FKBP9通过增强IGF2BP1介导的m6A识别促进肝细胞癌进展的机制研究

　　本研究针对肝细胞癌（HCC）中m6A修饰调控机制不清的问题，开展了FKBP9与IGF2BP1互作在HCC进展中的作用研究。发现FKBP9通过其PPIase结构域与IGF2BP1的KH3-4结构域结合，增强对m6A修饰的MYC和PDGFB mRNA的稳定性，促进肿瘤增殖与转移。该研究揭示了FKBP9–IGF2BP1轴作为HCC潜在治疗靶点的重要意义。

　　

肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma, HCC）是最常见的原发性肝脏恶性肿瘤，其发生发展涉及多种分子机制的异常调控。N⁶-甲基腺苷（m⁶A）作为真核生物mRNA中最常见的内部化学修饰，通过影响RNA的稳定性、翻译和剪接过程，在肿瘤进展中发挥关键作用。FK506结合蛋白9（FKBP9）是一种肽酰脯氨酰异构酶（PPIase），既往研究提示其与多种肿瘤的发生发展相关，但它在m⁶A修饰调控中的作用仍不明确。胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1（IGF2BP1）作为重要的m⁶A阅读蛋白，可通过识别m⁶A标记稳定多种癌基因mRNA，但其上游调控机制及与其他蛋白的互作网络仍有待揭示。

为解决上述问题，研究人员开展了关于FKBP9在HCC中功能及机制的系统研究，相关成果发表在《JHEP Reports》。研究团队通过临床样本分析、分子生物学实验、动物模型及多组学技术，揭示了FKBP9通过增强IGF2BP1介导的m⁶A识别能力从而促进HCC进展的新机制。

在研究过程中，作者运用了包括免疫组化（IHC）、Western blot、ELISA、Co-IP结合质谱（Co-IP-MS）、RNA免疫共沉淀（RIP）、MeRIP-seq、RNA-seq、体内外功能实验等多种关键技术。临床样本来自东南大学附属中大医院和南京大学医学院附属金陵医院，包括38对HCC组织、28例患者血清和21例健康人对照血清以及90对配对组织芯片。

A High FKBP9 Expression Correlates with a Poor Prognosis of HCC

通过分析TCGA数据库和本地临床样本，研究发现FKBP9在HCC组织及血清中表达显著上调，且与不良临床预后密切相关。生存分析显示，FKBP9高表达患者的总生存期（OS）和无病生存期（DFS）均显著缩短。

FKBP9 Promotes the Development of HCC

功能实验表明，敲低FKBP9可抑制HCC细胞增殖、迁移、侵袭并诱导细胞周期阻滞和凋亡，而过表达则产生相反效果。体内实验进一步证实FKBP9 knockdown可显著抑制原位移植瘤的生长和转移。

FKBP9 Interacts with the m⁶A Reader Protein IGF2BP1

Co-IP-MS和GST pull-down实验证实FKBP9与IGF2BP1直接相互作用，且该互赖于FKBP9的PPIase结构域和IGF2BP1的KH3-4结构域。免疫荧光显示二者在细胞质中共定位。

IGF2BP1 is Involved in FKBP9-mediated HCC Progression

临床样本分析显示FKBP9与IGF2BP1共表达与患者预后差显著相关。回复实验证实IGF2BP1参与FKBP9介导的HCC恶性表型。

FKBP9 Enhances the m⁶A Reader Function of IGF2BP1 on Target mRNAs

RNA pulldown和RIP-qPCR实验表明FKBP9增强IGF2BP1与m⁶A修饰RNA的结合能力。组学分析筛选出227个受FKBP9/IGF2BP1共同调控的m⁶A修饰靶基因，富集于HCC相关通路。

FKBP9 Stabilizes m⁶A-modified mRNA via Interaction with IGF2BP1

FKBP9以m⁶A依赖方式增强IGF2BP1对MYC和PDGFB mRNA的结合，从而提高其稳定性。荧光素酶报告实验证实m⁶A位点突变可消除该调控效应。

FKBP9 Employs MYC and PDGFB to Promote HCC Progression

回复实验表明MYC或PDGFB过表达可部分逆转FKBP9敲低导致的表型抑制。体内实验显示MYC抑制剂EN4可显著抑制FKBP9过表达诱导的肿瘤生长和转移。

FKBP9 Combined with MYC and PDGFB Exhibits High Prognostic Values for HCC

临床相关性分析显示FKBP9与MYC、PDGFB表达呈正相关，共高表达患者预后最差。Cox回归确认三者均为HCC的独立预后因素。

研究结论表明，FKBP9作为新的m⁶A调控因子，通过增强IGF2BP1对m⁶A修饰转录本的识别能力，稳定MYC和PDGFB等癌基因表达，从而驱动HCC进展。该研究不仅揭示了FKBP9–IGF2BP1–MYC/PDGFB轴在HCC中的关键作用，也为开发针对该通路的新型治疗策略提供了理论依据和实验支持。值得注意的是，FKBP9在血清中的高表达提示其作为HCC诊断生物标志物的潜力，特别是对于AFP阴性患者具有重要临床意义。尽管直接靶向FKBP9仍面临挑战，但该研究为联合靶向IGF2BP1–FKBP9互作及其下游信号提供了创新思路。