鱼类致病性奇异变形杆菌(COFI-RLBCAU-II)全基因组测序及多重耐药基因解析

　　本研究报道了从患病露斯塔野鲮中分离的多重耐药奇异变形杆菌COFI-RLBCAU-II（CP181371），通过牛津纳米孔PromethION平台完成全基因组测序，解析其3.93 Mb基因组结构及14种耐药基因，为水产养殖病原防控及耐药机制研究提供重要参考。

　　

研究人员从印度中央邦达蒂亚地区患病露斯塔野鲮(Labeo catla)中分离出一株革兰阴性杆菌，经生化鉴定和16S rRNA基因测序确认为奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)。该菌株展现多重耐药特性，且具备人兽共患潜力。

通过牛津纳米孔PromethION P2 Solo测序平台进行全基因组测序(Whole-Genome Sequencing, WGS)，使用Dorado v0.9.6进行碱基识别，Flye v2.9.5完成基因组组装。最终获得包含1条染色体和3个质粒的完整基因组(总长度3.98 Mb)，覆盖度达1737X，GC含量38.66%。注释分析显示基因组包含3,491个蛋白编码基因、90个tRNA和22个rRNA。

耐药基因分析发现14个抗菌素耐药基因(Antimicrobial Resistance Genes)，包括cat（氯霉素耐药）、aadA（氨基糖苷类耐药）、dfrA1（甲氧苄啶耐药）、tetJ（四环素耐药）等，涉及 fosfomycin、carbapenems 等多类抗生素。同时鉴定出11个毒力相关基因。系统发育分析表明该菌株与来自中国、美国、德国等地的菌株亲缘关系密切。

基因组数据已保存于NCBI（BioProject: PRJNA1207781；登录号：CP181371-CP181374），为水产病原菌耐药性进化及跨物种传播机制研究提供重要资源。