高粱TGA基因响应孢堆黑粉菌（Sporisorium reilianum）侵染表达和DNA变异分析

　　 摘要： 目的 TGA基因亚家族是bZIP转录因子家族中十分重要的成员

　　

摘要：

目的 TGA基因亚家族是bZIP转录因子家族中十分重要的成员。鉴定高粱基因组TGA基因家族成员，进行基因表达和自然等位变异分析，筛选出响应孢堆黑粉菌侵染的TGA基因和顺式作用元件。 方法 在高粱全基因组鉴定SbTGAs基因家族成员，并进行染色体定位、基因结构、蛋白理化性质、进化关系、顺式作用元件和共线性分析，分析在丝黑穗病菌侵染下SbTGAs的转录表达特性，检测在高粱种质自然群体的DNA变异。 结果 高粱基因组中共有17个SbTGAs家族成员，均含有DOG1结构域，多数有bZIP结构域，定位于细胞核，大部分的SbTGA基因内含子数量为3?12，聚类分析表明，高粱TGA基因家族基因可分为5个亚族。玉米与高粱15个TGA基因存在共线性，亲缘关系更近。基因表达分析表明，SbTGA2.1b在高粱的根和叶中显著表达，丝黑穗病菌侵染后，SbTGA2.1b的表达在抗、感丝黑穗病品系显著诱导； SbTGA2.2、SbTGA5和SbTGA6.6g的表达在感病株受抑制；在高粱种质检测到SbTGA2.1a和SbTGA6.6g等5个基因多个非同义SNP变异和插入缺失（INDEL）变异。 结论 SbTGA2.1b等响应孢堆黑粉菌侵染，存在非同义SNP变异和INDEL变异高粱种质，为高粱抗丝黑穗病的分子育种提供依据。