羟基酪醇、酪醇及其乙酸衍生物在帕金森病中的抗氧化效能:多尺度计算研究揭示协同神经保护机制

【字体: 时间:2025年09月21日 来源:Computers in Biology and Medicine 6.3

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  本文采用多尺度计算策略,系统研究了羟基酪醇、酪醇等同系物及其乙酰化衍生物对自由基(ROO•/HOO•)的清除机制与MAO-A酶抑制效能。通过DFT(密度泛函理论)、分子对接与动力学(MD)模拟,揭示其通过氢键与疏水作用稳定结合靶点,ADMET分析证实其良好药代动力学特性,为帕金森病抗氧化治疗提供新型候选分子。

  

Highlight

通过多尺度计算策略,我们揭示了羟基酪醇(M4分子)在六种研究分子中展现出最强的抗氧化潜力。其对ROO和HOO自由基的高结合亲和力及有利热力学参数,证实SET-PT(单电子转移-质子转移)途径为最有效的自由基清除机制。DFT分析突显其儿茶酚环作为氧化还原活性中心,凭借双供体-受体特性有效稳定自由基物种。相互作用研究(包括Hirshfeld表面分析、QTAIM和NCI-IRI)揭示了由传统氢键主导、辅以疏水非共价接触的稳定作用模式。

Computational methodology

采用量子力学DFT(密度泛函理论)框架研究抗氧化剂与自由基(ROO/HOO)的非共价相互作用。所有分子结构通过GaussView5.0构建,并在Gaussian09软件中使用M06-2X/6-311G++(d,p)基组进行优化。JoinMolecule与ArgusLab软件用于生成和可视化抗氧化剂-自由基复合物。

Reactivity of ROO and HOO radicals with phenolic compounds/derivatives

本研究基于关键结构特征(含至少一个酚羟基)筛选出一系列具有已知抗氧化活性的酚类化合物及其衍生物(图1和表1)。其分子特性显著增强与ROS(如ROO和HOO)的反应性,这些自由基参与生物系统中的氧化应激过程。计算得到的这些抗氧化剂-自由基复合物的IE(电离能)值(表2)通常被作为定量描述其电子转移能力的指标。

Conclusion

我们的计算结果表明,M4在所有研究分子中表现出最高的抗氧化潜力。其对ROO和HOO自由基的强结合亲和力以及有利的热力学参数,证实SET-PT途径是最有效的自由基清除机制。DFT分析突显了M4的儿茶酚环作为氧化还原活性热点,其双供体-受体特性能够有效稳定自由基物种。相互作用研究(包括Hirshfeld表面分析、QTAIM和NCI-IRI)揭示了由传统氢键主导、辅以疏水非共价接触的稳定模式。

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