南京HIV-1 CRF119_0107毒株的传播动态与空间分布：基因组与空间流行病学联合分析揭示防控新策略

　　为应对HIV-1 CRF119_0107毒株在南京MSM人群中的快速传播及高耐药性问题，研究人员开展了一项结合分子传播网络与空间流行病学的联合分析。研究发现该毒株传播活跃（聚类率56.6%），耐药率高达15.9%，且存在跨区域传播特征。该研究为针对性防控策略提供了关键科学依据。

　　

近年来，HIV病毒因其高突变率和快速复制动力学，不断产生新的重组形式，给全球艾滋病防控带来严峻挑战。中国已报道超过50种不同的HIV-1循环重组型（CRF），其中许多主要在男男性行为者（MSM）人群中传播。CRF119_0107作为CRF01_AE和CRF07_BC的第二代重组毒株，2017年首次在南京MSM人群中发现，随后迅速成为当地第三大流行亚型。南京作为江苏省会和经济中心，艾滋病疫情严重，MSM人群感染率持续较高，且病毒多样性和传播性耐药（TDR）问题日益突出。在此背景下，深入研究CRF119_0107的传播动态、空间分布及耐药情况，对于制定精准防控策略至关重要。

为回答上述问题，徐园园等研究人员在《Virology Journal》发表了一项结合基因组学与空间流行病学的研究。该研究纳入2019至2024年南京新报告的HIV感染者，经病毒RNA提取、巢式PCR扩增和测序获得pol基因序列，通过HIV-TRACE构建分子传播网络，并利用ArcGIS进行空间分析。主要技术方法包括：病毒基因测序与亚型鉴定、分子网络构建与聚类分析、耐药突变检测、空间自相关分析与传播链接可视化。

研究结果：

一、基本特征与耐药情况

138例CRF119_0107感染者以未婚、高学历MSM为主。耐药分析显示TDR率高达15.9%，其中15.2%对非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTI）耐药，主要突变包括K103N/KN和V179D。

二、分子网络与聚类特征

以0.005替换/位点为遗传距离阈值，78条序列形成11个传播簇，聚类率56.6%。发现4个大型MSM主导簇（含10-21个节点），其中簇1和簇3为高增长簇（2022-2024年增速>2节点/年）。簇1为耐药簇，含19例K103N/KN突变感染者。多因素分析显示，高初始CD4计数（≥500 cells/μL）和TDR是进入网络的独立危险因素。

三、空间传播模式

聚类个体分布全市12个区，全局Moran's I=-0.121（P=0.774），呈随机分布。强度矩阵和空间传播图显示，区间传播链接占总链接的83.9%，存在大量跨区甚至非相邻区域间的传播。

研究结论与讨论：

本研究首次全面揭示了CRF119_0107在南京的传播动态、空间特征和耐药情况。该毒株主要在年轻、高学历MSM中活跃传播，并扩散至异性传播人群。高增长簇和耐药簇的发现提示需实施实时监测和快速响应机制。空间分析显示广泛存在的跨区传播，强调需加强区域协同防控。研究的跨学科方法为优化资源分配和制定地理靶向策略提供了证据支持，对遏制CRF119_0107传播乃至其他HIV毒株的防控均具有重要意义。建议优先对高增长簇和耐药簇采取多部门联合干预，推广以多替拉韦（DTG）为基础的治疗方案，并强化病毒载量监测和随访管理。