整合转录组与单细胞测序揭示脑出血中RNA修饰关键标志物Ybx1/Igf2bp2的调控机制

【字体: 时间:2025年09月16日 来源:Genome Instability & Disease

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  研究人员通过整合单细胞与转录组数据,首次系统探究脑出血(ICH)中RNA修饰相关基因(RMRGs)的生物标志物。研究发现Ybx1/Igf2bp2在ICH样本中显著上调,其人类同源基因YBX1/IGF2BP2分别富集于非经典单核细胞和髓系树突细胞,并关联突触信号通路。该研究为ICH防治提供了新靶点,预测3-丁烯基苯酞等药物潜力。

  

这项开创性研究采用多组学整合策略,首次绘制了脑出血(Intracerebral Hemorrhage, ICH)中RNA修饰(RNA Modification, RM)的动态图谱。通过分析GSE216607和GSE206971数据集,研究者从数千个基因中锁定两个关键调控因子——冷休克蛋白Ybx1和胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白Igf2bp2。

生物信息学深度挖掘显示,这两个分子在ICH模型中呈现显著上调趋势。有趣的是,它们的表达模式各具特色:Ybx1在疾病不同阶段呈现"波浪式"波动,尤其在微glia1和单核细胞中表现活跃;而Igf2bp2则保持"稳如磐石"的表达特性。通过蛋白互作网络(Protein-Protein Interaction, PPI)分析,研究者发现这些标志物深度参与神经元突触信号传导和翻译调控通路。

研究团队成功将小鼠基因对应到人类同源基因YBX1和IGF2BP2,并绘制出精确的免疫细胞表达图谱。数据显示,YBX1在非经典单核细胞中"独占鳌头",而IGF2BP2则偏爱髓系树突细胞。更令人振奋的是,通过计算药物预测,3-丁烯基苯酞(3-butylidenephthalide)、氯化锂(lithium chloride)和斑蝥素(cantharidin)这三种化合物显示出潜在治疗价值。

单细胞分辨率分析揭示,特定亚群的单核细胞和微glia1细胞是ICH进程中的"关键角色"。这些发现不仅为理解RNA修饰在脑出血中的作用机制打开新窗口,更为开发精准诊疗策略提供了分子路标。

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