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糖酵解与组蛋白乳酸化之间的相互作用驱动TXNIP-NLRP3介导的PANoptosome组装及PANoptosis激活过程,这一机制是糖尿病视网膜病变发病机制的基础
糖尿病视网膜病变(Diabetic Retinopathy, DR)是糖尿病最常见的并发症之一,也是全球成年人失明的主要原因之一。随着糖尿病发病率的持续上升,DR的发病机制研究显得尤为重要。本研究通过探讨糖酵解、组蛋白乳酰化以及PANoptosis之间的相互作用,揭示了DR的分子机制,为未来开发新的治疗策略提供了理论依据。研究主要聚焦于视网膜色素上皮细胞(RPE)在DR发展中的作用,并进一步分析了高血糖环境下这些细胞如何通过复杂的信号通路引发细胞死亡和炎症反应,最终导致视网膜功能受损。RPE细胞作为视网膜的重要组成部分,其功能与视网膜屏障的完整性密切相关。它们不仅参与营养物质的运输和代谢,还在
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外周血单细胞转录组图谱揭示了由B细胞驱动的特征,该特征可用于预测急性胰腺炎的严重程度
急性胰腺炎(AP)是一种由胰腺外分泌部分引发的炎症性疾病,其严重程度的早期预测仍是临床的一大挑战。AP的发病机制复杂,涉及多种免疫细胞的异常反应,包括炎症因子的释放、免疫细胞的激活与失衡,以及局部组织的坏死与感染。目前,临床常用的评估方法如系统性炎症反应综合征(SIRS)、急性胰腺炎严重程度床边指数(BISAP)、急性生理与慢性健康评价II(APACHE II)、改良Marshall评分和计算机断层扫描严重程度指数(CTSI)虽然在一定程度上有助于判断AP的严重程度,但它们在早期识别高风险患者方面仍存在局限性。因此,研究者们开始探索基于免疫细胞标志物和分子改变的新方法,以提高对AP严重程度的预
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氯喹类免疫调节药物通过特异性靶向G-四链体抑制c-myc转录以遏制癌症进展的机制研究
癌症一直是人类健康面临的重大威胁,尤其许多恶性肿瘤存在基因突变和异常高表达的致癌基因,例如c-myc在约70%的癌症中过度表达,推动肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭。然而,直接靶向c-myc蛋白极具挑战,因其缺乏明确的小分子结合位点且半衰期极短。近年来,研究者们逐渐将目光转向DNA的非标准二级结构,例如G-四链体(G-quadruplex, G4),它是由鸟嘌呤富集序列在单价阳离子存在下折叠形成的特殊结构,广泛存在于包括c-myc在内的多种癌基因启动子区域。稳定这些G4结构可有效抑制基因转录,因此G4稳定剂被视为一种有前景的抗癌策略。然而,尽管已开发出多种G4配体,但因生物相容性差、药代动力学不佳等
来源:Journal of Biological Chemistry
时间:2025-09-27
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综述:II型聚酮合酶对人类健康的影响、当前认知与未来方向
为什么关注天然产物?天然产物(NP)长期以来是人类社会的重要组成部分,从香料到拯救生命的药物均有涉猎。早在公元前2600年,美索不达米亚就有使用天然产物(主要是植物)作为药物的记录。1928年亚历山大·弗莱明发现青霉素,并在二战中展现出显著疗效,真正开启了天然产物药物发现的“黄金时代”。从1940年代到1970年代,默克、施贵宝、礼来和辉瑞等大型工业公司推动了青霉素的大规模生产,促进了药物发现的蓬勃发展。1985年,重组DNA技术的进步使得从土壤细菌天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)中首次克隆了整个生物合成基因簇(BGC),随后通过混合不同BGC元件成功创建了新化合
来源:Journal of Biological Chemistry
时间:2025-09-27
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一种新型的TDP-43基因猪模型能够模拟多种与ALS(肌萎缩侧索硬化症)相似的关键特征
这项研究提出了一种新的、高效的动物模型,用于模拟人类渐冻症(ALS)的病理特征。ALS是一种严重的神经退行性疾病,其主要特征是上运动神经元和下运动神经元的进行性退化,导致肌肉无力、萎缩和最终的瘫痪。尽管已有多种动物模型被用于研究ALS的发病机制和治疗策略,但目前仍缺乏能够全面复制人类ALS病理特征的模型。因此,研究者们开发了一种基于转基因病毒注射的猪模型,以期更准确地模拟人类ALS的病理过程。猪与人类在解剖结构、生理功能、免疫系统和基因组成方面具有高度相似性,这使得它们成为研究人类疾病的重要工具。特别是,猪的神经系统结构更接近人类,这使得其在模拟神经退行性疾病方面具有显著优势。与传统的啮齿类动
