探索通用分割模型在斑马鱼心跳视频中心功能参数自动量化的应用

【字体: 时间:2025年09月18日 来源:Medical & Biological Engineering & Computing 2.6

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  来自国内的研究人员为提升环境化学物质心血管毒性评估效率,开展了基于通用分割模型的斑马鱼心功能自动量化研究。采用Mask2Former实现心室与心包的高精度分割(IoU达93.46%/83.31%),自动计算7项心功能参数(如HR、SV、CO等),相对误差低于10.0%,为毒理学研究提供快速可靠的新工具。

  

通过探索通用分割模型,本研究实现了从斑马鱼心跳视频中自动量化心功能参数。当前方法依赖繁琐的人工标注或不精确的半自动/自动测量,制约了心血管功能评估的准确性。研究团队对20种前沿深度分割模型进行基准测试,最终选用性能最优的Mask2Former对心室(ventricle)和心包(pericardium)进行分割。基于心室变化和心包形态的量化,自动计算出斑马鱼胚胎的7项心功能参数:心率(heart rate, HR)、每搏输出量(stroke volume, SV)、心输出量(cardiac output, CO)、最大心室面积、射血分数(ejection fraction, EF)、舒张期与收缩期比值、以及心包弧长。在178个斑马鱼心跳视频上的实验表明,Mask2Former表现出卓越性能:心室分割的IoU(交并比)达93.46%、Dice系数为96.58%;心包分割的IoU为83.31%、Dice系数为90.89%。与人工测量相比,自动量化参数均呈现高精度,相对误差低于10.0%。该框架为评估环境化学物质对心血管系统的毒性作用提供了新颖、快速且可靠的工具。

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