细菌浓度调整法快速直接纸片扩散检测尿路感染的抗生素耐药性

【字体: 时间:2025年09月23日 来源:Microbiology Spectrum 3.8

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  本综述推荐一种创新的快速直接纸片扩散法(DST),通过整合细菌浓度分析,无需标准化菌悬液制备,即可实现尿路感染(UTI)的抗生素药敏测试(AST)。该方法利用阈值调整或回归模型,将抑菌圈大小与浓度关联,显著缩短诊断时间18–24小时,且在临床样本中与标准AST的一致性高达93%以上,为资源有限地区提供了高效、可靠的诊断替代方案。

  

引言

尿路感染(UTI)是全球最常见的细菌感染之一,年发病数约4亿例。其诊断通常依赖临床症状、试纸条测试和实验室培养,而抗生素药敏测试(AST)则需标准化菌悬液。传统纸片扩散法要求先将尿液样本孵育过夜,分离细菌并调整至0.5麦氏单位(McFarland)浓度,再接种于琼脂平板并放置抗生素纸片,通过测量18–24小时后的抑菌圈直径,与临床和实验室标准协会(CLSI)或欧洲抗菌药敏测试委员会(EUCAST)的折点表对比判断耐药性。这一流程耗时长达36–48小时,且资源需求较高。

直接药敏测试(DST)可直接从患者样本(如尿液)中快速获得表型药敏结果,无需病原体分离和传代培养,节省时间并减少表型变异风险。既往研究显示DST与标准AST的一致性常超过90%,但其主要局限在于未系统考虑细菌浓度的影响——即“接种量效应”(inoculum effect)。该效应表现为细菌浓度升高时抑菌圈缩小或最小抑菌浓度(MIC)增加,可能导致误判:低浓度耐药菌被误为敏感,高浓度敏感菌被误为耐药。尽管UTI的细菌浓度阈值常设为103 CFU/mL,但既往DST方法多在单一任意浓度下测试,缺乏浓度调整的标准化解读。

本研究旨在评估两种新型快速纸片扩散法,通过将细菌浓度纳入分析,消除标准化菌悬液的需求,优化UTI的诊断流程与准确性。

结果

接种量对抑菌圈直径的影响

通过测试27例临床尿液分离菌在磷酸盐缓冲液(PBS)中不同浓度(0.5 McFarland、105 CFU/mL和103 CFU/mL)的悬液,并测量其对磷霉素、呋喃妥因和美西林等抗生素的抑菌圈,发现细菌稀释度增加时抑菌圈显著扩大(P <0.001)。Spearman等级相关系数显示,各浓度间抑菌圈变化趋势一致(rS 0.81–0.95,P <0.001),证实浓度与抑菌圈大小存在直接关联。

若仅凭抑菌圈直径判断而不考虑浓度,敏感菌检出准确率达100%,但耐药菌仅64.7%被正确分类,误判遍布所有测试抗生素。尤其在稀释悬液中,敏感与耐药菌的抑菌圈出现重叠,凸显单纯依赖 halo 尺寸的局限性。

阈值调整法区分耐药性并整合细菌浓度

基于8株参考菌株的数据,建立了针对105 CFU/mL和103 CFU/mL浓度的新阈值折点,用于区分敏感与耐药菌。将此标准应用于临床分离菌后,敏感菌分类一致率达94.7%,耐药菌达94.1%。各抗生素在不同浓度下的具体一致率如下:磷霉素在103 CFU/mL时敏感菌90.9%、耐药菌75%;呋喃妥因均达100%;美西林在105 CFU/mL时敏感菌72.2%、耐药菌100%。参考菌株测试中,97.6%敏感菌和96.3%耐药菌被正确识别。

将临床尿液样本直接接种琼脂平板并采用阈值调整DST法,与标准纸片扩散法相比,真实敏感符合率93.7%,真实耐药符合率94.1%。误判样本包括4例假耐药和1例粪肠球菌(Enterococcus faecalis)对磷霉素假敏感。

回归法基于抑菌圈预测耐药谱

通过线性回归模型,将稀释悬液(105 CFU/mL和103 CFU/mL)的抑菌圈尺寸预测为标准0.5 McFarland对应的值,再与CLSI折点对比。模型基于参考菌株建立,并在临床样本中验证。

整体上,回归模型对敏感菌的预测准确率100%,耐药菌88.2%。各抗生素在105 CFU/mL浓度下平均绝对误差(MAE)较低(1.72–2.34 mm),预测更准确;103 CFU/mL时误差增大(2.59–3.47 mm)。具体地,磷霉素在103 CFU/mL时耐药菌一致率75%;呋喃妥因均100%;美西林在105 CFU/mL时耐药菌88.9%,103 CFU/mL时降至55.6%。

直接测试临床尿液样本时,回归法的敏感与耐药符合率均为93.7%和94.1%,误判情况与阈值法一致。

讨论

本研究开发的两种浓度调整DST法显著优化了UTI的AST流程,省去菌悬液标准化步骤,将诊断时间缩短18–24小时,且与标准方法高度一致。它们尤其适合资源有限地区,因成本低、操作简,能促进靶向治疗并改善患者预后。

浓度效应在AST中的关键作用得到强化:考虑细菌浓度后,耐药判读一致率从64.7%提升至94.1%(阈值法)或88.2%(回归法)。直接尿液应用进一步证明该方法在真实场景中的可靠性,且回归法更易整合现有标准流程,因它无需新折点而直接采用CLSI/EUCAST表。

然而,低浓度下抑菌圈边缘模糊(如变形杆菌蔓延生长)可能影响读数,导致与标准AST差异。此外,DST应仅用于未经抗生素预处理的患者尿液,以免微生物组成改变导致偏差。

未来需扩展验证更多病原体和浓度范围,优化折点与模型,并探索自动化整合以提升方法普适性。总体而言,这些浓度感知的DST法为推动快速、临床可靠的尿路感染诊断提供了实用进步。

材料与方法

使用菌株包括大肠杆菌ATCC 25922、肺炎克雷伯菌ATCC 13883等8株参考菌及临床尿液分离株。抗生素纸片为磷霉素200 μg(含G6P 50 μg)、呋喃妥因100 μg和美西林10 μg。实验用LB琼脂和Mueller-Hinton琼脂,孵育均37°C、18小时。

参考数据库通过测量参考菌在0.5 McFarland、105 CFU/mL和103 CFU/mL悬液的抑菌圈建立,敏感/耐药按CLSI标准分类。临床尿液样本取自疑似UTI患者,经MALDI-TOF鉴定物种,入选标准为单菌感染(肠杆菌、葡萄球菌等)、浓度≥103 CFU/mL且无抗生素预处理。

抑菌圈测量时,高浓度(105 CFU/mL)测两对向菌落距离,低浓度(103 CFU/mL)量至最近菌落边缘距并加倍。折点应用CLSI表,无标准时间 extrapolate 或依无抑菌圈判耐药。

阈值优化算法基于参考菌数据最大化分类准确率,回归模型用线性拟合(Halo0.5McF = a + b × Halodilution)。统计采用Shapiro-Wilk正态检验、Kruskal-Wallis和Mann-Whitney U非参数测试及Spearman相关,显著性设P <0.05。

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