛋白通路增强对阿糖胞苷(Ara - C)的耐药性,降低其水平可增加 AML 细胞系在 Ara - C 处理后的凋亡率,抑制糖酵解和 Wnt/β - 连环蛋白信号通路。
长链间区非编码 RNA 239(LINC00239)在 AML 患者中上调,通过激活 PI3K/AKT/ 哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)轴促进化疗耐药,抑制阿霉素诱导的细胞凋亡,降低 ADR 在 KG - 1 和 HL - 60 白血病细胞系中的疗效。
UCA1 参与促进化疗耐药,在 Ara - C 和阿霉素治疗后的 AML 患者样本中表达升高,过表达可导致 AML 细胞系对阿霉素耐药,敲低 UCA1 可通过上调 miRNA - 125a 增强化疗敏感性,抑制糖酵解,恢复 ADR 耐药 AML 细胞对化疗的反应性。
沉默 KCNQ1OT1 可减少 ADR 耐药 AML 细胞的增殖、迁移和侵袭,促进 ADR 耐药的 HL - 60 和 K562 AML 细胞系凋亡。
XIST 可促进 AML 对阿霉素的耐药性,它作为 miR - 29a 的支架,减轻对癌基因 MYC 的抑制,敲低 XIST 可增加 AML 细胞系 KG - 1 对阿霉素的敏感性,通过抑制 MYC 促进凋亡。
HOTAIR 高表达与抗白血病药物(阿霉素、伊马替尼)耐药相关,可通过上调 DNMT3b 抑制 PTEN,赋予 AML 细胞对阿霉素的耐药性,参与白血病细胞多药耐药进展,下调 HOTAIR 可能是克服白血病细胞化疗耐药的途径。
MALAT1 在白血病治疗耐药发展中起重要作用,与 AML 中 Ara - C 耐药有关,临床研究表明其表达与 miR - 96 水平呈负相关,抑制 MALAT1 可增强 Ara - C 在 AML 细胞中的疗效,但其促进 Ara - C 耐药的机制尚待阐明。