基于谷氨酰胺代谢相关基因的分子分型预测结肠腺癌预后、肿瘤微环境及药物治疗反应

【字体: 时间:2025年09月22日 来源:Arab Journal of Gastroenterology 1.1

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  本综述通过整合TCGA和GEO数据库的结肠腺癌(COAD)多组学数据,系统解析谷氨酰胺代谢相关基因(GMRGs)在分子分型、预后评估和肿瘤微环境(TME)调控中的作用,并构建含10个特征基因的风险模型(Riskscore)。研究证实低风险组(LR)对免疫治疗更敏感,为COAD的精准代谢干预和免疫联合治疗提供新策略。

  

Section snippets

Public data download

结肠腺癌(COAD)相关的转录组数据与临床信息从两个公共数据库获取:癌症基因组图谱(TCGA)(https://portal.gdc.cancer.gov/)和基因表达综合库(GEO)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)。TCGA数据集作为训练集,GEO数据作为验证集。具体而言,我们收集了TCGA中COAD患者的RNA-Seq测序数据(HTSeq-Counts格式)及对应临床信息(包括年龄、性别、肿瘤分期等)。

Comparative analysis of GMRGs from different database sources

为验证所选谷氨酰胺代谢相关基因(GMRGs)的权威性与科学性,我们通过维恩分析对比了本研究基因集与基于Reactome数据库构建的GM基因集的重叠情况。结果显示,本研究基因集与Reactome数据库基因集存在9个重叠基因(占Reactome基因集的64%),表明高度一致性(图1)。差异可能源于数据库注释标准或研究焦点不同。

Discussion

瓦博格效应(Warburg effect)是癌细胞的经典能量代谢模式,而谷氨酰胺代谢(GM)作为关键补充代谢途径,参与能量生成、氧化还原稳态维持、大分子合成及信号转导。近年研究表明,GM在结肠腺癌(COAD)的恶性进展中扮演重要角色,并被视作潜在治疗靶点。然而,GMRGs在COAD中的系统表达谱与调控网络仍待深入探索。本研究通过多维度分析揭示GMRGs分子分型与预后、免疫微环境及治疗反应的关联,为COAD的代谢-免疫联合治疗提供理论依据。

Authors contribution

Lijian Yu参与研究设计与数据解读及稿件起草;Xia Lin负责统计分析并批判性修订稿件。所有作者阅读并认可最终稿件。

Ethics approval and consent to participate

不适用。

Funding

不适用。

Declaration of competing interests

作者声明不存在已知的竞争性财务利益或个人关系影响本研究结果。

Conclusion

总之,本研究基于GMRGs构建了可靠的预后风险模型,为COAD的预后机制研究和治疗策略开发提供了可行基础。

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