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综述:G蛋白偶联受体信号传导:在癌症中的意义及治疗进展
G蛋白偶联受体(GPCRs)作为人类基因组中最大的蛋白质家族之一,广泛存在于细胞膜上,负责将细胞外的多种刺激转化为细胞内的生物反应。它们的保守七跨膜(7TM)结构使得这些受体能够与多种配体和细胞内效应物相互作用,从而启动复杂的细胞内信号网络。这些信号网络调控着包括癌症在内的多种生理和病理过程。GPCRs在癌症治疗中的重要性源于其在细胞增殖、存活、迁移和治疗抵抗等方面的关键作用。通过调控这些受体的信号输出,科学家们希望开发出更加精准和有效的抗癌药物。### GPCRs的分类与功能GPCRs根据其结构和功能被分为不同的类别,例如A类(如视紫红质受体)、B类(如分泌素受体)、C类(如粘附受体和谷氨酸
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PACLseq:一种基于纳米孔测序技术的Ph样急性淋巴细胞白血病的独立诊断方法
在临床诊断中,Philadelphia chromosome–like acute lymphoblastic leukemia(Ph-like ALL)是一种重要的白血病亚型,其诊断和治疗方案的选择高度依赖于对相关融合基因的准确检测。Ph-like ALL的特征在于缺乏典型的Philadelphia染色体(即BCR::ABL1融合),但其基因表达谱与Ph+ ALL(携带BCR::ABL1融合的急性淋巴细胞白血病)非常相似。这种疾病在儿童中约占10%–20%,在成人中约占20%–30%,并且与较高的复发率和较差的预后密切相关。因此,对于Ph-like ALL的早期诊断和及时干预至关重要。然而,
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综述:脂肪源性干细胞的多组学特征与表观遗传修饰
Omics Characteristics and Epigenetic Modifications of Adipose-Derived Stem CellsIntroduction脂肪源性干细胞(ADSCs)作为多能干细胞,具有自我更新和分化为多种细胞谱系的能力,包括脂肪细胞、成骨细胞、神经元和平滑肌细胞,在组织再生中展现出巨大潜力。近年来,多组学技术的进步通过转录组、蛋白质组和脂质组分析深化了我们对ADSC分子特征的理解。此外,表观遗传修饰——在不改变DNA序列的情况下介导基因表达的可遗传变化——在ADSC的多系分化过程中扮演关键角色。Omics-based analyses chara
来源:Journal of Biological Chemistry
时间:2025-09-27
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基于元路径引导与自适应负采样增强的药物重定位框架DRMGNE:提升药物-疾病关联预测的创新策略
HighlightDRMGNE创新性地融合元路径引导与自适应负采样增强技术,为药物-疾病关联预测领域提供突破性解决方案。Introduction药物发现是现代医学进步的核心驱动力。传统药物研发过程缓慢、成本高昂且失败率高[1]。为应对这些挑战,药物重定位(drug repurposing)已成为一种前景广阔的策略,其通过挖掘现有药物的新治疗用途[2],具备开发周期短、成本低和获批概率高等优势[3]。近年来,计算药物重定位(computational drug repurposing)利用创新计算技术和海量生物医学数据系统识别潜在药物-疾病关联(DDAs)[4][5][6],标志着药物研发领域的
来源:Journal of Biomedical Informatics
时间:2025-09-27
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LFVDNet:基于低频变量驱动的医疗时间序列缺失值填补与预测模型研究
Highlight• LFVDNet是首个强调有效利用低频采样变量(LFSVs)的多变量时间序列缺失值分析方法• 时间感知填补器(TA)通过时间点间相关性进行填补并采用通道独立策略• 偏移选择模块(OS)基于数据点选择策略执行选择性填补,减少误差并简化序列Introduction电子健康记录(EHRs)存储了大量医疗时间序列数据,这些序列通过提供患者状态的连续视图,在现代医疗中发挥着关键作用。然而医疗时间序列作为多变量时间序列存在缺失值,会阻碍分析并降低模型性能。当前"先填补后预测"的端到端架构存在困境:选择较少时间点会导致填补数据代表性不足,选择过多点则会引入较大误差。Blázquez-Ga
