SMARCA4缺陷型肺腺癌的多组学整合分析:分子特征解析与治疗策略探索

【字体: 时间:2025年09月16日 来源:Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease 4.2

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  (编辑推荐)本研究通过整合20个肺腺癌数据集的多组学分析和机器学习,系统揭示了SMARCA4缺陷型肺腺癌(LUAD)的临床预后、代谢异常(如氧化磷酸化亢进)和免疫微环境特征,并通过体内外实验验证了SMARCA4在DNA复制和细胞周期中的关键作用。研究筛选出靶向MTOR通路和氧化应激的潜在化疗药物(如雷帕霉素),为这类高侵袭性、低治疗敏感性的肺癌亚型提供了新的治疗思路。

  

Highlight

SMARCA4缺陷型肺腺癌(LUAD)具有高度侵袭性,伴随多癌基因突变,对化疗、靶向治疗和免疫治疗敏感性低。通过多组学与机器学习分析,我们揭示了SMARCA4突变在临床预后、代谢重编程(如氧化磷酸化亢进)、免疫浸润(CD8+T细胞减少)和通路富集中的关键作用。

Clinical samples

本研究经山东省立医院生物医学研究伦理委员会批准(SWYX: NO. 2024–711),所有患者签署书面知情同意书。

Data collection and preprocessing

从UCSC下载的TCGA数据包含肺腺癌(LUAD)等33种癌症的RNA表达矩阵和临床数据。

SMARCA4在肺腺癌中高表达

通过8个GEO数据集和TCGA-LUAD分析发现,SMARCA4在肿瘤组织中的mRNA水平显著高于癌旁组织(图1A、B),凝胶电泳进一步验证了16对样本中SMARCA4的过表达。

Discussion

SMARCA4缺陷型非小细胞肺癌(SMARCA4-dNSCLC)具有高度恶性特征,但体外实验显示SMARCA4敲除会抑制肺癌细胞增殖并促进凋亡。这种矛盾现象可能源于其独特的代谢特征(如细胞周期异常和氧化应激激活),提示需开发靶向MTOR通路(如雷帕霉素)或DNA复制(如ribociclib)的新型疗法。

CRediT authorship contribution statement

郭德宇与王凯共同完成原始稿撰写、数据分析和实验验证;孙世杰负责机器学习算法;迟玉祥参与生物信息学分析;杜佳骏负责论文润色;董伟指导课题设计。

Funding

本研究未接受任何基金资助。

Declaration of competing interest

作者声明无利益冲突。

Acknowledgments

感谢TCGA、GEO等数据库的研究人员与患者共享数据。

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