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苏丹先天性甲状腺功能减退症家族中pendrin基因缺陷的流行率与分子特征研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月17日 来源:Endocrine 2.9
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本文推荐研究人员针对苏丹人群中先天性甲状腺功能减退症(CH)的遗传病因开展探索,通过对32个家族进行全外显子测序(WES),首次在非洲人群中发现SLC26A4基因变异导致的Pendred综合征(PDS),揭示56.3%的家族存在SLC26A4变异,为苏丹地区CH和感音神经性耳聋(SNHL)的分子诊断与遗传咨询提供重要依据。
在全球范围内,先天性甲状腺功能减退症(Congenital Hypothyroidism, CH)是新生儿最常见的内分泌疾病之一,其中15-20%的病例由甲状腺激素合成障碍(dyshormonogenesis)引起。然而,在苏丹,这一比例异常高达60%,其背后隐藏的遗传机制和流行病学特征长期以来缺乏深入研究。更值得注意的是,苏丹作为中度至重度碘缺乏地区,同时存在高近亲结婚率,这些因素交织在一起,使得该地区的CH呈现出独特的临床和遗传图谱。Pendred综合征(Pendred Syndrome, PDS)作为一种常染色体隐性遗传病,由SLC26A4基因突变导致,典型表现为甲状腺肿和感音神经性耳聋(Sensorineural Hearing Loss, SNHL),其在非非洲人群中的患病率约为7.5-10/10万,但在非洲人群尤其是苏丹人群中,却从未有过分子水平的系统报道。这一知识空白不仅阻碍了当地患者的精准诊断和及时干预,也限制了我们对全球PDS遗传多样性的全面认知。
为了填补这一空白,由Mohammad S. Islam、Alexandra M. Dumitrescu等研究人员组成的团队在《Endocrine》杂志上发表了这项开创性研究。他们聚焦于苏丹先天性甲状腺功能减退症家族,旨在揭示SLC26A4基因缺陷的流行情况和分子特征,从而为当地遗传性甲状腺疾病和听力损失的防治提供科学依据。
本研究采用了几项关键的技术方法:首先,研究团队在苏丹喀土穆通过针对性抽样招募了32个有CH患儿的家族,共72名个体,所有参与者均签署知情同意,研究方案符合赫尔辛基宣言并获美国迈阿密大学伦理委员会批准;其次,使用甲状腺功能检测(包括TSH、FT4、T3和甲状腺球蛋白)对患者进行临床评估;第三,采集外周血样本并提取基因组DNA,采用IDT xGen Exome Hyb Panel v2进行文库构建,利用Illumina NovaSeq X Plus平台进行全外显子测序(WES),平均测序覆盖深度达53.6×,随后通过BWA-MEM2比对至GRCh38参考基因组,使用GATK流程进行变异检测;第四,通过Sanger测序对候选变异进行验证,并利用多种生物信息学工具(SIFT、PolyPhen2、MutationTaster等)和ACMG标准进行致病性评估。
研究结果部分主要包括以下发现:
病例展示:研究详细描述了两个近亲结婚的苏丹家族。家族1中一名15岁男孩携带纯合无义变异c.1446G>A(p.Trp482*),表现为甲状腺肿、SNHL和言语障碍;家族2中一名10岁女孩及其两名表兄妹均携带纯合错义变异c.1229C>T(p.Thr410Met),表型包括甲状腺肿、听力损失和言语延迟。所有患者均显示甲状腺球蛋白(TG)水平显著升高且无TG抗体,提示甲状腺组织破坏和激素合成障碍。
分子遗传学分析:WES和Sanger测序证实这两个变异均为纯合状态,其父母为杂合携带者。p.Trp482*变异导致蛋白质提前终止,被ACMG归类为“可能致病”;p.Thr410Met经多个生物信息学工具预测为有害,归类为“致病”。这两个变异在gnomAD数据库中极其罕见或不存在,表明其在苏丹人群中的特异性富集。
变异流行率:对32个家族(72名个体)的WES数据分析显示,56.3%的家族和45.8%的个体携带SLC26A4变异(杂合或纯合)。在33名变异阳性个体中,12人(36.4%)携带超过一种SLC26A4变异,提示等位基因异质性和潜在复合杂合情况。此外,研究还鉴定出多个其他SLC26A4错义和剪接变异(如p.Ala189Ser、p.Met283Ile等),其中部分已被预测为有害或良性。
讨论部分进一步阐释了这些发现的意义。苏丹缺乏新生儿CH和听力筛查项目,导致PDS诊断延迟,本研究首次通过分子手段确认了SLC26A4相关疾病在苏丹的存在。两个核心变异(p.Trp482*和p.Thr410Met)均与严重的甲状腺和听觉表型相关,但表型可变性也符合既往报道,可能受到碘缺乏、遗传修饰因子或环境因素的影响。苏丹的高近亲结婚率可能是变异聚集的主要原因,而非奠基者效应。此外,碘缺乏可能加剧了甲状腺肿和功能障碍,凸显了遗传与环境互作在疾病表达中的重要性。
研究结论强调,SLC26A4基因缺陷在苏丹CH人群中高度流行,p.Trp482*和p.Thr410Met是重要的致病突变。这一发现支持将SLC26A4筛查纳入苏丹儿童先天性甲状腺功能减退或早发性SNHL的分子检测策略,有助于早期诊断、适时治疗和遗传咨询。尽管当前苏丹的政治危机限制了患者随访,但本研究为未来扩大样本量、深入探索基因型-表型关联及推进精准公共卫生实践奠定了坚实基础。
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