• ​中国科学技术大学白丽教授课题组揭示了ASC去谷胱甘肽化修饰是NL...

  炎症小体是先天免疫反应对抗病原体和死亡细胞等危险信号的关键组成部分。炎症小体活化导致caspase-1裂解活化，进而诱导细胞焦亡及促炎性细胞因子IL-1β和IL-18的产生。NLRP3炎症小体是目前研究最深入的炎症小体，其过度激活与自身免疫性疾病和炎性疾病有关。因此，NLRP3炎症小体的激活是被精确调控的，在此激活过程中，凋亡相关斑点样蛋白ASC的寡聚是一个必不可少的过程, 其寡聚是由翻译后修饰调控的，包括泛素化、去泛素化和磷酸化。是否有其他机制控制ASC寡聚并防止NLRP3炎症小体过度激活目前尚不清楚。2021年8月3日，中国科学技术大学白丽教授课题组在Journal of Exp

  来源：中国科学技术大学 | 生命科学学院

  时间：2021-12-03

• 上海交大陈险峰课题组利用先进光子技术提出癌症诊断和治疗新思路

  癌症是现今世界上导致人类死亡的三大病症之一，每年都有成千上万的人死于癌症。利用新的科技手段技术攻克癌症成为全世界的科研工作者的梦想。上海交通大学物理与天文学院的陈险峰教授课题组利用先进光子技术在癌症诊断和治疗方面提出了一种新的思路和方法。该方法是基于双面金属包覆波导的超高灵敏度以及增强单分子荧光的能力，实时精确的检测在化疗或放疗过程中病灶周围是否还有残存的癌细胞。因此，该研究工作对癌症治疗过程中过度治疗或治疗不足的现象具有关键的指导作用。众所周知染色体数目在正常的细胞中是稳定数目存在的，但是在癌细胞中因为癌细胞的大量增殖以及增殖速度超过正常的细胞，因此

  来源：上海交大 新闻学术网

  时间：2021-12-03

• 新方法使我们能够快速、客观地了解细胞是如何被疾病改变的

          图片:Eric A. Vitriol博士资料来源:迈克尔·霍拉汉，奥古斯塔大学一种新的“图像分析管道”让科学家们快速了解疾病或损伤如何改变身体，甚至是单个细胞。它被称为TDAExplore，它获取了显微镜提供的详细成像，并将其与拓扑这一热门数学领域相结合，拓扑提供了对事物如何排列的洞察，以及人工智能的分析能力，例如，乔治亚医学院的细胞生物学家和神经科学家Eric Vitriol博士说，他对肌萎缩性脊髓侧索硬化症引起的细胞变化及其发生部位有了新的看法。他们在《模式》杂志上报告说，这是一种“可访问的、强大的选择”，可以使用个人电脑从显微

  来源：Patterns

  时间：2021-12-02

• 确定心血管疾病早期风险的新方法

          图片来源:Gran Walldius，卡罗林斯卡学院环境医学研究所名誉教授。患心血管疾病的风险与“坏”的低密度脂蛋白胆固醇密切相关。卡罗林斯卡学院的科学家进行的一项大型研究表明，两种在血液中运输胆固醇颗粒的蛋白质提供了早期和可靠的风险信息。研究人员现在提倡引入新的检测心脏病风险的指导方针，并表示该结果可能为早期治疗铺平道路，这可能有助于降低发病率和死亡率。心血管疾病是全球最常见的死亡原因，包括多种疾病，如中风和心肌梗死以及身体不同器官的动脉粥样硬化。在许多情况下，这种疾病可以通过改变生活方式和使用他汀类药物和其他方法进行降脂治疗来预

  来源：PLoS Medicine

  时间：2021-12-02

• SMART研究人员开发了一种早期检测作物细菌感染的方法

  来自新加坡-麻省理工学院研究与技术联盟(Singapore-MIT Alliance for Research and Technology, SMART)的农业精准破坏性与可持续技术(DiSTAP)跨学科研究小组(IRG)的研究人员，以及麻省理工学院在新加坡的研究企业淡马锡生命科学实验室(Temasek Life Sciences Laboratory, TLL)的当地合作者，开发了一种基于拉曼光谱的快速检测和定量作物早期细菌感染的方法。拉曼光谱生物标记物和诊断算法实现了对作物细菌感染的无创早期诊断，这对植物病害管理和农业生产力的进展至关重要。由于对全球粮食供应和安全的需求日益增加，改善农业

