• 一种新的样本制备方法大大加快质谱分析

  质谱分析（mass spectrometry）是一种广泛使用的蛋白质分析方法，但它的样本制备过程复杂且耗时。日本爱媛大学的研究人员近日开发出一种新方法，通过阴离子交换固相萃取离心柱来显著缩短制备时间。这项研究成果于近日发表在《Chemical Communications》杂志上。新方法的好处在于不需要高度专业的操作技术，即可对痕量的细胞和组织样本开展质谱分析，且重现性良好。近年来，随着蛋白质组学研究的流行，研究人员纷纷采用质谱技术来分析生物样本中的蛋白质成分。在检测蛋白质时，通常需要提取细胞中的蛋白质成分，并用蛋白酶将其消化至适合质谱分析的肽段。以这种方式消化蛋白质往往需要20个小时或更长时

  来源：生物通

  时间：2022-03-07

• 产生化学修饰mRNA的新方法

  在最近的一项研究中，由斯蒂芬妮·卡特-绍尔教授领导的科隆大学有机化学研究所的研究小组描述了一种利用酶生产合成信使RNA (mRNA)的新方法。虽然信使rna的自然碱基修饰已经被使用，例如BioNTech/辉瑞公司生产的冠状病毒疫苗，但这种新开发的信使rna还额外包含了位点特异性引入的非天然核苷酸。核苷酸是核糖核酸的基本组成部分。这种使用非天然核苷酸的新方法使科学家们能够研究mRNA是如何被引入细胞的，并观察新引入的信息是如何在细胞水平上传播的。从长远来看，这反过来又保证了更好的治疗应用。文章“在细胞翻译中一起更强:自然和非自然碱基修饰的mRNA”已经出现在《化学科学》杂志上。以前的方法不允许在

  来源：Chemical Science

  时间：2022-03-07

• 2022-03-03 生命科学与医学部宋晓元课题组报道可同时高效捕获染色质开放位点和 染色质相互作用的新技术NicE-C

  2022年2月22日，中国科学技术大学生命学院与医学部宋晓元课题组在Genome Research杂志在线发表了题为“NicE-C efficiently reveals open chromatin-associated chromosome interactions at high resolution”的研究论文。基于染色质构象捕获（3C）及其相关技术的研究揭示了哺乳动物细胞内不同层次的染色质高级结构，包括染色质隔室（A/B compartments）、拓扑结构域（TADs）和染色质环（chromatin loops）。研究表明启动子与增强子间可以通过形成染色质环（E-P loops）来

  来源：中国科学技术大学 | 生命科学学院

  时间：2022-03-05

• 昇思 MindSpore 再突破：蛋白质结构预测训练推理全流程开源，助力生物医药发展

  　　来源：写作平台 　　近日，昌平实验室、北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、化学与分子工程学院、深圳湾实验室高毅勤教授课题组及鹏城实验室陈杰团队与昇思 MindSpore 基于全场景 AI 框架昇思 MindSpore 实现 AlphaFold2 蛋白质结构训练。继 2021 年 11 月发布推理工具后，本次训练意味着国产 AI 框架具备了强大的 AI for Science 底层软件能力，同时也为相关科研工作者提供新的选择。该联合工作依托鹏城云脑 II 昇腾 AI 集群进行，单步迭代性能提升超过 60%，TM-score 达 85 分

  来源：北京大学生物医学前沿创新中心

  时间：2022-03-05

• 惠利健组发现提高扩增的人肝细胞体内移植效率的方法

  　　3月1日，国际学术期刊Hepatology在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）惠利健研究组的研究成果“Dedifferentiation-associated inflammatory factors of long-term expanded human hepatocytes exacerbate their elimination by macrophages during liver engraftment”。该研究系统解析了长期培养的ProliHH的分子变化，发现其特异上调表达了一组与固有免疫相关的趋化因子和细胞因子，诱导肝内巨噬细胞过度活

