人源肠道新菌种Coprococcus intestinalis与Parabacteroides caecihominis的益生特性及功能研究

　　研究人员从人类粪便样本中分离出三株新型细菌（B2-R-112T、TA-V-105T和B2-R-115），通过多组学分析证实其具有优异的胃肠耐受性（pH 2.5–8.0）、抗氧化、抗糖尿病和抗炎症活性，并基于dDDH/ANI阈值（≥70%/≥95%）提出两个新物种命名，为益生菌开发提供重要候选资源。

　　

从人类粪便样本中分离的三株新型细菌（包括一株革兰氏阳性菌B2-R-112^T和两株革兰氏阴性菌TA-V-105^T、B2-R-115）被鉴定为严格厌氧且无运动性。基于16S rRNA（16S ribosomal RNA）基因的系统发育分析表明，它们分别属于Coprococcus、Parabacteroides和Akkermansia属。其中B2-R-112^T与Coprococcus catus L8^T的序列相似度为97.7%，TA-V-105^T与Parabacteroides goldsteinii DSM 19448^T相似度为97.8%，而B2-R-115与“Akkermansia massiliensis” Marseille P6666^T的相似度高达99.6%。三株菌的基因组大小分别为3,311,086 bp、7,396,255 bp和3,288,486 bp，GC（Guanine-Cytosine）含量分别为43.9%、43.2%和57.8%。所有菌株在pH 2.0–3.0环境下均表现出强存活能力，并能耐受0.3% w/v的牛胆盐（oxgall）达4小时，在模拟胃液（pH 2.5，4小时）和肠液（pH 8.0，6小时）中保持高存活率。此外，它们还具有显著的抗氧化、抗糖尿病（antidiabetic）和抗炎症（anti-inflammatory）活性。通过数字化DNA-DNA杂交（dDDH）和平均核苷酸一致性（ANI）分析（阈值分别为≥70%和≥95%），支持将B2-R-112^T和TA-V-105^T归类为新物种。基于上述表型、基因组和系统发育研究，这些潜在益生菌被正式提议命名为：Coprococcus intestinalis sp. nov.（模式菌株B2-R-112^T = KCTC 25419^T = CGMCC 1.17967^T）和Parabacteroides caecihominis sp. nov.（模式菌株TA-V-105^T = KCTC 25451^T = CGMCC 1.17989^T）。