加拿大梅毒螺旋体临床株MB1与SK1全基因组解析揭示SS14谱系进化与阿奇霉素耐药机制

　　本研究由加拿大研究团队完成，通过对两株临床分离的梅毒螺旋体（TPA）菌株MB1和SK1进行全基因组测序，成功获得完整基因组序列（GenBank: CP191228, CP191227）。研究证实两株均属于SS14谱系（序列型1.3.1），携带阿奇霉素耐药基因，为北美地区梅毒疫情监测和耐药机制研究提供了关键分子数据。

　　

研究人员报道了来自加拿大曼尼托巴省和萨斯喀彻温省的两株梅毒螺旋体亚种 pallidum（Treponema pallidum subsp. pallidum, TPA）临床分离株MB1（2016年5月）和SK1（2023年2月）的完整基因组序列。通过Illumina MiSeq和Oxford Nanopore GridION双平台测序，结合特异性全基因组扩增（SWGA）技术和定制探针捕获（SureSelect）富集策略，成功构建了完成度100%的环状基因组图谱。

基因组分析显示：MB1和SK1均属于SS14单系谱系（序列型1.3.1），基因组大小分别为1,141,273 bp和1,139,696 bp，GC含量约52.76%，编码990和985个CDS（编码序列），均携带45个tRNA和3个rRNA。通过starAMR和RGI（耐药基因标识符）分析，两株菌均预测对阿奇霉素耐药。研究采用SPAdes组装、Pilon抛光、TGS-GapCloser缺口闭合以及NCBI PGAP注释流程，最终获得高质量基因组（N50最高达1,139,401 bp），并通过GenoVi生成可视化环状基因组图谱（展示COG功能分类、GC偏倚等特征）。

该研究为理解TPA的遗传多样性、进化分型及抗菌素耐药性（AMR）机制提供了重要数据支撑，对北美地区梅毒（syphilis）疫情监测和公共卫生干预策略制定具有显著意义。