  来源：中国科学院生物化学与细胞生物学研究所

  时间：2022-03-05

• 通过新的MRI方法确定阿尔茨海默病早期损害

                 一名没有认知衰退迹象的老年人(左)和一名患有轻度阿尔茨海默氏症的相似年龄的人(右)的海马体(大脑记忆中心)的核磁共振扫描，用一种新技术分析了健康脑细胞丢失的地方(暗区)。圣路易斯华盛顿大学医学院的一项新研究表明，这种新型的核磁共振成像方法可以在传统的核磁共振成像扫描显示组织萎缩之前，识别出早期阿尔茨海默氏症患者的脑细胞损伤。资料来源:Satya Kothapalli/医学院阿尔茨海默病通常是根据症状来诊断的，比如当一个人表现出记忆丧失和思考困难的迹象。到目前为止，MRI脑部扫描在临床

  来源：medical Xpress

  时间：2022-03-04

• 生命科学与医学部宋晓元课题组报道可同时高效捕获染色质开放位点和 染色质相互作用的新技术NicE-C

  2022年2月22日，中国科学技术大学生命学院与医学部宋晓元课题组在Genome Research杂志在线发表了题为“NicE-C efficiently reveals open chromatin-associated chromosome interactions at high resolution”的研究论文。基于染色质构象捕获（3C）及其相关技术的研究揭示了哺乳动物细胞内不同层次的染色质高级结构，包括染色质隔室（A/B compartments）、拓扑结构域（TADs）和染色质环（chromatin loops）。研究表明启动子与增强子间可以通过形成染色质环（E-P loops）来

  来源：中国科学技术大学 | 生命科学与医学部

  时间：2022-03-04

• VascuViz：让不可见的东西变得可见的新成像方法

          图像:VascuViz成像管道结果的视觉演示的静态图。资料来源:约翰霍普金斯约翰·霍普金斯医学院的研究人员开发并测试了一种新的成像方法，他们说，这种方法允许研究人员在不同的空间尺度上捕捉血管的图像，从而加快了基于成像的实验室研究。这种被称为“VascuViz”的方法在老鼠组织中进行了测试，包括一种快速凝固的聚合物混合物，可以填充血管，并使其在多种成像技术中可见。研究人员说，这种方法使研究人员能够可视化组织血管系统的结构，结合详细的数学模型或其他组织元素的互补图像，可以阐明血液流动在健康和疾病中的复杂作用。他们说，血管图像的组合不仅应

  来源：Nature Methods

  时间：2022-03-02

• 二代、三代测序技术联合Hi-C互作图谱技术，获得高质量的AB品系斑马鱼参考基因组

  　　斑马鱼（Danio Rerio）是生命科学、健康科学和环境科学等研究领域的重要模式生物之一。常见的两种实验室斑马鱼品系分别是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑马鱼被国内外很多实验室作为研究对象。然而，却缺乏一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组。 　　由于不同品系斑马鱼来源不同，各品系之间存在着大量基因序列上的差异，其中包括一些可能对表型产生重大影响的结构变异。因此，相比于通用的Tubingen品系斑马鱼参考基因组（GRCz11），品系特异性参考基因组的获得能够更加高效地揭示不同品系斑马鱼之间的遗传差异，为科研人员更精准地选择合适的斑马鱼品系以及更合理地应用来自不同品

  来源：中国科学院水生生物研究所

  时间：2022-03-02

• PNAS：免疫治疗的新精密技术

  近年来，在开发新的成功的免疫疗法来治疗癌症方面取得了很大的进展。CAR -T细胞治疗和抗体治疗是两种靶向免疫疗法，已经彻底改变了癌症治疗领域。然而，在识别肿瘤细胞表面蛋白作为免疫治疗的目标方面仍有重大的挑战。瑞典隆德大学(Lund University)的一个研究小组正在进行这项工作，他们的研究结果已经发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。免疫疗法已经彻底改变了癌症的治疗方法，在某些情况下，还能够治愈晚期癌症患者。CAR - t细胞和抗体的免疫疗法共同关注表达在肿瘤细胞表面的特定靶蛋白，称为细胞表面肿瘤抗原。“最大的挑战是，细胞表面肿瘤抗原的结构在患者之间、在原发肿瘤和转移瘤之间是不同的

