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  • 基于结构导向设计与三重分子动力学评估的SARS-CoV-2主蛋白酶突变肽抑制剂研究

    全球健康危机背景下,SARS-CoV-2主蛋白酶(Mpro)因其在病毒复制中的关键作用成为药物开发的核心靶点。本研究通过理性设计,对天然底物Nsp10/11切割位点肽(QLMPER)进行突变改造,构建包含214种突变肽的分子库。其中25种单突变肽和70种多突变肽展现出与Mpro的强相互作用。通过分子对接评分、三重100纳秒分子动力学(MD)模拟及分子力学-广义玻恩表面积(MM–GBSA)结合自由能计算,团队锁定四种最优多突变肽。令人瞩目的是,突变肽M3(FLFPFR)以−34 kcal/mol的结合自由能大幅超越野生型肽(−4.28 kcal/mol),其复合物在动态模拟中展现出卓越的结构稳定

    来源:In Silico Pharmacology

    时间:2025-09-16

  • 甜瓜(Cucumis melo)植物化学成分通过调控内质网应激治疗糖尿病肾病的网络药理学与生物信息学解析

    这项突破性研究采用多学科交叉策略,深入探究了甜瓜(Cucumis melo, CM)中天然活性成分对抗糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy, DN)的分子奥秘。通过系统生物学方法,科研团队构建了CM植物化学成分-靶点-疾病的三维网络图谱,从685个初始数据中精准锁定41个具有治疗潜力的植物化学成分,包括黄酮类eriodictyol和姜黄素(curcumin)等明星分子。研究亮点在于发现CM可通过调控内质网应激(Endoplasmic Reticulum Stress, ER stress)关键通路干预DN进展。蛋白互作网络(PPI network)分析揭示15个核心靶点,其中A

    来源:In Silico Pharmacology

    时间:2025-09-16

  • 基于胶原衍生基质因子(matrikine)生成预测及其与整合素αMβ2结合功能的结肠癌恶性进展计算生物学研究

    结肠癌作为全球癌症相关死亡的第二大诱因,其转移过程与细胞外基质(ECM)重塑密切相关。这项研究另辟蹊径,不再局限于传统核心基质蛋白(core matrisomes)研究,而是通过计算机模拟手段,聚焦胶原蛋白降解产生的生物活性片段——基质因子(matrikines)的生成机制及其功能。研究团队构建了完整的计算生物学分析链条:以I型(COL1A1/COL1A2)和III型(COL3A1)胶原为前体蛋白,膜型基质金属蛋白酶(MMP14)作为剪切酶,整合素αMβ2(又称Mac-1)作为受体,钙调结合蛋白(CALD1)作为下游效应分子。通过计算机模拟胶原蛋白的酶切过程,对产生的片段进行三维结构预测,再与

    来源:In Silico Pharmacology

    时间:2025-09-16

  • 姜黄素差异化抑制KPC-3、L2和CTX-M-15 β-内酰胺酶的分子机制及结构动力学研究

    随着革兰阴性病原体中β-内酰胺酶(β-lactamase)介导的耐药性日益严峻,寻找新型抑制剂已成为保障抗生素疗效的迫切需求。这项研究通过计算生物学手段,揭示了天然化合物姜黄素(curcumin)作为A类丝氨酸-β-内酰胺酶(SBLs)广谱抑制剂的分子机制。研究团队采用分子对接和长达200纳秒的分子动力学模拟,深入解析姜黄素与三种关键临床β-内酰胺酶(KPC-3、CTX-M-15和L2)的相互作用。令人振奋的是,姜黄素对三者均表现出强结合力,其中对L2的抑制尤为突出(结合自由能ΔG=-7.67 kcal/mol),这主要归功于显著的范德华相互作用(-115.03 kJ/mol)以及围绕催化残基

    来源:In Silico Pharmacology

    时间:2025-09-16

  • 蜜豆树与山矾植物成分在COVID-19相关类风湿性关节炎(CARA)治疗中的潜力研究

    全球持续肆虐的COVID-19不仅带来深远的社会经济影响,更与其他疾病形成复杂的"共病征"关系。类风湿性关节炎(RA)这种慢性自身免疫疾病在疫情期间发病率显著上升,患者对新冠病毒的易感性也明显增高,由此催生了"COVID-19相关类风湿性关节炎(CARA)"的新概念。传统药用植物蜜豆树(Prosopis glandulosa)和山矾(Symplocos racemosa)中的植物活性成分成为研究焦点。通过精准的分子对接和模拟技术,科学家们锁定了6个与RA和COVID-19密切相关的炎症靶点:白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)

