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TOPMed计划揭示循环代谢物遗传结构与调控机制:多族裔基因组分析为精准医学提供新见解
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月19日 来源:AJHG 9.8
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本研究针对循环代谢物遗传研究多局限于欧洲人群的问题,由TOPMed计划研究人员通过整合多族裔队列(n=25,058),系统分析了1,729种代谢物的遗传架构。采用全基因组测序(n=16,359)发现1,775个独立遗传位点,其中160个为新发现关联(含X染色体基因GAB3/VSIG4),并揭示85个性别二态性关联(如FADS2、UGT2B1717),为代谢调控机制和精准医学提供重要依据。
通过整合美国国家心、肺和血液研究所(NHLBI)发起的"跨组学精准医学"(Trans-Omics for Precision Medicine, TOPMed)计划资源,研究人员对来自8项研究的25,058名多族裔样本中的1,729种循环代谢物进行了系统编目。研究团队通过比较多种数据处理方法,提出采用按研究进行逆正态化(inverse normalization)和半最小值填充(half-minimum imputation)的策略,证明其在合并分析或荟萃分析中具有高度一致性。
基于此分析框架,团队利用全基因组测序数据对16,359名通过质控的个体开展全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study, GWAS),针对1,135种精选代谢物发现了1,775个独立遗传位点,其中667种代谢物与这些位点显著相关。值得注意的是,研究揭示了160个此前未报道的位点-代谢物关联对,包括位于X染色体上可能参与代谢调控的GAB3和VSIG4基因座。
在性别分层分析中,研究人员进一步发现85个呈现性别二态性(sexual dimorphism)的独立关联对,这些位点分布于FADS2(脂肪酸去饱和酶2)、D2HGDH(D-2-羟基戊二酸脱氢酶)、SUGP1(SURP和G补丁结构域包含蛋白1)以及UGT2B17(尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶家族2成员B17)等已知代谢基因中,强有力地证实了探索代谢组学性别差异的重要性。
该研究不仅描绘了遗传因素对循环代谢物水平的贡献图谱,还为理解人类健康状态和疾病机制提供了新的分子视角。
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