拷贝数变异(CNV)分析在提升儿童癫痫分子诊断率及探索新致病基因中的应用价值

【字体: 时间:2025年09月25日 来源:Pediatric Research 3.1

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  本研究针对儿童癫痫遗传病因诊断率低的临床难题,系统开展了基于全外显子测序(WES)的拷贝数变异(CNV)分析。研究发现CNV检测可将遗传诊断率显著提升11.5%,首次揭示发育迟缓和心脏异常患儿更易携带致病性CNV,并通过深度分析发现两个潜在新癫痫基因,为癫痫分子诊断和基因发现提供了重要依据。

  

拷贝数变异(Copy Number Variations, CNVs)已被证实与多种神经认知障碍相关,尤其在智力残疾和癫痫等严重儿科疾病中起着关键作用。本研究旨在系统分析儿童癫痫患者群体中CNVs的分布特征与致病性,从而拓展相关综合征或基因表型谱系,并探索CNVs区域内潜在的新癫痫致病基因。

研究人员收集了425例儿童癫痫患者的临床资料,采用全外显子测序(Whole Exome Sequencing, WES)技术同步进行致病性变异分析和CNV分析。所有变异均严格遵循美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南进行分类。研究团队重点分析了与遗传诊断结果相关的表型特征,并对确诊性CNVs开展了深度挖掘。

研究结果显示:在425例患儿中,104例(24.5%)通过单核苷酸变异/插入缺失(SNVs/indels)检测获得分子诊断,而CNV检测进一步发现49例(11.5%)携带致病性CNVs。特别值得注意的是,对于CNVs未能解释癫痫表型的病例,研究者通过深入分析提出了两个潜在的新癫痫候选基因。

结论表明:CNV分析显著提高了儿童癫痫的遗传诊断率,发育迟缓或合并心脏畸形的患儿更可能携带致病性CNVs。对确诊性CNVs的深度分析不仅能明确癫痫患者的遗传病因、指导临床随访策略,更有助于发现具有潜力的癫痫候选基因。

研究突出三大价值:1)CNV分析显著增强癫痫分子诊断能力;2)发育迟缓或心脏病患儿更易检出致病性CNVs;3)CNVs深度分析为发现癫痫新基因提供重要途径。

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