    来源:In Silico Pharmacology

    时间:2025-09-16

  • 穿心莲抗猴痘病毒靶点的治疗潜力:基于计算模拟的突破性发现

    猴痘病毒(Monkeypox virus, MPXV)引发的 zoonotic 传染病正成为全球公共卫生新挑战。截至2023年11月,这场疫情已席卷116个国家,累计报告92,783例确诊病例和171例死亡病例。面对抗病毒药物的短缺局面,具有广谱抗微生物活性的穿心莲(Andrographis paniculata)进入了研究视野。科研团队运用计算生物学手段,从蛋白质数据库(PDB)中调取4E90、8B07、8C9K等5个关键病毒蛋白结构,通过Schrödinger Suite软件平台进行分子动力学模拟。轨迹分析显示,穿心莲内酯(andrographolide)、木犀草素(luteolin)和穿

    来源:In Silico Pharmacology

    时间:2025-09-16

  • 靶向KRAS及其G12R突变体的变构与SI/II位点强效抑制剂开发研究

    KRAS作为Ras家族GTP酶的关键成员,在调控细胞生长、存活和分化中发挥核心作用。G12R等KRAS突变与癌症发生密切相关,但由于其表面平滑且与核苷酸结合力强,长期以来被视为难以药物靶向的"不可成药"靶点。最新研究发现变构口袋和Switch-I/Switch-II(SI/II)区域等新型结合位点,为药物开发提供了新思路。研究团队采用计算生物学组合策略,针对KRAS及其G12R突变体开展抑制剂筛选。虚拟筛选结果显示,NSC 374,037、NSC 655,101、V016-9984和N060-0122四种化合物表现出超越Sotorasib等已知抑制剂的结合亲和力。通过分子动力学模拟分析,这些化

    来源:In Silico Pharmacology

    时间:2025-09-16

  • 苯亚甲基噁唑并[3,2-a]嘧啶衍生物:新型抗炎剂的合成、量子模拟与分子对接研究

    这项突破性研究设计出三种结构精巧的苯亚甲基噁唑并[3,2-a]嘧啶衍生物:(Z)-6-苯甲酰基-2-亚苄基-5,7-二苯基-5H-噁唑并[3,2-a]嘧啶-3(2H)-酮(C1)、其3,4-二甲氧基(C2)和4-氟(C3)取代变体。通过"一锅煮"的Hantzsch杂环化与Knoevenagel缩合反应,这些分子骨架被巧妙构建,并经FTIR、核磁共振(1H-NMR/13C-NMR)等现代分析技术严格验证。量子化学模拟揭开分子奥秘:采用B3LYP/6-311G+(d,p)基组计算显示,这些化合物具有独特的HOMO-LUMO能隙、分子静电势(MEP)分布和福井函数特征。特别有趣的是,蒙特卡洛模拟发现

    来源:In Silico Pharmacology

    时间:2025-09-16

  • 综述:高血压性急性心力衰竭:定义、流行病学、病理生理学和预后的批判性视角——罗马尼亚心脏病学会联合会议专题述评(第二部分)

    引言140 mmHg伴急性肺充血,但注册研究显示35-50%的AHF患者符合此标准却未被归类为HT-AHF。定义争议与流行病学160 mmHg。病理生理机制长期高血压导致的心血管重构构成HT-AHF的病理基础:1.心室-动脉硬化:主动脉顺应性下降使左室舒张末压(LVEDP)敏感性增强,微小容量变化即可引发肺充血。HFpEF患者尤为显著,其心室-动脉弹性比值(Ea/Ees)异常升高。2.微循环障碍12.6 mg/L的炎症状态共同加剧器官损伤。3.压力依赖性:脾静脉α1受体介导的血管收缩可瞬时转移800mL血液至肺循环,这在"血管衰竭"患者中尤为突出。值得注意的是,Ghandi研究证实急性肺水肿患

    来源:Heart Failure Reviews

    时间:2025-09-16

  • 综述:癌症患者化疗诱导性心肌病的心脏再同步治疗:小型回顾

    引言化疗在癌症治疗中可能导致心肌病(CHIC),其特征是左心室(LV)功能下降并引发心力衰竭(HF)。发病率约为5-10%,风险因素包括高龄、合并症及蒽环类药物(如多柔比星)的累积剂量。CHIC的机制涉及细胞凋亡加速、线粒体功能障碍和钙离子调控异常,部分患者还表现为LV机械不同步。左心室逆重构早期研究证实,CRT可显著改善CHIC患者的LV功能。例如,Ajijola的病例系列首次报道了4例CHIC患者在CRT后LVEF提升。后续研究(如Rickard等)显示,CRT使LV舒张末期内径(LVEDD)和收缩末期内径(LVESD)分别减少0.5 cm和0.7 cm,LVEF平均提高8.6%。MADI

