优化连接链刚性以改善靶向造血前列腺素D合成酶的PROTACs细胞内行为

【字体: 时间:2025年09月16日 来源:RSC Medicinal Chemistry 3.6

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  本期推荐:针对PROTACs(蛋白降解靶向嵌合体)在靶向降解造血前列腺素D合成酶(H-PGDS)过程中面临的细胞渗透性与三元复合物稳定性矛盾问题,研究人员通过系统比较三种不同刚性连接链(含亚甲基修饰和螺环结构)的设计方案,发现最具刚性的PROTAC-3虽形成最不稳定复合物却展现最高细胞内积累,揭示了连接链构象刚性与空间设计在下一代PROTAC开发中的关键平衡价值。

  

蛋白降解靶向嵌合体(Proteolysis-targeting chimeras, PROTACs)正成为靶向蛋白降解领域的革命性工具。在这项聚焦造血前列腺素D合成酶(H-PGDS)的研究中,科学家们揭示了连接链设计对PROTACs效能的精妙调控机制。通过对比三种具有不同刚性连接链(包括亚甲基修饰和炫酷的螺环结构)的新型PROTACs,发现尽管所有化合物都表现出相似的结合亲和力和降解活性,但"钢铁直男型"的最刚性变体PROTAC-3却上演了戏剧性反差——它在细胞内疯狂囤货(积累量最高),却像个"社交恐惧症患者"般形成了最不稳定的三元复合物。

这项研究如同在分子尺度玩跷跷板:当提升连接链的刚性时,细胞膜 permeability(渗透性)和 intracellular accumulation(胞内积累)这对双胞胎开心地往上升,而 ternary complex stability(三元复合物稳定性)却委屈地往下掉。这种鱼与熊掌不可兼得的现象,为理性设计下一代PROTACs提供了关键启示:需要像顶级建筑师那样,综合考虑连接链的构象刚性与三维空间排布,才能打造出穿透细胞膜如入无人之境、又能牢牢抓住靶蛋白的"分子特工"。

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