石油污染土壤中生物表面活性剂产生菌Rhodococcus sp. IITD102、Lysinibacillus sp. IITD104和Paenibacillus sp. IITD108的基因组测序及功能解析

　　来自印度的研究人员针对石油污染修复难题，对三株以沥青烯为碳源的生物表面活性剂产生菌（Rhodococcus sp. IITD102、Lysinibacillus sp. IITD104和Paenibacillus sp. IITD108）进行基因组测序。研究揭示了其合成糖脂类生物表面活性剂的关键基因（如rhamnosyltransferase）及芳香烃降解通路（如catechol 2,3-dioxygenase），为微生物强化采油(EOR)和环境污染治理提供分子基础。

　　

在印度法里达巴德（28.40°N, 77.31°E）的石油污染土壤中，科学家们分离出三株"环境清道夫"——Rhodococcus sp. IITD102、Lysinibacillus sp. IITD104和Paenibacillus sp. IITD108。这些微生物能以沥青烯为"美食"，在含2.5 g/L沥青烯的MSM培养基（成分为Na₂
HPO₄
0.2 g/L、MgCl₂
0.040 g/L等）中茁壮成长。

基因组测序大揭秘显示，IITD102和IITD104能生产双鼠李糖基羟基癸酸(di-rhamnopyranosic hydroxydecanoic acid)，而IITD108则合成3-O-(2-O-[2E-decanoyl]-αL rhamnopyranosyl)-3-hydroxydecanoic acid。通过Illumina HiSeq 4000平台测序，研究者发现这些菌株的基因组藏着"宝藏"：IITD102携带鼠李糖基转移酶(rhamnosyltransferase)基因，IITD108则有葡萄糖基转移酶(glucosyltransferases)基因。更令人兴奋的是，所有菌株都配备"环境净化工具包"——编码烷烃单加氧酶(alkane monooxygenase)、苯1,2-双加氧酶(benzene 1,2-dioxygenase)等降解酶的基因。

表1数据亮眼：Rhodococcus sp. IITD102基因组达5.96 Mb，GC含量高达70.5%；Lysinibacillus sp. IITD104与近缘菌株相似度达98.58%。这些发现为开发"微生物油田工人"（用于EOR）和污染场地修复提供了精准的基因蓝图。