基于不对称重组酶聚合扩增与多组分DNAzyme辅助靶标循环生物传感器(OAR-MNA)的超灵敏检疫病原体现场检测技术

【字体: 时间:2025年08月16日 来源:Plant Biotechnology Journal 10.5

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  这篇研究开发了一种创新的OAR-MNA生物传感器,通过不对称RPA(aRPA)与多组分DNAzyme(MNAzyme)联用,实现了对瓜类细菌性果斑病病原体(Acidovorax citrulli)的现场检测。该系统灵敏度达20拷贝/μL,成本较荧光RPA降低50%,且与便携式DNA分析仪兼容,为植物检疫提供了高特异性、低成本的解决方案。

  

1 引言

检疫病原体如瓜类细菌性果斑病(BFB)病原体Acidovorax citrulli对全球农业构成严重威胁。现有检测技术如PCR和ELISA依赖复杂设备,而等温扩增技术(如RPA)虽快速但存在假阳性风险。多组分DNAzyme(MNAzyme)因其低成本和高催化效率成为理想检测工具,但其依赖单链DNA(ssDNA)的特性与RPA产生双链DNA(dsDNA)的矛盾亟待解决。

2 材料与方法

研究团队开发了OAR-MNA生物传感器,通过优化不对称RPA(aRPA)引物比例(10,000 nM正向引物:31.25 nM反向引物)高效生成ssDNA。MNAzyme系统包含分裂催化域的partzymes和含RNA切割位点的荧光淬灭(FQ)探针。便携式DNA分析仪集成480 nm激光模块,可实现"+/?"结果输出。

3 结果与讨论

3.1 技术原理

aRPA通过限制反向引物产生过量ssDNA,激活MNAzyme切割FQ探针释放荧光信号(图1)。该系统在41°C、80 mM Mg2+条件下性能最优,检测限达20拷贝/μL。

3.2 性能验证

凝胶电泳显示320:1引物比例时ssDNA产量最大(图2)。与荧光RPA相比,OAR-MNA特异性100%,且能区分近缘种A. avenae subsp. avenae(图4)。在22份西瓜种子样本中与qPCR结果完全一致(图5)。

3.3 扩展应用

通过替换RT-RPA,该系统成功检测RNA病毒黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV),验证了平台普适性(图S24-S26)。

3.4 现场适配性

自主研发的便携分析仪(74×74×76 mm)整合温控与荧光检测模块,成本降至2.16美元/测试,较传统方法降低50%(图6)。

4 结论

OAR-MNA突破了ssDNA生成的技术瓶颈,实现闭管检测且无需复杂设备。未来将通过多重检测和免提取优化进一步提升实用性,为农业生物安全提供创新解决方案。

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