    来源:Heart Failure Reviews

    时间:2025-09-16

  • 综述:心衰治疗中的复方制剂:简化治疗路径与改善依从性和预后的新策略

    引言心衰(HF)全球患者超6400万,尽管指南导向药物治疗(GDMT)可改善预后,但多药治疗(polypharmacy)导致依从性不足——45%患者存在漏服现象。复方制剂(polypill)作为创新解决方案,将核心药物(如ACEI/ARB、β受体阻滞剂、MRA、SGLT2i)整合为单一片剂,有望突破这一困境。复方制剂的临床逻辑心衰GDMT需4类基础药物,但90%患者合并≥3种共病(如糖尿病、房颤),使得平均用药数达10种以上。超40%老年患者因药物复杂性停药,导致再住院风险增加32%。复方制剂通过以下机制发挥作用:1.简化流程:单一片剂替代多药分次服用,尤其适合记忆衰退的老年群体;2.经济性:

    来源:Heart Failure Reviews

    时间:2025-09-16

  • 综述:心力衰竭中的低白蛋白血症:病理生理学、临床意义和管理策略

    病理生理机制低白蛋白血症(血清白蛋白<3.5 g/dL)在心力衰竭(HF)患者中发生率高达30%,其发生涉及多因素协同作用:1.营养不良:HF患者因肠道灌注不足导致吸收障碍,同时厌食症和代谢需求增加引发负氮平衡2.肝淤血:右心衰竭时中心静脉压升高抑制肝细胞白蛋白合成(产能下降40-60%)3.炎症状态:肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白介素-6(IL-6)等促炎细胞因子加速白蛋白分解4.蛋白丢失性肠病(PLE):肠黏膜水肿导致白蛋白经肠道异常丢失,每日可达15-30g临床影响低白蛋白血症通过双重机制恶化HF预后:•血流动力学效应:血浆胶体渗透压每降低5 mmHg,肺毛细血管楔压(PCWP)相应

    来源:Heart Failure Reviews

    时间:2025-09-16

  • 综述:射血分数保留型心力衰竭中肺动脉高压的评估

    Abstract射血分数保留型心力衰竭(HFpEF)已成为当代临床实践中肺动脉高压(PH)最常见的病因。HFpEF相关PH的高发病率显著增加了PH评估的复杂性,特别是在合并1类PH危险因素的情况下。当前研究正致力于揭示其独特的病理生物学特征,为精准诊疗提供新视角。病理生理学特征HFpEF-PH的发病机制呈现多维度特点:左心室舒张功能障碍导致左房压力升高,通过肺静脉逆向传导引发毛细血管后PH;同时,肺血管重构(PVR)可能进一步加重毛细血管前PH成分。值得注意的是,约30%患者存在混合型PH特征,这种血流动力学异质性对治疗选择构成重大挑战。诊断评估策略20 mmHg且肺血管阻力(PVR)≥2 W

    来源:Heart Failure Reviews

    时间:2025-09-16

  • 综述:口腔鳞状细胞癌微转移与孤立肿瘤细胞:新兴技术对淋巴结分期的精细化

    AbstractPurpose颈部淋巴结转移是口腔鳞状细胞癌(OSCC)预后的关键决定因素,直接影响临床分期和治疗策略。尽管前哨淋巴结活检(SLNB)在黑色素瘤和乳腺癌中已成熟应用,但其对OSCC微转移(0.2–2 mm)和孤立肿瘤细胞(ITCs, <0.2 mm)的临床价值仍存争议。本综述旨在解析这些微小转移灶的生物学特性,并探讨新兴检测技术对精准分期的推动作用。Methods通过系统分析SLNB在OSCC中的研究数据,整合组织病理学技术(如连续切片和免疫组化)、分子标志物(如循环肿瘤DNActDNA)以及人工智能驱动的放射组学工具,评估其对隐匿转移检测效能的提升。Results现有证据显示

    来源:Head and Neck Pathology

    时间:2025-09-16

  • 唾液腺母细胞瘤中FGFR2和PIK3CA突变的分子特征及其临床意义研究

    唾液腺母细胞瘤是一种极其罕见的先天性低度恶性唾液腺肿瘤,通常在出生时或婴儿早期发病。这种肿瘤的临床行为具有高度异质性,从局部生长到侵袭性转移均有可能发生。由于病例稀少,其分子特征长期以来缺乏系统研究。既往零星报道曾发现FGFR2、PIK3CA和HRAS等基因可能存在突变,但样本量有限难以形成共识。更关键的是,这些分子改变与肿瘤临床行为的关联性尚不明确,导致临床医生难以制定个体化治疗方案。为填补这一知识空白,Selene C.Koo等研究者对来自四个医疗机构的5例唾液腺母细胞瘤进行了全面分子分析。研究采用多组学方法,包括靶向下一代测序(NGS)和甲基化芯片拷贝数分析。靶向测序覆盖了301-523