  来源：mit

  时间：2021-12-02

• 富士胶片欧文生物技术新公司成立 开启本土生物制药培养基定制服务

  　　作为富士胶片欧文科技在华本土化发展的重要一步，富士胶片欧文生物技术（苏州）有限公司（下文为“富士欧文生物”）于11月19日在苏州高新区正式注册成功。　　12月1日，富士胶片（中国）投资有限公司总经理田中健一先生、富士胶片欧文生物技术（苏州）有限公司总经理品川涉先生、苏州高新区党工委副书记/虎丘区代区长宋长宝、苏州高新区党工委委员/管委会副主任虞美华、苏州高新区党工委委员/科技城管委会主任卢潮线上参与了新公司的授牌仪式。苏州授牌仪式现场 卢潮 （左，苏州高新区党工委委员/科技城管委会主任）、是雄（右，富士胶片（中国）投资有限公司-欧文科技事业部）　　新公司成立后，将新设立创新合作中心(Inn

  来源：富士胶片

  时间：2021-12-02

• 复旦大学王久存、金力团队研发预测我国平原地区居民高原习服能力的复合表型分析方法

  2021年2月22日，《表型组学》（Phenomics）期刊首期以封面论文形式在线发表了复旦大学生命科学学院及人类表型组研究院王久存教授和金力院士团队的最新研究成果。该团队自主研发了应用复合表型策略的分析方法，通过对人体复合生理表型指标的分析，可有效预测我国平原人群在高原习服慢性期的血氧饱和度变化，进而发现个体的高原习服能力与习服慢性期血氧饱和度呈显著相关。此外，研究团队指出，该复合表型分析方法可以作为一种通用的研究手段与策略对生命健康领域的复杂问题开展研究。 高原习服表型研究具有重要科研意义与应用前景 高原习服，是指平原世居者进入高原或高原世居者进入更高海拔地区的过程中，在高原低氧

  来源：复旦大学人类表型组研究院

  时间：2021-12-02

• 倪挺教授课题组开发新型单细胞聚类和批次效应矫正网络分析方法

  单细胞RNA-seq技术可揭示细胞间异质性，发现新的功能亚群，解析细胞谱系分化，发现疾病新标志物等，具有重要价值并成为遗传学研究的重要前沿。2021年2月22日，分子生物学领域国际知名期刊Nucleic Acids Research在线发表了复旦大学生命科学学院及人类表型组研究院倪挺课题组题为“Independent component analysis based gene co-expression network inference (ICAnet) to decipher functional modules for better single-cell clustering a

  来源：复旦大学人类表型组研究院

  时间：2021-12-02

• 《自然·生物技术》刊发国际组学数据质量控制联盟最新研究成果

  美国东部时间2021年9月9日上午11:00，国际权威学术期刊《自然·生物技术》（Nature Biotechnology）在线发表了5篇最新科研论文，专题发布了国际组学数据质量控制联盟第四期(MAQC-IV，亦为“测序质量控制第二期SEQC2”)的最新研究成果。 该项目由美国食品药品监督管理局（FDA）牵头，历时5年多，聚集了来自全球100多个单位的300多位科学家参与。通过建立和使用一系列基因组参考物质，国际组学数据质量控制联盟对众多新一代测序平台和生物信息学方法在体细胞和胚系突变、拷贝数变异、肿瘤靶向测序和液态活检、单细胞测序等多个应用场景的性能进行了系统研究。复旦大学人类表型组

  来源：复旦大学人类表型组研究院

  时间：2021-12-02

• 顾宏周团队开发利用环化酶高效制备DNA单环和拓扑结构的新技术

   环状单链脱氧核糖核酸（circular ssDNA）在分子生物和DNA纳米技术等领域扮演着重要的角色，如作为滚环扩增的必备模板、DNA拓扑结构的构成单元等。目前常用的依赖于T4 DNA连接酶制备环状单链DNA的方法容易产生多聚体副产物，导致单体环产率低；而现有的基于CircLigase（一种单链环化酶）制备环状单链DNA的方法虽然可一定程度上减少副产物，但是随着底物DNA链长度的增大，CircLigase催化成环的效率急剧下降。因此，高效率地制备单链环形DNA仍是一个亟待解决的问题。 2020年12月31日，我院顾宏周团队在Analytical Chemistry杂志发表

