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MetaVR:基于2400万未培养病毒基因组扩展病毒多样性前沿的综合资源库
病毒是地球上最丰富的生物实体之一,广泛存在于所有环境中,通过感染宿主细胞调控其代谢、进化及生态过程。然而,由于绝大多数病毒无法通过传统培养方法获得,人类对病毒多样性的认知仍极为有限。随着高通量测序技术的发展,宏基因组学成为病毒发现的主要手段,催生了海量未培养病毒基因组(Uncultivated Virus Genomes, UViGs)的涌现。尽管已有多个病毒数据库(如NCBI Viruses、ViroidDB等)致力于整理病毒序列,但这些资源多聚焦特定病毒类型或技术平台,缺乏系统性整合,且难以支持大规模数据查询与程序化分析,阻碍了全球病毒组的比较研究。为突破上述局限,由美国能源部联合基因组研
来源:Nucleic Acids Research
时间:2025-11-29
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祖先分子伴侣蛋白首次揭示早期多聚体蛋白进化结构奥秘
蛋白质是生命的基石,其正确折叠对细胞功能至关重要。然而,蛋白质在合成或应激条件下容易发生错误折叠和聚集,进而引发细胞功能紊乱甚至疾病。在这一过程中,一类被称为分子伴侣(molecular chaperones)的蛋白质扮演着“折叠助手”的角色。其中, chaperonins(又称 Hsp60 伴侣蛋白)是一类在所有生命领域中都存在的、大型的桶状复合物,它们作为分子机器,为新合成的蛋白质提供受保护的环境,使其能够高效折叠,这是蛋白质稳态(protein homeostasis)的一个关键方面。除了折叠功能, chaperonins 还能通过防止聚集和协助错误折叠的蛋白质重新折叠来防御应激(如温度
来源:Molecular Biology and Evolution
时间:2025-11-29
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中国森林恢复二十年:以非迁徙森林鸟类为指示剂揭示生物多样性增益机制
在全球森林持续退化的背景下,中国通过“天然林保护工程”和“退耕还林”等大型生态工程,成为全球森林覆盖增长最快的国家之一。然而,这些工程对生物多样性的实际效益长期缺乏全国尺度的量化评估。既往研究多聚焦森林面积变化,忽视森林结构(如树冠高度、破碎化程度)对物种栖息地质量的影响,加之气候变化干扰,难以厘清恢复措施的真实成效。为此,本研究以对环境变化高度敏感的非迁徙森林鸟类为指示类群,首次在全国尺度上揭示中国20年森林恢复对生物多样性的净效应。为精准评估森林恢复的生态效益,研究团队整合多源遥感数据(如GLCLUC土地覆盖数据集、MODIS植被连续场)和公民科学鸟类观测记录(eBird、GBIF等),构
来源:Nature Communications
时间:2025-11-29
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塑料相关内分泌干扰物通过降低γ-分泌酶Nicastrin蛋白表达加剧化脓性汗腺炎炎症反应
在皮肤科领域,化脓性汗腺炎(Hidradenitis Suppurativa, HS)是一种令人困扰的慢性炎症性皮肤病,患者皮肤褶皱部位反复出现疼痛性结节、脓肿和窦道,严重影响生活质量。尽管这种疾病的全球发病率呈现上升趋势,但目前美国FDA批准的疗法仅有抗TNFα的阿达木单抗和抗IL-17A的司库奇尤单抗,有效率低至40%,凸显了探究其发病机制的紧迫性。令人困惑的是,HS的发病具有明显的激素相关性特征:好发于女性,发病高峰在21-24岁,青春期前罕见,78%的成年女性患者报告症状随月经周期波动。此外,超加工食品(Ultra-Processed Foods, UPFs)摄入与HS发病率存在显著正
来源:Nature Communications
时间:2025-11-29
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生态位依赖性氧化还原调控器通过IDH1-HIF1α轴决定远端结肠上皮干细胞命运