    来源:Head and Neck Pathology

    时间:2025-09-16

  • RET种系突变驱动的肌上皮癌恶性转化:揭示唾液腺肿瘤罕见遗传事件

    肌上皮癌(Myoepithelial Carcinoma, MECA)是一种完全由肌上皮细胞构成的恶性肿瘤,占唾液腺肿瘤不足1%。由于与良性病变存在组织学重叠且形态多变,其诊断常具挑战性。尽管分子谱分析已成为唾液腺肿瘤分类的重要工具,但MECA的遗传特征仍未被完全阐明。一项最新研究报道了65岁男性慢性淋巴细胞白血病患者的特殊病例:该患者因耳痛、咽痛和吞咽困难就诊,术后确诊为颌下腺高级别MECA。术前影像显示广泛区域淋巴结肿大及疑似肺/肋骨转移,新一代测序(Next-Generation Sequencing, NGS)检测出RET p.V804M变异——该突变在甲状腺髓样癌中已知具有致病性,但

    来源:Head and Neck Pathology

    时间:2025-09-16

  • 多中心研究揭示涎腺多形性腺瘤中上皮异型性的临床意义:AR与HER2表达谱及预后分析

    研究背景与意义涎腺肿瘤领域长期存在一个诊断困境:看似无害的多形性腺瘤(PA)中,那些具有"可疑特征"的细胞究竟意味着什么?2005年WHO首次将"癌在多形性腺瘤中"(CXPA)列为独立病种,其中涎腺导管癌(SDC)是最常见且侵袭性最强的亚型。但临床实践中,病理学家常面临两难:PA中出现的上皮异型性(AEC)——包括核增大、核仁显著、异常核分裂甚至AR/HER2表达——是否该被诊断为"原位癌"?这个问题直接关系到患者是否需要接受根治性手术或放化疗。现有研究存在三大矛盾点:一方面,SDC ex PA的5年生存率不足50%;另一方面,部分研究提示瘤内局限的异型细胞可能无害。更复杂的是,良性PA本身就

    来源:Head and Neck Pathology

    时间:2025-09-16

  • 鼻腔鼻窦非角化性鳞状细胞癌中新型BMPR1B::AFF2基因融合的发现及其临床意义

    分子诊断技术正成为解决疑难病例鉴别诊断的利器。针对一例临床表现特殊的鼻腔鼻咽部肿瘤,研究团队采用免疫组化结合分子检测手段,在细胞形态温和的鳞状肿瘤中意外捕获到国际首报的骨形态发生蛋白受体1B(BMPR1B)与AFF2基因融合事件。该肿瘤呈现显著的局部侵袭性和复发倾向,其分子特征突破了现有认知——尽管DEK::AFF2融合在头颈部肿瘤中已有明确记载,但新发现的BMPR1B::AFF2变异体预示着AFF2基因可能通过不同伙伴基因驱动肿瘤发生。这一发现为理解鼻腔鼻窦区非角化性鳞状细胞癌的分子机制开辟了新视角。

    来源:Head and Neck Pathology

    时间:2025-09-16

  • 整合转录组与单细胞测序揭示脑出血中RNA修饰关键标志物Ybx1/Igf2bp2的调控机制

    这项开创性研究采用多组学整合策略,首次绘制了脑出血(Intracerebral Hemorrhage, ICH)中RNA修饰(RNA Modification, RM)的动态图谱。通过分析GSE216607和GSE206971数据集,研究者从数千个基因中锁定两个关键调控因子——冷休克蛋白Ybx1和胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白Igf2bp2。生物信息学深度挖掘显示,这两个分子在ICH模型中呈现显著上调趋势。有趣的是,它们的表达模式各具特色:Ybx1在疾病不同阶段呈现"波浪式"波动,尤其在微glia1和单核细胞中表现活跃;而Igf2bp2则保持"稳如磐石"的表达特性。通过蛋白互作网络(Pr

    来源:Genome Instability & Disease

    时间:2025-09-16

  • 基于外周血临床实验室组学动态变化的机器学习模型预测晚期胃癌免疫检查点抑制剂疗效的多中心研究

    这项开创性研究揭示了动态监测外周血临床实验室指标对预测免疫治疗疗效的重要价值。研究团队收集了377例接受一线免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗的晚期胃癌(GC)患者数据,创新性地将9种机器学习算法应用于临床实验室组学(Clinlabomics)动态特征分析。令人振奋的是,XGBoost模型展现出卓越的预测性能,训练队列曲线下面积(AUC)高达0.863,在外部验证队列中稳定保持在0.790-0.842区间。研究首次证实,相较于传统的单时间点检测,动态监测10项关键临床实验室指标能更精准识别免疫治疗优势人群。低风险亚组患者不仅预后显著改善,其肿瘤微环境更呈现"热肿瘤"特征——这意味着更强的免疫细胞

    来源:Gastric Cancer

    时间:2025-09-16


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