基于MRI灌注特征引导的优化采样策略揭示胶质母细胞瘤瘤内异质性

【字体: 时间:2025年09月27日 来源:Scientific Reports 3.9

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  为解决胶质母细胞瘤(GBM)瘤内异质性导致的术中采样偏差问题,研究人员开展了一项整合多模态MRI与全外显子测序(WES)的研究。结果表明,高PWI-CBV(灌注加权成像脑血容量)区域蕴含更丰富的私有基因突变(PGMs)和关键驱动基因事件,据此提出三部位采样策略可显著提升突变检测效率,为个体化治疗提供精准病理基础。

  
胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)作为成人中最常见的原发性中枢神经系统恶性肿瘤,占所有胶质瘤的50%以上,其治疗面临巨大挑战。尽管手术切除仍是主要治疗手段,但GBM显著的瘤内异质性(Intratumoral heterogeneity)和侵袭性特性使得完全切除极为困难,尤其位于深部脑区的肿瘤。更复杂的是,传统术中随机采样方法存在显著偏差,可能导致分子病理特征漏检,进而影响诊断准确性和治疗策略制定。
为解决这一问题,陆军军医大学西南医院等团队在《Scientific Reports》发表了一项创新研究,通过整合多模态磁共振成像(MRI)与高通量测序技术,探索了影像特征引导下的优化采样策略。研究团队招募了6例IDH野生型GBM患者,术中通过神经导航精确定位获取29个肿瘤样本,并采用全外显子测序(Whole-exome sequencing, WES)分析基因突变分布。
研究主要关键技术包括:
  1. 1.
    多模态MRI引导采样:基于对比增强T1加权(CE-T1W)和灌注加权成像脑血容量(PWI-CBV)信号特征,选择不同影像特征的区域(如T1C-high/CBV-high、T1C-low/CBV-low等)进行采样;
  2. 2.
    全外显子测序与生物信息学分析:使用Mutect2和Strelka2检测单核苷酸变异(SNVs)和短片段插入缺失(InDels),并通过VEP进行功能注释;
  3. 3.
    影像组学与无监督聚类:采用PyRadiomics提取影像特征,通过ConsensusClusterPlus进行聚类分析;
  4. 4.
    空间异质性量化:利用3D Slicer重建肿瘤空间结构,计算采样位点与肿瘤质心的距离及覆盖范围。
GBM demonstrates significant intratumoral genetic feature heterogeneity according to imaging features
研究发现GBM存在显著的瘤内遗传异质性,共检测到596个基因突变。突变分为共享基因突变(SGMs)、交叉基因突变(CGMs)和独特基因突变(UGMs),其中私有基因突变(PGMs)占比与CE-T1WI信号方差呈正相关(R=0.86, P=0.028),表明影像异质性与遗传异质性密切相关。
Characterization of the intratumoral GMH in different anatomical subregions
对近似球形生长的肿瘤分析发现,边缘区域(远离质心)的PGMs比例显著更高(R=0.71, P=0.0045),提示肿瘤边缘可能存在更高的进化异质性和侵袭性亚克隆。
Many key gene mutation events are present among PGMs
在检测到的30个癌症驱动基因突变(CDGMs)中,47.1%为PGMs,包括SETD2、TP53等关键基因;药物靶点基因突变(DTGMs)如EGFR也呈现私有性分布,凸显了多部位采样对全面捕获靶点突变的重要性。
High PWI-CBV regions included more key gene mutation events than low PWI-CBV regions
通过CBV和CE-T1W影像的无监督聚类,样本被分为CBVhigh、CBVmedium和CBVlow三组。CBVhigh组UGMs数量显著高于其他组(P<0.05),且71.6%的CDGMs集中于CBVhigh和CBVmedium区域,表明高灌注区域富含关键突变事件。
Multisite sampling of GBM impacts the GMC and the detection of PGMs
基因突变覆盖率(GMC)分析显示,三部位采样可达86.44±9.99%,显著优于单部位(61.7±10.82%);而采样点空间稀疏性与PGMs检测呈正相关(三部位:R=0.46, P=0.00046)。研究提出“植被假说”(vegetation hypothesis),将SGMs比作广泛分布的“土壤”,PGMs为局部生长的“植被”,强调需通过多部位采样全面捕获异质性突变。
研究结论表明,PWI-CBV可作为指导GBM术中采样的可靠生物标志物,优先选择高CBV区域并增加采样空间分布范围能显著提升PGMs检测效率。提出的三部位采样策略是对RANO标准的重要优化,有望为GBM的精准病理诊断和个体化治疗提供更全面的分子信息。该研究首次通过影像-基因组学整合分析,为解决GBM瘤内异质性导致的采样偏差提供了实证依据和操作框架,具有重要的临床转化价值。
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