牙龈卟啉单胞菌新型药物靶点BAG33339.1的发现：整合性反向蛋白质组学与结构动力学研究

　　本研究针对牙龈卟啉单胞菌（P. gingivalis）感染缺乏有效治疗的难题，通过整合反向蛋白质组学与分子动力学模拟，首次鉴定出非宿主同源性的内膜靶点蛋白BAG33339.1，揭示其"U"形构象动态特征和配体结合口袋，为开发新型抗菌疗法提供关键理论依据。

　　

革兰阴性菌牙龈卟啉单胞菌（Porphyromonas gingivalis）通过与宿主龈下生物膜相互作用，引发成人龋齿和牙齿脱落，并导致免疫系统功能受损、组织破坏和骨吸收。该菌还与心血管疾病、阿尔茨海默病、癌症等多种系统性疾病密切相关。当前抗生素治疗策略效果有限，亟需开发新型靶向疗法。

研究人员通过筛选173个P. gingivalis必需假设蛋白，发现一个与宿主及肠道微生物无同源性的新型药物靶标——内膜蛋白BAG33339.1。该蛋白具有疏水N端跨膜螺旋和动态C端螺旋区域（Y36至E52），其中Lys45下游残基处于无序状态。通过挫折指数和突变矩阵分析，证实跨膜螺旋稳定性与C端残基动态性共同形成独特的"U"形蛋白构象。

分子动力学模拟显示，C端无序区域可能促进P. gingivalis变异，而整体构象稳定性通过平衡的RMSD（均方根偏差）、R_g（回旋半径）和SASA（溶剂可及表面积）值得以维持，氢键增加和螺旋稳定进一步验证了这一结论。靶向BAG33339.1的配体结合口袋，将为阻断病原体-宿主相互作用提供创新治疗方向。