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2022-03-02

• 《PNAS》令人兴奋！大脑表观遗传无创成像技术

          该团队包括(左起)化学教授Scott Silverman；昆虫学教授Gene Robinson；生物工程教授Fan Lam；动物学教授Ryan Dilger，电子计算机工程教授Zhi-Pei Liang表观遗传学是基因表达调控的关键机制。研究人员说，这种被称为表观遗传核磁共振成像(eMRI)的新方法将为研究这些变化如何塑造大脑开辟新的途径，使其能够生长、学习和应对压力。这项技术也可能在阿尔茨海默病等神经退化过程的研究中有用。研究结果发表在《PNAS》上。“我们的DNA从一个细胞到另一个细胞都是一样的，它不会改变，” Kin

  来源：Proceedings of the National Academy of Sciences

  时间：2022-03-01

• 癌症研究的重大突破：具有新功能的旧药可以限制癌细胞扩散

  众所周知，癌细胞扩散到身体其他部位的能力是难以治疗的，而且是死亡的主要原因，这意味着早期诊断和治疗至关重要。当细胞核(细胞的指挥中心，包含DNA)内的基因发生某些变化时，癌症就开始了。在显微镜下观察癌细胞时，癌细胞看起来异常。150多年来，科学家们一直利用细胞核大小的变化来诊断癌症及其严重程度。在许多类型的癌症中，这些大小的变化与转移的增加有关，即癌细胞扩散的能力，减少了生存的机会。然而，很少有治疗方法专门针对转移。为了解决这个问题，爱丁堡大学、蒙特利尔大学和东芬兰大学的研究人员在实验室中筛选了逆转三种癌症(前列腺癌、结肠癌和肺癌)细胞细胞核大小变化的药物。筛查发现了许多现有的抗癌药物，但也发

  来源：ACS Chemical Biology

  时间：2022-03-01

• 开创性新技术：利用微小的磁性粒子远程激活脑细胞

  发表在《先进科学》杂志上的这项开创性技术被称为“磁机械刺激”，它可以用体外的磁性装置刺激被称为星形胶质细胞的触觉敏感脑胶质细胞。显微镜下的磁微粒，或称微磁铁，附着在星形胶质细胞上，用作微型机械开关，当一个强磁铁放置在靠近头部的位置时，可以打开细胞。合著者Alexander V. Gourine教授(伦敦大学学院心血管和代谢神经科学中心)说:“星形胶质细胞是遍布大脑的星形细胞。它们战略性地位于脑血管和神经细胞之间。这些细胞为神经元提供必要的代谢和结构支持，调节神经回路活动，还可能作为大脑环境的多功能测量员，感知潜在的代谢不足。“利用磁场控制大脑星形胶质细胞的能力，为研究人员提供了一个新的工具，来

  来源：University College London

  时间：2022-02-28

• 可同时高效捕获染色质开放位点和染色质相互作用的新技术NicE-C

  2022年2月22日，中国科学技术大学生命学院与医学部宋晓元课题组在Genome Research杂志在线发表了题为“NicE-C efficiently reveals open chromatin-associated chromosome interactions at high resolution”的研究论文。基于染色质构象捕获（3C）及其相关技术的研究揭示了哺乳动物细胞内不同层次的染色质高级结构，包括染色质隔室（A/B compartments）、拓扑结构域（TADs）和染色质环（chromatin loops）。研究表明启动子与增强子间可以通过形成染色质环（E-P loops）来

  来源：中国科学技术大学 | 生命科学与医学部

  时间：2022-02-28

• 可同时高效捕获染色质开放位点和 染色质相互作用的新技术NicE-C

  2022年2月22日，中国科学技术大学生命学院与医学部宋晓元课题组在Genome Research杂志在线发表了题为“NicE-C efficiently reveals open chromatin-associated chromosome interactions at high resolution”的研究论文。基于染色质构象捕获（3C）及其相关技术的研究揭示了哺乳动物细胞内不同层次的染色质高级结构，包括染色质隔室（A/B compartments）、拓扑结构域（TADs）和染色质环（chromatin loops）。研究表明启动子与增强子间可以通过形成染色质环（E-P loops）来