  来源：复旦大学生物医学研究院

  时间：2021-12-02

• 顾宏周课题组《Chem》报道利用DNA核酶开发高效制备单链DNA纳米结构的新方法

   近15年来，作为构建DNA纳米组装体的主要方法之一，DNA折纸术(DNA origami)可使得一条长单链DNA在成百或千条短链DNA的辅助下, 通过碱基互补配对原则折叠并锁定生成所设计的纳米图案，它的出现极大地推动了DNA纳米技术领域的发展。单链DNA折纸术(single-stranded DNA origami)是传统DNA折纸术的一种进化和衍生，它摒除了对众多短序列的需求，通过高度集成序列信息于一条长单链DNA中, 实现了单个DNA序列的自我折叠和组装体构建（类似于蛋白质由一条长肽链折叠成三维结构）。 单链DNA组装体（ssDNs）的可编程性和可寻址性均能与传统的多

  来源：复旦大学生物医学研究院

  时间：2021-12-02

• 突破！徐彦辉团队《Science》长文揭示转录起始复合物识别启动子及动态组装的分子机制

   以人类为代表的高等生物，进化出复杂的基因表达调控机制，利用同一套基因组遗传信息，分化出数百种不同的细胞类型，以适应对复杂生长发育过程的需要。转录起始过程发生在几万种不同基因的高度多样化的启动子区。围绕这些启动子区，人体细胞产生极其复杂和精细的调控，如染色质重塑复合物BAF/PBAF剔除核小体暴露出启动子DNA使转录发生，组蛋白修饰和DNA甲基化修饰动态调控转录因子和转录共激活因子招募，3D基因组背景下的增强子和启动子环化，及近期备受关注的液液相分离等。上述过程的综合结果都是导致抑制或不同程度的促进转录起始复合物在启动子区的组装及后续的转录激活，实现基因差异性表达，决定细胞的表型和发

  来源：复旦大学生物医学研究院

  时间：2021-12-02

• 又一突破！徐彦辉团队《Science》长文揭示完整转录起始超级复合物结构与功能

   发生在基因启动子区的转录起始过程是基因表达调控的核心，决定着细胞的命运，影响众多生理病理过程。以RNA聚合酶II（Pol II）为核心的转录前起始复合物（preinitiation complex，PIC），识别几乎所有编码基因和大部分非编码基因的启动子区，响应各种转录调控信号，起始基因转录。在今年4月初，我院徐彦辉团队在Science杂志报道了包含TFIID的转录前起始复合物结构，揭示了启动子识别及PIC装配的动态过程，该工作一经发表就得到了国内外广大同行的高度认可。 在上世纪90年代，科学家们发现一个功能非常重要的转录共激活因子，命名为中介体（Mediator）。Me

  来源：复旦大学生物医学研究院

  时间：2021-12-02

• 顾宏周课题组《Chem》全面评述由DNA酶推动的 DNA 纳米技术应用的最新进展

   DNA是由脱氧核糖核苷酸组成的大分子聚合物，具备较好的稳定性和可编程性，已被广泛作为一种通用型生物材料用于构建各式各样具有精确尺寸和特定形状的纳米结构。另一方面，自上世纪90年代以来，生化学家发现DNA像RNA和蛋白质一样具备酶活性，可催化一系列化学反应，包括在特定位点切割DNA或RNA。当结构和酶这两种不同类型的DNA相遇时产生了一系列火花，一些新的研究领域有望因此而诞生。经典的DNA 纳米结构与具有切割DNA活性的脱氧核酶的比较。A. DNA 折纸形成稳定的矩形结构; B. 具有茎-环-茎结构的脱氧核酶在辅因子帮助下水解切割破坏DNA。  2021年9月3日，我院顾宏

  来源：复旦大学生物医学研究院

  时间：2021-12-02

• 胡晋川/钱茂祥课题组《Nucleic Acids Research 》合作开发单碱基分辨率DNA氧化损伤测序方法

   生命活动需要氧化反应提供能量，这一过程同时会产生活性氧物质（ROS）。ROS能诱导多种DNA氧化损伤，其中最常见的是8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine (OG)，被视为氧化压力的标志物。如果没有被及时修复，OG可能引起G→T突变，与多种癌症、神经退行性疾病和衰老相关。除此之外，OG也有类似于表观遗传修饰的作用，可以通过几种不同的方式调控基因表达，例如OG的修复中间体apurinic (AP) site可以通过促进和稳定富含G碱基的DNA二级结构G四链体（G-quadruplexes, G4）来影响转录。&nb

