稗草生防真菌稗属炭疽菌(Colletotrichum echinochloae) B-48的生物学特性及基因组测序分析

　　 摘要: 【背景】稗草生防真菌稗属炭疽菌(Colletotrichum echinochloae) B-48是从水稻田自然发病的稗草上分离鉴定得到的，前期研究发现该菌株对稗草具有良好的生防效果，对主要作物如水稻、小麦、玉米等具有良好的安全性

　　 摘要:

【背景】稗草生防真菌稗属炭疽菌(Colletotrichum echinochloae) B-48是从水稻田自然发病的稗草上分离鉴定得到的，前期研究发现该菌株对稗草具有良好的生防效果，对主要作物如水稻、小麦、玉米等具有良好的安全性。【目的】研究稗草生防真菌B-48的最佳生长和产孢的培养基、生长温度、pH、光照条件、碳氮源等生物学特性，以便优化该菌株的培养和应用条件。解析该生防菌株的基因组序列信息，挖掘其次级代谢产物基因资源，为深入研究该菌株的除草活性天然产物及天然产物的生物合成机制奠定基础。【方法】对稗草生防真菌B-48的生长最适培养基、温度、pH、光照、生长碳氮源及致死温度等生物学特性进行研究。利用Nanopore及Illumina测序平台对稗草病原真菌B-48进行全基因组测序，采用相关软件进行菌株基因组序列拼接、基因组结构预测，以及基因组功能注释、并预测其次级代谢产物合成基因簇。【结果】稗草生防真菌B-48在马铃薯蔗糖琼脂(potato sucrose agar, PSA)培养基上生长产孢良好，最适生长温度为30 ℃，最适生长pH 7.0，最适光照条件为持续光照，最适碳氮源分别为淀粉和酵母浸粉，致死条件为55 ℃、10 min。全基因组序列结果显示该菌株基因组大小为62.25 Mb，G+C含量46.59%，预测到蛋白质编码基因11 324个，预测到次级代谢产物生物合成基因簇76个。【结论】稗属炭疽菌B-48具有开发为稗草生物除草剂的潜力，其次级代谢产物生物合成基因簇预示着其具有合成除草活性天然产物的潜力。以上结果为该菌后续发酵培养、次级代谢生物合成研究及实际应用奠定了理论基础。