来源:Journal of Biomedical Informatics
时间:2025-09-27
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基于方向约束扩散薛定谔桥的单细胞扰动响应预测模型及其在基因调控网络与药物发现中的应用
亮点陈述引言单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术能够以高分辨率表征细胞对外部扰动的响应,支持系统性追踪转录反应、识别调控通路及发现治疗靶点[1,2,3]。这些进展不仅推动基础生物学研究,更为生物医学信息学奠定基础,支撑数据驱动的药物发现、临床决策支持与精准医疗[4,5,6]。随着Perturb-seq和sci-Plex等高通量扰动技术的出现,基于扰动的实验已成为机制探索的强大工具[7,8,9]。单细胞扰动建模的核心挑战在于实现分布外(OOD)泛化,即预测训练集中未出现的扰动条件下的细胞响应。仅依赖实验策略在此类场景中仍有局限,计算建模成为扩展预测能力的关键补充[8,10]。近期研究通过潜
来源:Journal of Biomedical Informatics
时间:2025-09-27
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双通路模型跨尺度语义融合集成在药物重定位(Drug Repositioning)中的创新应用
亮点我们计算元路径可达性和边置信度以生成增强边,有效解决网络边缘稀疏问题。我们设计了一个双分支网络,捕获多尺度特征,从完整的药物-疾病-蛋白质网络中提取拓扑特征信息,同时挖掘子图中的显著特征信息。提出自适应残差图注意力(Adaptive Residual Graph Attention),在信息传播过程中进行自我调节,显著提高稳定性和泛化能力。设计评分驱动Top-K卷积图池化(Score-Driven Top-K Convolutional Graph Pooling),筛选最关键节点,减少冗余信息。异质网络构建我们将异质图定义为三元组 G=(V,E,F),其中 V={Vdr, Vdi, Vp
来源:Journal of Biomedical Informatics
时间:2025-09-27
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术中皮质类固醇给药对可切除胃癌患者预后的影响:一项多中心随机开放标签II/III期研究的回应与阐释
胃癌是全球范围内最具挑战性的恶性肿瘤之一,尤其对于可切除胃癌患者,术后并发症和长期生存率仍是临床关注的焦点。近年来,围术期炎症反应调控逐渐成为改善外科预后的重要研究方向。尽管术前新辅助化疗和术后辅助化疗方案不断优化,但术中管理策略尤其是免疫调节干预的价值尚未得到充分验证。在此背景下,日本研究团队开展了这项旨在评估术中皮质类固醇给药对可切除胃癌患者预后影响的多中心临床研究。该研究采用多中心、随机、开放标签的II/III期试验设计,纳入来自日本23家医疗中心的603例可切除胃癌患者。研究对象按1:1比例随机分配至干预组(术中静脉注射地塞米松)或对照组(常规手术)。主要终点为II期部分的术后90天内
来源:Gastric Cancer
时间:2025-09-27
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综述:胃切除术中的教科书结局:有用指标还是移动靶点?一项范围综述
背景胃切除术是胃癌治疗的核心手段,传统质量指标如死亡率和并发症率难以全面反映治疗质量。复合指标教科书结局(Textbook Outcome, TO)及其肿瘤学版本(Textbook Oncological Outcome, TOO)应运而生,旨在通过多维度整合评估“理想”的手术过程。TO最初由Dijs-Elsinga提出,强调患者倾向的无并发症围手术期过程,后经Kolfschoten在结直肠手术中正式定义。荷兰上消化道癌症审计(DUCA)小组将其适配于胃食管手术,定义了包括R0切除、≥15枚淋巴结检出、无严重并发症(Clavien-Dindo≥II级)、无30天再入院等10项标准。TOO则进一
来源:Gastric Cancer
时间:2025-09-27
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基于肿瘤表型分型揭示食管胃结合部癌分子特征与免疫微环境的新视角
基于肿瘤表型的分型方法为食管胃结合部癌(Esophagogastric Junction Cancer, EGJ)提供了全新的分子特征解析视角。研究背景显示,全球范围内EGJ癌发病率持续上升,其中Siewert II型涵盖肠型与胃型两种表型,但二者的分子图谱与临床病理特征尚未明确。研究方法涵盖对2014至2023年间接受手术切除的922例EGJ或胃癌患者的分析。通过免疫组化(Immunohistochemistry)技术将肿瘤划分为肠型与胃型表型,并采用全外显子测序(Whole-Exome Sequencing)进行分子 profiling,系统探索了临床病理特征、突变模式、免疫应答及生存结局