  来源：复旦大学生物医学研究院

  时间：2021-12-02

• 徐书华团队发展新方法ArchaicSeeker 2.0重塑史前人类基因交流与演化模型

  2021年10月29日，《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了复旦大学生命科学学院徐书华团队的研究成果“Refining models of archaic admixture in Eurasia with ArchaicSeeker2.0”。该项工作提出了一种基于隐马尔科夫模型（Hidden Markov Model）的计算分析新方法ArchaicSeeker 2.0。相比于之前的方法，新方法能更有效地检测和量化近缘种的基因交流并在更精细的尺度上重构复杂的基因交流历史；该方法也适用于非人类物种的遗传数据分析。研究团队应用新方法分析了公共开放数据库中的人群基因

  来源：复旦大学生命科学学院

  时间：2021-12-02

• 我院杨萍技术团队在脂质组与菌群互作下的TMAO循环、中药绞股蓝皂苷干预脑疾病机制研究方面取得新进展

         三甲胺-N-氧化物（TMAO）是一种内源性小分子，存在于外周循环，与心血管疾病密切相关。近几年研究发现TMAO在人脑脊液中存在，且患有认知障碍患者脑内TMAO水平高于正常人，但具体起源尚不清楚。中药绞股蓝Gynostemma pentaphyllum (Thunb.) Makino主要成分绞股蓝皂苷不仅具有保护心血管、降血脂、抗肿瘤、抗衰老以及增强人体免疫力等功效，研究发现其有利于改善AD小鼠的空间学习记忆能力和空间记忆保持能力。我院杨萍正高级实验师技术团队的研究通过建立体外酶孵育体系和小鼠高胆碱模型，解析了肠道菌群、FMO3酶、

  来源：复旦大学药学院

  时间：2021-12-02

• 又一突破！徐彦辉团队《Science》揭示完整转录起始超级复合物结构与功能

  发生在基因启动子区的转录起始过程是基因表达调控的核心，决定着细胞的命运，影响众多生理病理过程。以RNA聚合酶II（Pol II）为核心的转录前起始复合物（preinitiation complex，PIC），识别几乎所有编码基因和大部分非编码基因的启动子区，响应各种转录调控信号，起始基因转录。在今年4月初，徐彦辉研究员团队在Science杂志报道了包含TFIID的转录前起始复合物结构，揭示了启动子识别及PIC装配的动态过程，该工作一经发表就得到了国内外广大同行的高度认可。   在上世纪90年代，科学家们发现一个功能非常重要的转录共激活因子，命名

  来源：复旦大学遗传工程国家重点实验室

  时间：2021-12-02

• 马明团队在天然药用功能分子生物合成领域取得重要突破

  近日，北京大学药学院、天然药物及仿生药物国家重点实验室马明研究员团队连续在美国化学会ACS Catalysis学术期刊、英国皇家化学会Chemical Science上发表科研论文，报道其研究团队在天然药用功能分子的生物合成领域取得的系列成果。 1、环肽分子生物合成-发现第一个催化异构化/环化双功能硫酯酶并解析其晶体结构 2021年9月7日，马明研究团队在美国化学会ACS Catalysis上发表了题为“Functional characterization and crystal structure of the bifunctional

  来源：北京大学医学部

  时间：2021-12-02

• 王晓月团队开发基于单碱基编辑的高通量方法鉴定肿瘤变异功能

  2021年3月10日，中国医学科学院基础医学研究所王晓月团队在Genome Biology发表了“Identification of pathogenic variants in cancer genes using base editing screens with editing efficiency correction”的论文。研究以单碱基编辑工具为基础，开发出一种可以高效研究核苷酸变异功能的高通量筛选方法。 复杂疾病相关变异的功能鉴定一直是遗传学研究中的重要问题。肿瘤患者中含有大量的核苷酸变异，包括遗传性变异和体细胞变异，这些变异的致病性判断对肿瘤的风

  来源：北京协和医学院

  时间：2021-12-02

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