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circRNA表达谱揭示精神分裂症发病新机制:全转录组测序鉴定潜在诊断标志物
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月16日 来源:European Journal of Medical Research 2.8
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本研究针对精神分裂症(SCZ)缺乏客观诊断指标的问题,通过全转录组测序分析5对SCZ患者与健康对照的外周血样本,鉴定出589个差异表达circRNA(DEcircRNA),构建ceRNA和RBP互作网络,发现hsa_circ_0006157等3个circRNA显著上调且具有诊断价值(AUC=0.715),为SCZ的分子机制和早期诊断提供了新视角。
精神分裂症(Schizophrenia, SCZ)作为一种严重的慢性精神障碍,影响着全球数百万人群,其诊断至今仍依赖主观临床表现,缺乏可靠的生物标志物。这种现状导致诊断可靠性低、干预延迟,而患者伴随的高自杀风险和代谢并发症更凸显了早期诊断的紧迫性。近年来,环状RNA(circular RNA, circRNA)因其独特的闭环结构和高度稳定性,在神经精神疾病领域展现出巨大潜力,但circRNA在SCZ中的具体作用机制仍存在显著知识空白。
为解决这一关键问题,广西医科大学公共卫生学院流行病学与生物统计学系的研究团队开展了一项开创性研究。他们通过全转录组测序技术,首次系统分析了SCZ患者外周血单个核细胞(PBMCs)中circRNA的表达特征,相关成果发表在《European Journal of Medical Research》。研究人员采用5对SCZ患者与匹配对照的外周血样本进行全转录组测序,通过CIRIquant鉴定circRNA,利用edgeR进行差异分析,并构建ceRNA和蛋白互作网络。qRT-PCR在40对样本中验证关键circRNA的表达,ROC曲线评估诊断效能。
研究共检测到38,699个circRNA,其中589个存在显著差异表达(375个上调,214个下调)。染色体分布显示多数DEcircRNA位于1号染色体。
GO分析表明DEcircRNA宿主基因富集于大分子修饰、细胞器组织等生物过程;KEGG分析揭示TNF、Wnt和神经营养因子等信号通路异常。PPI网络识别出PTEN、EP300等20个枢纽基因。
成功构建包含252个DEcircRNA、297个miRNA和1,075个mRNA的调控网络,其靶基因同样参与Wnt、AMPK等关键通路。
qRT-PCR证实hsa_circ_0006157、hsa_circ_0071422和hsa_circ_0071095在SCZ患者中显著上调(P<0.05),其中hsa_circ_0071422的AUC达0.715。
预测到27个RNA结合蛋白与验证circRNA存在相互作用,DDX54和RBM15B被鉴定为关键调控因子。
该研究首次系统描绘了SCZ外周血circRNA表达图谱,发现hsa_circ_0006157等3个circRNA具有诊断潜力,其宿主基因RIC
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