在人体这个精密的生命体中,肠道上皮作为抵御外界环境的第一道防线,其惊人的更新速度令人叹为观止——每5-7天就会完全更替一次。这场持续的“新生”盛宴由隐藏在肠道隐窝底部的肠道干细胞(ISC)主导,它们如同生命的源泉,不断分化产生各种功能细胞。然而,一个长期困扰科学界的谜团是:为何结肠远端(如乙状结肠和直肠)更易发生炎症性肠病和肿瘤?这种区域特异性暗示着不同区段的肠道干细胞可能处于独特的微环境之中。近日,《Nature Communications》发表的一项研究揭开了这一谜题的关键面纱。研究人员发现,远端结肠隐窝基底特有的低氧生态位与Wnt信号协同作用,通过调控NADPH氧化酶1(NOX1)依赖
来源:Nature Communications
时间:2025-11-29
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行为示踪技术揭示精神病阳性和阴性症状的动态相互作用机制
精神病是一种复杂的精神疾病,其特征是多种症状维度的共存,每种维度具有不同的现象学和治疗反应,反映了不同的潜在病理生理机制。然而,这些症状经常同时出现,被认为是单一疾病的表现。阳性精神病症状,如妄想和幻觉,是精神病的标志,对针对中脑边缘通路多巴胺能活动失调的抗精神病药物反应有效。另一方面,阴性症状可分为两大类:动机减少(包括意志缺乏和社会退缩)以及情感和沟通表达能力减弱。阴性症状的病理生理学了解较少,与阳性症状的病理生理学并不完全重叠,这从它们对抗精神病药物治疗的反应较不可预测且通常有限可以看出。目前对阳性和阴性精神病症状之间相互作用的理解受到回顾性评估的限制,这些评估无法捕捉动态的、短期的症状
来源:npj Digital Medicine
时间:2025-11-29
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聚苯乙烯微塑料暴露通过NF-κB和TGF-β信号通路加速透明细胞肾细胞癌的进展
近年来,微塑料(MPs)作为新型环境污染物,其与人类健康关系的潜在威胁备受关注。本研究聚焦于聚苯乙烯微塑料(PS-MPs)在肾细胞癌(RCC)中的致病机制,尤其是透明细胞肾细胞癌(ccRCC),这一占所有RCC病例80%的恶性亚型。研究通过整合多种实验技术,首次系统揭示了PS-MPs通过激活NF-κB和TGF-β信号通路驱动ccRCC进展的分子机制,并构建了患者来源的类器官(PDO)和细胞来源的异种移植(CDX)模型进行验证,为环境致癌物研究提供了重要参考。### 研究背景与核心问题全球塑料污染已导致微塑料广泛分布于水体、土壤及食物链中。人类通过呼吸、摄入和皮肤接触等途径持续暴露于微塑料。已有
来源:Advanced Science
时间:2025-11-29
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通过综合养分循环技术生产的生物基肥料的环境可持续性
该研究聚焦于生物基肥料(BBF)的环境效益评估与技术创新路径探索,以解决有机废弃物资源化与化肥减量替代的双重目标。研究采用全生命周期评估方法,整合了六个技术模块(含四种新兴技术),覆盖从废弃物收集到农田应用的全链条环境分析。以下从技术体系构建、环境效益对比、区域适配性三个维度展开解读:一、技术创新体系构建研究突破传统堆肥与厌氧消化单一技术模式,构建了"原料预处理-高值化转化-功能化复配"三级技术体系。在预处理阶段采用智能分拣系统,实现果蔬残渣98%的纯度提升;转化环节创新性整合:85%)2. 微生物培养系统:构建共生菌群培养装置,蛋白含量达72%(同类技术提升40%)3. 昆虫生物转化平台:采
来源:Biomass and Bioenergy
时间:2025-11-29
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北阿坎德邦(位于西喜马拉雅地区)阿尔莫拉区市政固体废物倾倒区的固体废物特性分析及植物群评估
