葡萄牙COVID-19大流行期间成人肺炎链球菌携带研究：广谱PCVs覆盖血清型及3型的主导性

　　这篇研究揭示了葡萄牙COVID-19大流行期间成人肺炎链球菌（S. pneumoniae）携带的流行病学特征，通过分子检测发现6.9%的携带率，其中非PCV13血清型（如10A、23B、33A/F/37）占主导。研究强调了儿童接触（OR=2.73）和性别差异（男性风险降低54%）对携带的影响，并评估了新型疫苗（PCV20/PCV21）的潜在覆盖率（40%-64%），为成人免疫策略提供了关键数据。

　　

ABSTRACT
肺炎链球菌（S. pneumoniae）是全球范围内引发感染的重要病原体，尤其在婴幼儿和老年人中致病率较高。本研究通过分子方法评估了葡萄牙COVID-19大流行期间成人携带率，发现其高于既往培养法估计值（6.9% vs 1-10%），并揭示了血清型分布及风险因素。

INTRODUCTION
肺炎链球菌是上呼吸道常见定植菌，可导致中耳炎、肺炎和脑膜炎等疾病。葡萄牙自2015年起将PCV13纳入国家儿童免疫计划，2024年升级为PCV20。成人携带率传统认为较低，但分子检测显示其实际可能更高，尤其在多微生物环境的口咽样本中。

RESULTS
Characteristics of the population
研究纳入3,574名≥18岁成年人（平均年龄43.8岁，79.4%为女性），58.3%有儿童接触史。仅2.5%接种过肺炎球菌疫苗。

Pneumococcal carriage
通过qPCR检测lytA和piaB基因，发现口咽样本携带率显著高于鼻咽样本（5.3% vs 3.7%, P<0.001）。联合采样使检出率提升1.3-1.9倍。鼻咽样本中细菌密度更高（Ct值更低）。

Molecular detection of S. pneumoniae serotypes
共鉴定26种血清型，最常见为非分型（NT, 8.6%）、10A（7.3%）、23B（7.3%）和3型（6.9%）。PCV13血清型仅占13.5%，其中3型占半数以上。PCV20和PCV21覆盖率分别为40.0%和64.1%。值得注意的是，4型仅检出1例，与欧洲其他地区流行趋势不同。

Risk factors for pneumococcal carriage
多变量分析显示，儿童接触使携带风险增加2.73倍（95% CI 2.01-3.75），男性风险降低54%（OR=0.46）。嗅觉/味觉丧失症状与携带显著相关（OR=9.98），但该结果受稀疏数据偏差影响。

DISCUSSION
研究首次在COVID-19限制措施背景下揭示葡萄牙成人携带特征。低携带率可能与非药物干预（如口罩令）相关。血清型3的高流行与其在侵袭性疾病中的占比（15-17%）一致。PCV21对本地流行株的潜在高覆盖率支持其在成人免疫中的应用价值。

MATERIALS AND METHODS
采用前瞻性设计，采集配对的鼻咽/口咽样本。通过qPCR检测lytA/piaB/SP2020基因，并对66种血清型进行分子分型。采用贝叶斯自适应抽样优化风险因素分析。

创新点

1. 开发了针对4型和24B/F血清型的新引物
2. 首次在葡萄牙大流行背景下评估成人携带动态
3. 揭示PCV21对非PCV13血清型的广谱覆盖潜力

局限性

1. convenience样本可能缺乏代表性
2. inactivation medium限制菌株培养后续分析
3. 部分血清型因交叉反应性被排除（如5型）

该研究为成人肺炎球菌传播链的再认识提供了分子流行病学证据，强调需将成人纳入群体免疫监测体系，并为新型疫苗政策制定提供数据支持。