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基于药代动力学相关基因构建胃癌新型预后模型及综合预后分析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月16日 来源:Frontiers in Genetics 2.8
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本研究基于药代动力学(ADME)相关基因(ADMERGs)构建并验证了胃癌(GC)新型预后模型,揭示了UGT1A1、ADH4等5个关键基因通过调控免疫微环境(如肥大细胞、浆细胞样树突状细胞浸润差异)和化疗响应(如DMOG/VX.702敏感性)影响患者预后,为GC精准治疗提供分子标志物和代谢-免疫联合治疗新策略。
胃癌(GC)作为全球第五大常见癌症,其异质性临床特征和化疗耐药问题亟待解决。药代动力学(ADME)相关基因(ADMERGs)在药物代谢和肿瘤微环境调控中具有双重作用,但其在GC中的机制尚未明确。
研究整合TCGA-GC和GEO数据集(GSE62254等),通过差异表达分析筛选1,492个差异基因(DEGs),与298个ADMERGs取交集获得59个候选基因。采用单变量Cox回归和LASSO算法构建5基因(UGT1A1、ADH4、ADH1B、CYP19A1、GPX3)预后模型,并通过风险评分将患者分层。结合ssGSEA、TIDE评分和单细胞测序(scRNA-seq)解析免疫浸润特征和细胞异质性,RT-qPCR验证基因表达。
模型验证:高风险组总生存期显著缩短(P<0.005),模型AUC达0.64-0.77。Nomogram整合风险评分与临床分期后预测效能提升(校准曲线斜率接近1)。
免疫特征:高风险组肥大细胞(P<0.05)和浆细胞样树突状细胞浸润增加,伴随CD274(PD-L1)、CTLA4等免疫检查点上调。UGT1A1与PD-L1呈显著负相关(R=-0.42),提示其可能通过PD-1/PD-L1通路调控免疫逃逸。
治疗响应:低风险组对QS11(AGAP1抑制剂)敏感,高风险组更响应VX.702(p38 MAPK抑制剂)。TIDE评分显示高风险组免疫治疗耐药性更强(P<0.01)。
单细胞解析:scRNA-seq揭示ADH1B和GPX3在基质细胞中高表达,而肿瘤组织中ADH1B表达降低2.3倍(P<0.001),可能通过乙醇代谢产物积累促进DNA损伤。
ceRNA调控:高风险组特异性上调的miR-590和lncRNA MIR100HG构成ceRNA网络,可能通过靶向ADH4促进GC进展。
基因功能:
UGT1A1:解毒功能缺失导致致癌物积累,与HER2阳性显著相关(R=0.38)
ADH4/ADH1B:乙醇代谢紊乱诱发胃黏膜屏障破坏,但ADH4在肿瘤组织中未显著下调,提示表观调控参与
GPX3:启动子甲基化致抗氧化能力下降,与CD8+ T细胞浸润正相关(R=0.51)
临床转化:模型联合M分期可识别转移倾向患者(M1期风险评分升高1.8倍)。RT-qPCR验证除ADH4外所有基因在肿瘤组织中表达下调,与TCGA数据趋势一致。
样本量限制(临床验证仅5对样本)可能影响稳定性。未来需通过类器官模型验证CYP19A1在雌激素信号通路中的作用,并探索ADMERGs与免疫治疗响应的动态关联。
该研究首次建立ADMERGs相关GC预后模型,揭示代谢-免疫串扰机制。UGT1A1和GPX3等基因可作为"代谢免疫节点",为联合靶向治疗提供新思路。
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