来源:Gastric Cancer
时间:2025-09-27
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角蛋白细胞自噬介导的自组装四面体框架核酸可促进伤口愈合并减少疤痕增生
创伤往往会导致伤口形成和瘢痕增生,而这一过程可能对患者的健康和生活质量产生深远影响。在伤口愈合过程中,如果细胞无法有效修复受损组织,可能会引发一系列并发症,如慢性伤口、瘢痕过度增生,甚至发展为瘢痕癌等严重问题。因此,探索能够促进伤口愈合并减少瘢痕形成的新型治疗方法具有重要的临床意义。近年来,研究人员发现一种基于DNA结构的新型纳米材料——四面体框架核酸(tFNA)在多种疾病治疗中表现出良好的效果,但其对伤口愈合的具体作用机制尚未完全明确。本研究旨在探讨tFNA对人类永生化表皮细胞(HaCaT细胞)和伤口愈合的影响,通过体外实验与体内实验相结合的方式,揭示其在促进伤口修复和减少瘢痕形成中的作用。
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综述:中性粒细胞在稳态和疾病中的作用
### 高等生物免疫细胞——中性粒细胞:在生理平衡与疾病发展中的双重角色中性粒细胞是哺乳动物体内先天免疫系统中占主导地位的一类免疫细胞,它们在清除病原体和维持机体稳态方面发挥着至关重要的作用。近年来,随着对中性粒细胞在癌症及其他非肿瘤性疾病中的作用研究不断深入,科学家们发现这些细胞并非单一功能的“清道夫”,而是在不同疾病阶段展现出复杂的动态变化。中性粒细胞在癌症的发展过程中既可能抑制肿瘤生长,也可能促进其发展,这种双重功能使得它们成为研究的重要对象。此外,中性粒细胞还广泛参与感染、自身免疫疾病、神经退行性疾病和代谢疾病等非肿瘤性疾病的进程,表明它们在维持机体健康与应对疾病方面具有广泛而深远的影
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针对Pkp2缺陷的基因疗法可减轻心脏纤维化:来自Pkp2敲除大鼠单细胞转录组学的见解
心脏衰竭(Heart Failure, HF)是一种多种心血管疾病终末期表现,通常表现为心脏结构重塑和功能障碍的临床综合征,其中心肌纤维化是疾病进展的重要标志。尽管HF的病因具有多样性,包括缺血性损伤、压力负荷增加和遗传性心肌病等,但它们在病理生理机制上存在共性,如心肌细胞凋亡、纤维化替代以及电机械不同步等。当前的治疗策略,如神经内分泌阻断(β受体阻滞剂、ACEI/ARB、ARNI、醛固酮受体拮抗剂)和利尿剂,主要提供症状缓解,却对阻止纤维化重塑的效果有限。因此,探索更具针对性的抗纤维化干预手段,成为改善HF患者预后的关键。心脏的结构和功能依赖于多种复杂的细胞间连接,其中桥粒(desmosom
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综述:线粒体相关的内质网膜在健康与疾病中的作用
膜接触位点(Membrane Contact Sites, MCSs)是细胞内不同细胞器之间密切接触的区域,它们通过特定的蛋白质组成来稳定这种相互作用,从而协调细胞器之间的功能。在众多MCSs中,线粒体-内质网膜接触位点(Mitochondria-Associated ER Membranes, MAMs)尤为关键,它在生理和病理环境中都发挥着重要作用。MAMs参与多种细胞过程,包括钙离子(Ca²⁺)转运、脂质代谢、内质网应激反应、氧化应激调控、线粒体动态变化以及线粒体自噬(mitophagy)。当MAMs的组成成分调控失常时,疾病的发病率会显著上升。本文旨在阐述MAMs蛋白在健康状态下的功能
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基于骨密度的联合模型用于非小细胞肺癌患者接受免疫检查点抑制剂治疗后的无创预后预测:一项多中心回顾性研究
本研究聚焦于非小细胞肺癌(NSCLC)患者在接受免疫检查点抑制剂(ICI)治疗过程中,基线骨矿物质密度(BMD)和治疗后BMD下降(BMDD)的预后价值。通过整合多中心数据,研究团队构建了一个结合BMD/BMDD与临床特征的联合模型,用于非侵入性地预测NSCLC患者的疗效和预后情况。研究还通过转录组学分析探讨了BMD在免疫治疗中的潜在生物学机制。这些发现为免疫治疗的临床决策提供了新的工具,并有助于更精准地进行患者风险分层。### 骨矿物质密度与免疫治疗预后的关系研究纳入了2096名接受ICI治疗的晚期NSCLC患者,构建了一个影像-预后队列,并通过基因表达数据与影像学特征的匹配,形成了另一个影