基于癌症驱动基因解析食管癌亚型免疫特征以助力免疫治疗新策略

　　来自多机构的研究团队针对食管癌(ESCA)治疗中生物标志物缺失的难题，通过整合癌症驱动基因(CDGs)与免疫微环境特征，成功鉴定出18个生存相关CDGs并构建ESCA分子亚型，揭示cluster 1亚型具有更低肿瘤免疫功能障碍与排斥(TIDE)评分，为ESCA免疫治疗提供新型生物标志物和靶向小分子药物筛选依据。

　　

食管癌(Esophageal cancer, ESCA)作为全球性健康威胁，其治疗策略亟需新型生物标志物。本研究通过单因素回归筛选出18个与生存显著相关的癌症驱动基因(Cancer Driver Genes, CDGs)，并基于CDGs表达谱对TCGA-ESCA队列进行共识聚类，成功划分出cluster 1与cluster 2两种分子亚型。研究发现两亚型呈现显著差异的免疫细胞浸润模式，其中cluster 1亚型表现出更低的肿瘤免疫功能障碍与排斥(Tumor Immune Dysfunction and Exclusion, TIDE)评分，提示其可能对免疫治疗更具敏感性。

通过差异表达基因(Differentially Expressed Genes, DEGs)富集分析发现，亚型间差异基因主要富集于体液免疫应答、受体配体活性及神经活性配体-受体相互作用通路。肿瘤突变负荷分析显示两亚型间无显著差异。研究进一步预测了靶向DEGs的潜在小分子药物，包括3,3′-二吲哚甲烷(3,3′-diindolylmethane)、SJ-172550、氨鲁米特(aminoglutethimide)、硝西泮(nitrazepam)、阿卡曲特(actarit)以及表没食子儿茶素(epigallocatechin)等。

通过qRT-PCR实验验证，RUNX1、NONO和TSC2基因不仅在食管鳞癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma, ESCC)中与生存显著相关，且在ESCC细胞系(KYSE150与KYSE450)中呈现显著高表达。该研究为阐明CDGs在ESCA中的功能机制及开发精准免疫治疗策略提供了重要理论依据。