寻找作为抗癌剂的PI3K抑制剂:通过虚拟筛选、ADMET和分子动力学模拟进行分子建模

《ChemistrySelect》:In Search of PI3K Inhibitors as Anticancer Agents: Molecular Modelling Through Virtual Screening, ADMET, and Molecular Dynamics Simulations

【字体: 时间:2025年09月24日 来源:ChemistrySelect 2

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  抗肿瘤PI3K抑制剂开发:基于药效团建模、虚拟筛选及分子动力学验证的化合物筛选策略,成功鉴定出具有高结合稳定性、良好药代特性和低毒性的CHEMBL2163908作为候选药物。

  

图形摘要

一种基于结构的计算策略通过药效团建模、虚拟筛选、对接、ADMET分析和分子动力学模拟来识别潜在的PI3K抑制剂。CHEMBL2163908表现出强烈的结合稳定性、良好的药代动力学特性以及极低的毒性,这凸显了其作为高效PI3K抑制剂的潜力,有望进一步进行临床前验证,用于癌症治疗。

摘要

癌症仍然是全球主要的死亡原因之一,现有的治疗方法常常受到副作用、癌症复发和患者依从性差的限制。由于磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)在细胞生长、增殖和存活中的作用,迫切需要具有新作用机制的抗癌药物。在这项研究中,我们采用了一种综合的计算方法,首先利用两种晶体结构(PDB ID:4L23和8TSC)的原子属性场(APF)对齐生成了PI3K的3D药效团模型。对2,500个MolScreen配体和2,431,025个ChEMBL配体进行了虚拟筛选,识别出350个与PI3K有良好相互作用的配体。对这些配体进行了ADMET分析和对接评分,其中200个配体显示出良好的药代动力学特性或类药性质。其中,CHEMBL2163908脱颖而出,具有最高的对接评分和有希望的类药性质。进一步对CHEMBL2163908进行了200纳秒的分子动力学(MD)模拟,证实了其在PI3K活性位点的稳定结合。这些发现表明CHEMBL2163908是开发新型PI3K抑制剂用于抗癌治疗的潜在候选物。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

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