塞内加尔碳青霉烯酶肠杆菌的分子流行病学与耐药机制研究

　　本研究由塞内加尔巴斯德研究所团队开展，针对资源受限地区碳青霉烯酶肠杆菌（CPE）的流行现状，通过全基因组测序技术揭示了NDM-5、OXA-48和OXA-181等耐药基因的传播特征，首次报道撒哈拉以南非洲NDM-5与OXA-48共存病例，发现高风险克隆ST410的国际传播证据，为耐药菌防控提供关键分子流行病学依据。

　　

背景：碳青霉烯酶肠杆菌（CPE）是全球健康威胁，尤其在资源受限地区。本研究旨在揭示塞内加尔达喀尔地区感染源中CPE的流行情况及分子特征。

方法：2019年1月至2020年12月期间，从达喀尔巴斯德研究所收集对厄他培南敏感性降低（抑菌圈直径<25mm）的肠杆菌目细菌。通过生化反应和免疫层析法检测碳青霉烯酶，并采用全基因组测序（WGS）分析耐药基因组、MLST分型、质粒谱、毒力基因及遗传相关性。

结果：在1045株肠杆菌中，86株（8%）对厄他培南敏感性降低，其中19株（2%）确认为CPE。包括大肠杆菌（Escherichia coli）（n=6）[ST410（n=3）、ST405（n=2）和ST2083]、肠杆菌属（Enterobacter spp.）（n=6）[ST231（n=3）、ST245、ST760和ST960]、克雷伯菌属（Klebsiella spp.）（n=5）（ST22、ST25、ST231、ST1535、ST4843）、弗氏柠檬酸杆菌（Citrobacter freundii）ST22（n=1）和未知ST的科泽柠檬酸杆菌（Citrobacter koseri）（n=1）。检出bla_OXA-48（n=7;35%）、bla_OXA-181（n=7;35%）和bla_NDM-5（n=6;30%）基因。ST22型弗氏柠檬酸杆菌同时携带bla_NDM-5、bla_OXA-48和bla_CTX-M-15基因。部分ST410克隆大肠杆菌与法国自塞内加尔归国患者分离株高度同源（SNP差异<20个），提示跨国传播。此外，5株大肠杆菌在PBP3蛋白中出现四氨基酸插入，导致对氨曲南/阿维巴坦和头孢地尔的敏感性降低。

结论：本研究揭示了NDM-5和OXA-181在塞内加尔的传播，首次报道撒哈拉以南非洲NDM-5与OXA-48的共存现象。CPE（特别是高风险克隆）的传播强调持续监测和靶向干预的紧迫性。