本文聚焦于印度喜马拉雅地区阿莫拉县城市与近郊/农村区域固体废物管理问题的系统性研究,通过实地调查与实验室分析相结合的方式,揭示了该地区固体废物处理面临的独特挑战与潜在解决方案。研究选取阿莫拉镇法斯米亚(Falsima)和比基亚桑(Bhikhiyasain)两个典型区域进行对比分析,其研究成果不仅为喜马拉雅山脉地区固废管理提供科学依据,更为高海拔脆弱生态系统的可持续发展战略制定积累重要参考。研究团队通过为期数年的持续监测发现,该地区日均人均固体废物产生量介于0.19-0.23公斤之间,且秋季季节性废物产量呈现显著上升趋势。这种季节波动可能与山区旅游旺季及农业收获期重叠有关,特别是传统节庆活动期间
来源:Biomass and Bioenergy
时间:2025-11-29
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在多种环境压力下(模拟微重力、微厌氧及共培养条件)对益生菌大肠杆菌Nissle 1917的转录组分析
该研究聚焦于益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)在复合环境应力下的响应机制,旨在揭示其在模拟太空微重力、低氧及病原体竞争等多重压力下的生理适应策略。通过分阶段实验设计,研究团队系统性地考察了EcN在不同单一应力及复合应力条件下的转录组动态变化,为优化益生菌在极端环境中的功能提供了重要依据。### 研究背景与核心问题益生菌在肠道微环境中面临动态变化的环境压力,包括氧气浓度梯度、pH波动及病原微生物的竞争。特别是太空任务中,微重力环境(通过旋转细胞培养系统模拟)与低氧(模拟肠道微环境)、病原菌共存等多重压力叠加,可能显著影响益生菌的活性。此前研究多关注单一应力(如仅微重力或仅低氧)对Ec
来源:New Biotechnology
时间:2025-11-29
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生长素“守门人”:YUCCA家族的进化与多样化
本文聚焦于植物YUCCA(YUC)基因家族的进化与功能多样性研究,系统解析了该家族的分子特征、系统发育模式及在植物发育与逆境响应中的关键作用。研究基于全球54种植物物种的基因组数据,构建了包含469个YUC成员的系统发育树,并创新性地提出包含早发型(ED)、五类(Class 1-5)及41个亚类(Subclass a-g)的分级分类体系,为解析植物激素调控机制提供了新框架。### 一、YUCCA基因家族的核心生物学功能YUCCA家族作为植物 auxin 合成的关键酶,催化色氨酸(Trp)依赖性吲哚-3-丙酸(IPA)向吲哚-3-乙酸(IAA)的不可逆氧化脱羧反应。该反应不仅是 auxin 生物
来源:The Plant Journal
时间:2025-11-29
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与过去的玉米基因型相比,作物管理措施对现代玉米基因型来说更为重要
该研究系统评估了美国中西部玉米种植体系中基因型创新与管理实践协同作用对产量和碳足迹的影响。研究团队通过16种基因型-管理组合的对比试验,结合生命周期评估方法,揭示了现代农业体系中 genotype-by-management 的关键交互效应。在产量方面,现代基因型(2020年代)相比1960年代品种在密集管理条件下(氮肥210 kg/ha,种植密度90,000株/ha)平均增产2.4 Mg/ha,且这种增益差异随时间推移呈扩大趋势。值得注意的是,1960年代基因型在现代化管理下(如氮肥用量从150 kg/ha增至210 kg/ha)产量并未显著提升,这印证了管理实践对现代基因型产量的倍增效应。
来源:Field Crops Research
时间:2025-11-29
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基因型、环境和管理因素对北美大平原地区燕麦籽粒产量、碾磨品质及营养价值的影响
