从仙人掌土壤中分离新种Actinomadura opuntiae并重分类Actinomadura namibiensis为Actinomadura kijaniata异质同物异名
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时间:2025年09月27日
来源:Current Microbiology 2.6
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来自韩国的研究人员通过多相分类法开展放线菌新种鉴定研究,分离自济州岛仙人掌根际土壤的菌株OS1-43T被确定为马杜拉放线菌属新种,命名为Actinomadura opuntiae sp. nov.,同时通过基因组分析支持将Actinomadura namibiensis重新分类为Actinomadura kijaniata的异质同物异名,为微生物分类学提供重要依据。
研究人员从韩国济州岛 Mara 岛的仙人掌(Opuntia ficus-indica)根际土壤中分离到一株新颖的放线菌,命名为菌株 OS1-43T,并采用多相分类方法明确了其分类学地位。基于16S rRNA基因的系统发育分析显示,该菌株属于马杜拉放线菌属(Actinomadura),且与Actinomadura xylanilytica BK147T亲缘关系密切。形态学和化学分类特征也支持该菌株归属于马杜拉放线菌属。
16S rRNA基因序列相似性计算表明,菌株 OS1-43T 与Actinomadura violacea LCR2-06T相似度最高(99.1%),其次为Actinomadura xylanilytica BK147T(98.9%)。基于核心基因的基因组系统发育树显示,OS1-43T在马杜拉放线菌属内形成一个独立分支,与该属的其他代表菌株明显分开。
基因组分析显示,OS1-43T与Actinomadura montaniterrae CYP1-1BT的OrthoANIu和dDDH值最高(分别为90.1%和40%),随后依次为Actinomadura physcomitrii LD22T(89.8%和38.7%)、Actinomadura nitritigenes L46T(89.8%和38.6%)和Actinomadura violacea LCR2-06T(89.7%和38.1%),尽管前三个模式菌株与OS1-43T的16S rRNA基因序列相似性较低(97.5–98.0%)。
综合表型特征、系统发育分析结果和整体基因组相关性指标,菌株 OS1-43T(=KACC 19750T=NBRC 114686T)被鉴定为马杜拉放线菌属的一个新种,命名为Actinomadura opuntiae sp. nov.。此外,基因组分析及相近的表型特征支持将Actinomadura namibiensis Wink et al. 2003重新分类为Actinomadura kijaniata Horan and Brodsky 1982的异质同物异名。
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