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杨树皮蚜专性内共生菌Buchnera aphidicola全基因组测序揭示其营养共生机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月11日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7
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来自中国科学院动物研究所的研究团队利用Illumina NovaSeq X Plus平台,完成了杨树皮蚜(Pterocomma populeum)专性内共生菌Buchnera aphidicola的全基因组测序。该研究成功组装出588,150 bp的环形染色体,GC含量24%,包含578个基因,为蚜虫-内共生菌营养共生机制研究提供了重要数据支撑。
科学家们成功破译了杨树皮蚜(Pterocomma populeum)体内专性内共生菌Buchnera aphidicola的完整基因组图谱。这项研究采用Illumina NovaSeq X Plus测序平台,从新疆阿勒泰地区采集的蚜虫样本中提取DNA,通过SPAdes软件组装获得588,150 bp的环形染色体序列,GC含量仅为24%。
这个微小却至关重要的内共生菌基因组包含578个功能元件:531个蛋白编码基因、31个转运RNA(tRNA)、3个核糖体RNA(rRNA)以及3个非编码RNA(ncRNA)。作为蚜虫的"营养工厂",B. aphidicola能够合成宿主无法从植物汁液中获取的必需氨基酸,这种共生关系使得蚜虫能够在营养失衡的韧皮部汁液中繁衍生息。
研究团队采用先进的基因组分析技术链:使用MUMmer进行参考基因组比对,Pilon进行序列校正,最终获得覆盖度达292.16×的高质量基因组。CheckM评估显示组装完整度达96.55%,NCBI原核基因组注释管道成功识别出所有功能元件。
这项成果为理解昆虫-微生物共生系统的协同进化提供了新的分子线索,特别是揭示了蚜虫如何通过内共生菌补偿其单一食性造成的营养缺陷。基因组数据将助力开发新型蚜虫防控策略,通过靶向共生系统这一"阿喀琉斯之踵"来实现害虫治理。
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