瞬态阴离子激发态在嘧啶DNA亚基捕获过量电子中的作用机制研究

【字体: 时间:2025年06月11日 来源:Computational and Theoretical Chemistry 3.0

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  本研究针对高能辐射诱导DNA损伤的核心问题,通过CASSCF/CASPT2方法系统探究了气/液相嘧啶DNA亚基(核碱基、核苷、核苷酸)捕获过量电子形成瞬态阴离子(TAs)的机制。发现液相垂直电子亲和能(VEAs)较气相提升1.05–4.04 eV,揭示糖环、磷酸基团及抗衡离子对电子捕获能力的调控作用,首次阐明激发态TAs通过形状共振(shape resonance)和核心激发共振(core-excited resonance)的混合模式参与DNA损伤,为辐射防护提供新靶点。

  

高能辐射与生物体的相互作用会引发细胞DNA损伤,这一过程被公认为癌症放疗副作用和辐射暴露危害的核心机制。当辐射能量作用于生物介质时,会产生大量次级电子(SEs),其中0-20 eV的低能电子(LEEs)可通过附着DNA形成瞬态阴离子(transient anions, TAs)。这些不稳定的中间体通过解离电子附着(dissociative electron attachment, DEA)引发单链断裂(SSBs)甚至双链断裂(DSBs),但关于激发态TAs的具体作用机制仍存在认知空白。尤其值得注意的是,实验观察到DNA损伤可能源自更高能级的激发态TAs,而传统研究多聚焦于基态TAs,这使得理论预测与实验现象间存在显著鸿沟。

针对这一挑战,中国的研究团队在《Computational and Theoretical Chemistry》发表了突破性研究。通过多尺度计算化学方法,首次系统阐明了嘧啶DNA亚基(包括核碱基、核苷及核苷酸)在气/液相环境中捕获过量电子形成激发态TAs的规律。研究发现:1)液相环境使垂直电子亲和能(vertical electron affinities, VEAs)显著提升1.05-4.04 eV;2)糖环骨架和磷酸基团通过空间位阻效应调控电子捕获效率;3)抗衡离子(如dCMPH/dTMPH)可稳定阴离子态;4)第二、三激发态TAs存在形状共振与核心激发共振的混合模式。这些发现为解释实验观测到的"高能TA致DNA损伤"现象提供了理论依据。

关键技术方法
研究采用多参考态CASSCF/CASPT2(完全活性空间自洽场/二阶扰动理论)方法计算四种最低电子态VEAs,通过6-31+G(d)、aug-cc-pVDZ等基组验证计算精度。液相模拟结合极化连续介质模型(PCM),分析溶剂化效应对电子亲和能的影响。对比体系涵盖8种分子:胞嘧啶(C)、脱氧胞苷(dC)、脱氧胞苷单磷酸(dCMP?
)、质子化dCMPH,以及对应胸腺嘧啶衍生物(T/dT/dTMP?
/dTMPH)。

研究结果

Computational details
通过定义VEA = Enatural
? ETA
的能量差公式,量化电子捕获能力。气相计算显示def2-TZVPD基组的RMSE最低(0.12 eV),与实验值吻合最佳。

Results and discussion

  1. 环境效应:液相VEAs较气相显著提升,如dTMP?
    的基态VEA从-0.29 eV升至0.15 eV,证实溶剂化稳定TA的作用;
  2. 结构修饰影响:糖环使胞嘧啶π*轨道能级下降0.8 eV,磷酸基团进一步降低0.5 eV,揭示骨架结构对电子捕获的协同调控;
  3. 共振类型:基态和第一激发态为纯形状共振,第二激发态(2.5-3.5 eV)出现形状/核心激发混合共振,第三激发态(>4 eV)则完全由核心激发共振主导;
  4. 损伤机制:高能TA(>3 eV)通过N–C键断裂和糖环开环引发链断裂,与实验观测的DSBs损伤谱一致。

结论与意义
该研究首次建立了从电子捕获到DNA损伤的完整理论框架:1)证实激发态TAs在辐射损伤中的关键作用;2)揭示溶剂环境通过极化效应(QM/MM计算显示液相PES能面更陡)加速DEA进程;3)提出"高能TA阈值"概念(>3 eV核心激发共振),为靶向辐射防护剂设计提供新思路。研究成果不仅解决了气相计算与液相实验数据的长期矛盾,更将TA研究维度从基态拓展到激发态,对理解放射治疗中的DNA损伤机制具有重要指导价值。

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