从绿萝根际土壤中分离鉴定新种Pseudoduganella rhizocola及其系统发育与基因组特征分析

　　来自韩国的研究人员从绿萝根际土壤中分离出一株新型细菌SM-13T，通过多相分类研究确定其为假杜盖氏菌属新种，命名为Pseudoduganella rhizocola sp. nov.。该研究解析了其生理生化特征、脂肪酸组成、极性脂质分布及基因组信息，为根际微生物资源开发与分类学提供了重要依据。

　　

研究人员从韩国水原地区的绿萝（Epipremnum aureum）根际土壤中分离到一株编号为SM-13^T的新型细菌。该菌株为革兰氏阴性（Gram-stain-negative）、好氧、具运动性、杆状、乳白色，且氧化酶（oxidase）和过氧化氢酶（catalase）均为阳性。SM-13^T的生长温度范围为15–37°C（最适25°C），pH适应范围为6.0–9.0（最适pH 7.0），可在0–0.5%（w/v）氯化钠浓度下生长（最适0%）。

基于基因组和16S rRNA基因序列的系统发育分析表明，该菌隶属于草酸杆菌科（Oxalobacteriaceae），与Pseudoduganella humi THG S6-8^T（相似度97.8%）、P. violacea CAVIO^T（97.7%）、P. buxea A9^T（97.6%）、P. dura 16^T（97.5%）、P. umbonata LP01^T（97.5%）及P. lurida D5^T（97.4%）亲缘关系最近。其主要泛醌为Q-8，极性脂质包括磷脂酰乙醇胺（phosphatidylethanolamine, PE）、磷脂酰甘油（phosphatidylglycerol, PG）、二磷脂酰甘油（diphosphatidylglycerol, DPG）、氨基脂质（amino lipids, AL）以及未知脂质L1与L2。脂肪酸组成中以 summed feature 3（C_16:1 ω7c / C_16:1 ω6c，占51.9%）和C_16:0（占18.7%）为主。

该菌株基因组草图大小为5,401,088 bp（27个contig），注释出4,880个蛋白质编码基因、59个tRNA基因和2个rRNA基因，基因组DNA G+C含量为64%。综合上述特征，SM-13^T被鉴定为假杜盖氏菌属（Pseudoduganella）的一个新种，命名为Pseudoduganella rhizocola sp. nov.，模式菌株为SM-13^T（=KCTC 8734^T = TBRC 19389^T = KEMB 24220^T）。其16S rRNA基因和基因组序列登录号分别为PQ198503和JBJQIK000000000。