RHBDD1通过内质网相关降解途径调控TP53突变型非小细胞肺癌细胞周期停滞的新机制

【字体: 时间:2025年09月27日 来源:European Journal of Medical Research 3.4

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  本研究针对非小细胞肺癌(NSCLC)中TP53突变导致的治疗难题,通过多组学分析和实验验证,首次揭示RHBDD1通过内质网相关降解(ERAD)机制同时降解p53和DNA-PKcs蛋白,诱导TP53突变型NSCLC细胞S期阻滞,但同时抑制DNA-PKcs依赖性凋亡促进细胞存活。该发现为靶向RHBDD1-p53-DNA-PKcs轴治疗TP53突变NSCLC提供了新策略。

  
肺癌是全球范围内发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,其中非小细胞肺癌(NSCLC)约占所有肺癌病例的85%。尽管近年来靶向治疗和免疫治疗取得了显著进展,但TP53基因突变——这个在NSCLC中最常见的遗传变异——仍然是治疗面临的主要挑战之一。TP53突变不仅导致肿瘤抑制蛋白p53功能丧失,还会赋予癌细胞新的致癌特性,导致治疗抵抗和预后不良。因此,探索TP53突变型NSCLC的新型治疗靶点成为当前研究的重点。
在这项发表于《European Journal of Medical Research》的研究中,Chen等人将目光投向了 rhomboid domain-containing 1(RHBDD1,也称为RHBDL4)——一个主要位于内质网、参与内质网相关降解(ERAD)过程的蛋白。先前的研究表明RHBDD1在多种癌症中高表达并促进肿瘤进展,但其在TP53突变型NSCLC中的具体作用机制尚不明确。研究人员推测,RHBDD1可能通过ERAD机制调控突变p53蛋白的稳定性,从而影响NSCLC的恶性进展。
为了验证这一假设,研究团队采用了多层次的研究策略:首先通过生物信息学分析141例NSCLC患者的蛋白质组学数据(来源PXD025560、PXD020548和PXD020191数据集)和TCGA转录组数据,预测RHBDD1的潜在功能;随后在TP53野生型(A549和NCI-H838)和突变型(NCI-H596和NCI-H1155)NSCLC细胞系中进行实验验证,使用shRNA敲低和过表达质粒调控RHBDD1表达,并采用Western blot、qPCR、流式细胞术、CCK-8法和免疫共沉淀等技术探究其分子机制。
主要技术方法包括:生物信息学分析(蛋白质组学和转录组学数据)、细胞培养与质粒转染、蛋白质免疫印迹(Western blot)、实时定量PCR(qPCR)、细胞活力检测(CCK-8法)、流式细胞术分析细胞周期和凋亡,以及免疫共沉淀验证蛋白质相互作用。
研究结果揭示了多个重要发现:
RHBDD1在NSCLC中负向调控细胞周期
通过生物信息学分析,研究人员发现RHBDD1高表达的NSCLC样本中细胞周期通路显著下调,而内质网中的蛋白质加工处理通路显著上调。蛋白相互作用网络分析显示p53和DNA-PKcs是这一调控网络中的关键枢纽蛋白。
RHBDD1可能通过DNA-PKcs-p53轴调控TP53突变型NSCLC细胞的细胞周期
相关性分析显示,在TP53突变样本中,RHBDD1与p53呈负相关,而DNA-PKcs与p53呈正相关。生存分析表明,低RHBDD1表达且TP53野生型的患者具有更高的总生存率。通路富集分析进一步证实,细胞周期抑制和内质网蛋白质加工激活特异性地富集在TP53突变、RHBDD1高表达的样本中。
NSCLC中p53蛋白表达对RHBDD1水平敏感
实验验证表明,在TP53突变型NCI-H596细胞中,RHBDD1敲低显著增加DNA-PKcs和p53蛋白水平,而RHBDD1过表达则降低这两种蛋白水平。这种调控在TP53野生型A549细胞中不明显。使用DNA-PKcs抑制剂STL127705或p53降解抑制剂HBX41108、Nutlin-3a处理可逆转这些效应。
RHBDD1通过降低DNA-PKcs和p53促进TP53突变型NSCLC细胞的细胞周期
细胞周期分析显示,在NCI-H596细胞中,无论是RHBDD1敲低还是过表达,都导致S期细胞周期阻滞。细胞活力实验表明,这两种干预都降低了细胞活力,STL127705处理可逆转这种效应,而Nutlin-3a则进一步增强细胞活力降低。
RHBDD1通过ERAD依赖机制降低DNA-PKcs和p53
ERAD标志物分析表明,在sh-RHBDD1组中,VCP、PERK、BIP和CHOP等ERAD相关蛋白减少,而在pcDNA-RHBDD1组中这些蛋白增加。凋亡实验显示,RHBDD1过表达抑制了顺铂诱导的凋亡,这种效应在TP53野生型和突变型细胞中均存在,但在A549细胞中更为明显。
p53与DNA-PKcs和RHBDD1的免疫共沉淀
免疫共沉淀实验证实,在TP53突变型细胞中,RHBDD1和p53与DNA-PKcs抗体的共沉淀作用更强,表明这三种蛋白在TP53突变型NSCLC细胞中的相互作用增强。
研究结论表明,RHBDD1通过ERAD依赖性下调p53和DNA-PKcs,导致TP53突变型NSCLC细胞发生细胞周期阻滞,但同时通过抑制DNA-PKcs调节的凋亡来增强细胞存活。这一发现揭示了RHBDD1在TP53突变型NSCLC中的双重作用:一方面诱导细胞周期停滞,另一方面促进肿瘤细胞生存,最终贡献于NSCLC的恶性进展。
该研究的重要意义在于首次揭示了RHBDD1通过ERAD机制同时调控p53和DNA-PKcs蛋白稳定性的新功能,为理解TP53突变型NSCLC的发病机制提供了新视角。研究结果表明,恢复DNA-PKcs表达可能抑制突变p53的促瘤作用,同时靶向RHBDD1和p53可能成为治疗TP53突变型NSCLC的潜在策略。这些发现不仅深化了对ERAD在癌症中作用的理解,也为开发针对TP53突变肿瘤的新型治疗方法提供了理论基础。
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