  来源：中国科学技术大学 | 生命科学学院

  时间：2022-02-27

• Science Advances令人惊讶的小细胞肺癌发现：提示新的治疗方法

  由弗吉尼亚大学的Kwon-Sik Park博士和John H. Bushweller博士领导的研究人员试图了解EP300基因突变在小细胞肺癌肿瘤形成中的作用。他们的实验表明，这种基因可以产生一种具有惊人特性的蛋白质，这种蛋白质既可以促进小细胞肺癌的发生，也可以防止小细胞肺癌的发生。通过阻止该基因作为肿瘤启动子，研究人员能够阻止癌症的形成和扩散。这在细胞样本和实验室小鼠中都是正确的。这种蛋白质在肿瘤形成过程中的重要作用，使其成为研究人员寻找治疗小细胞肺癌(SCLC)的新方法的诱人目标。被诊断为SCLC的患者的五年生存率只有7%。弗吉尼亚大学医学院微生物学、免疫学和癌症生物学系的Park说:“我们

  来源：University of Virginia Health System

  时间：2022-02-26

• Nature子刊：一种治疗恶性癌症的新方法

          “EZH2在癌症进展过程中发挥着非常重要的作用，是一个已知的适合药物开发的靶点，”北卡罗来纳大学莱恩伯格分校的格雷格·王（Greg Wang）博士说，他是北卡罗来纳大学医学院生物化学、生物物理和药理学副教授，也是这篇研究文章的共同第一作者。“我们对小分子PROTAC同时靶向癌细胞中的EZH2和cMyc的效率感到惊讶。”某些亚型的血癌，如急性白血病，依靠多种机制维持侵袭性癌细胞的生长。值得注意的是，这些机制包括由EZH2(一种染色质调节酶)和cMyc(一种显著的致癌因子)驱动的机制。北卡罗来纳大学的研究人员现在表明，这两个因素可以直接

  来源：Nature Cell Biology

  时间：2022-02-25

• 小鼠研究可能帮助医生选择治疗白血病患者的方法

  一些与白血病有关的基因突变对患者的治疗决策不是很有用的指导。威斯康星大学麦迪逊分校(University of Wisconsin-Madison)的一项新研究表明，一组临床症状可以与基因检测相结合，从而更好地告知更积极治疗的时机。白血病是一种血液和造血细胞的癌症，对白血病的研究揭示了与这种疾病相关的基因改变，而这些基因改变可以代代相传。在某些情况下，这些改变给医生提供了一种评估疾病风险的方法。对另一些人来说，后果尚不清楚。即使某一特定的基因红旗与疾病之间存在很强的联系，也很难确定疾病的严重阶段何时开始。“这可能是非常多变的。在一个具有共同突变的家庭中，祖父可能直到白血病突然出现才出现症状，”

  来源：Science Advances

  时间：2022-02-25

• 一种能更好地理解大脑神经元之间交流的新方法

          图像:新型熔接光纤光发射和细胞外记录(FFLEXR)的方案。资料来源:弗莱堡大学在光遗传学领域，科学家利用光研究大脑神经元的活动。来自弗莱堡大学(University of Freiburg)光生理学实验室的Ilka Diester博士和David Eriksson博士领导的团队开发了一种新方法，可以同时对大脑进行层流记录、多纤维刺激、3D光遗传刺激、连通性推断和行为量化。他们的研究结果发表在《自然通讯》杂志上。“我们的工作为大规模的照片记录和任何大脑区域的快速神经通信的控制审讯铺平了道路，”Diester解释说。“这可以帮助我们解

  来源：

  时间：2022-02-25

• 国家自然科学基金重点基金“土壤有机碳储量的人工神经网络模拟方法与模型”启动会在亚热带生态所召开

  　　2月18日，中国科学院亚热带农业生态研究所组织召开了国家自然科学基金重点基金项目“土壤有机碳储量的人工神经网络模拟方法与模型”（42130716）启动会。来自亚热带生态所、中南大学、华中农业大学、中国农业科学院等单位的专家学者现场或以视频的方式参加了此次启动交流会。 　　项目主持人、亚热带生态所吴金水研究员主持会议并介绍了项目的立项意义、研究目标、研究内容与实施方案。与会专家和项目成员就土壤有机碳数据资料的搜集和基础数据库的建设、地理信息系统中土壤有机碳储量模拟参数的提取、人工神经网络模拟激活函数的遴选与模拟精度的不确定性等内容的具体实施方案进行了充分研讨。项目协作单位就任务分工交换了意见

  来源：中国科学院亚热带农业生态研究所

  时间：2022-02-25

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