TOPMed计划揭示循环代谢物遗传结构与调控机制:多族裔基因组分析为精准医学提供新见解

【字体: 时间:2025年09月19日 来源:AJHG 9.8

编辑推荐:

  本研究针对循环代谢物遗传研究多局限于欧洲人群的问题,由TOPMed计划研究人员通过整合多族裔队列(n=25,058),系统分析了1,729种代谢物的遗传架构。采用全基因组测序(n=16,359)发现1,775个独立遗传位点,其中160个为新发现关联(含X染色体基因GAB3/VSIG4),并揭示85个性别二态性关联(如FADS2、UGT2B1717),为代谢调控机制和精准医学提供重要依据。

  

通过整合美国国家心、肺和血液研究所(NHLBI)发起的"跨组学精准医学"(Trans-Omics for Precision Medicine, TOPMed)计划资源,研究人员对来自8项研究的25,058名多族裔样本中的1,729种循环代谢物进行了系统编目。研究团队通过比较多种数据处理方法,提出采用按研究进行逆正态化(inverse normalization)和半最小值填充(half-minimum imputation)的策略,证明其在合并分析或荟萃分析中具有高度一致性。

基于此分析框架,团队利用全基因组测序数据对16,359名通过质控的个体开展全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study, GWAS),针对1,135种精选代谢物发现了1,775个独立遗传位点,其中667种代谢物与这些位点显著相关。值得注意的是,研究揭示了160个此前未报道的位点-代谢物关联对,包括位于X染色体上可能参与代谢调控的GAB3和VSIG4基因座。

在性别分层分析中,研究人员进一步发现85个呈现性别二态性(sexual dimorphism)的独立关联对,这些位点分布于FADS2(脂肪酸去饱和酶2)、D2HGDH(D-2-羟基戊二酸脱氢酶)、SUGP1(SURP和G补丁结构域包含蛋白1)以及UGT2B17(尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶家族2成员B17)等已知代谢基因中,强有力地证实了探索代谢组学性别差异的重要性。

该研究不仅描绘了遗传因素对循环代谢物水平的贡献图谱,还为理解人类健康状态和疾病机制提供了新的分子视角。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号