本研究聚焦于美国西部玉米带地区燕麦(Avena sativa L.)的种植系统优化与品质提升,通过跨年度田间试验揭示了品种特性、环境条件和栽培管理之间的复杂互作关系。研究团队在南达科他州布鲁克斯科研基地连续三年(2021-2023)开展对比试验,选取三个商业化品种"Reins"(半矮生)、"Natty"(中茎)和"Sumo"(中茎),通过设置225/300/375株/平方米三种密度梯度,以及"苜蓿间作"与"免苜蓿休耕"两种管理方案,系统解析了产量、加工品质及营养指标的关联机制。在环境变量方面,研究区域呈现显著气候波动特征。2021年遭遇极端干旱(年降水量176毫米),夏季日均最高温达35℃,导
来源:Field Crops Research
时间:2025-11-29
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集成水稻-水生动物共养系统能够改善水稻根区土壤的养分状况,并生产出更多优质大米:一项元分析研究
【稻渔共生系统可持续性研究全解析】一、研究背景与核心问题传统水稻种植模式面临多重挑战:化学肥料过度依赖导致土壤酸化(Elbasiouny et al., 2022)、生态系统服务功能退化(Arunrat & Sereenonchai, 2022)、以及农产品质量波动(Baum et al., 2025)。在此背景下,稻渔共生系统(IRAC)作为资源互补型农业模式,其生态效益与经济效益的协同机制成为全球农业研究热点。本研究聚焦四大共生系统(稻虾/蟹/鸭/鱼)在土壤养分动态、稻米产量构成、品质形成过程中的作用机制,特别关注亚热带气候条件与施肥/喂养协同策略的影响。二、研究方法创新通过全球文献系统筛
来源:Field Crops Research
时间:2025-11-29
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综述:将元分析与机器学习相结合,以解读弱光胁迫对主要作物产量及籽粒成分的影响
低光胁迫对主要农作物产量与品质的影响机制及调控策略研究一、研究背景与科学问题随着全球气候变化加剧,作物生长环境的光照条件持续恶化。低光胁迫通过抑制光合作用效率、干扰营养吸收代谢等途径,已成为威胁粮食安全的重要生物物理限制因素。根据联合国粮农组织数据,全球约15%的农田存在不同程度的遮荫问题,包括间作阴影、光伏农业阴影以及林农复合系统中的树冠遮荫。该研究聚焦于揭示低光胁迫对主要粮食作物产量与品质的复合影响机制,构建多因素交互作用模型,为制定精准化农业应对策略提供理论支撑。二、研究方法与技术路线20kg/m³)等关键因素的交互作用。数据来源覆盖Web of Science、CNKI等中英文数据库,
来源:Field Crops Research
时间:2025-11-29
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新型可摄入采样装置揭示健康人群小肠微生物组的独特特征与代谢景观
在人体消化系统的奥秘版图中,小肠作为营养物质吸收的核心区域,却始终是微生物研究领域的"盲区"。这个长达数米的管状器官不仅负责着消化吸收的重任,更是宿主与微生物相互作用的关键界面。然而,由于采样技术的限制,科学家们对健康人群小肠微生物生态系统的认知一直停留在雾里看花的阶段。传统的小肠采样方法如内镜检查、手术取样或造口术,不仅具有侵入性,还面临着伦理约束和样本污染的风险。更棘手的是,这些方法通常只能在患者群体中实施,使得健康人群的小肠微生物组特征成为未被探索的科学处女地。这种知识空白严重制约了我们对肠道微生物全面功能的理解,特别是在胆汁酸代谢、免疫调节等关键生理过程中微生物所扮演的具体角色。面对这
来源:ISME Communications
时间:2025-11-29
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海洋微微型真核藻类昼夜节律与光感应基因的纬度多样性研究及其生态适应性意义
在广袤的海洋中,微小的浮游植物承担着与陆地植物相当的初级生产力,它们从极地到赤道遍布各纬度海域。随着地球自转和公转,日照长度随纬度变化而产生显著差异,特别是温带和极地地区的光周期变化尤为剧烈。这种光周期变化如何影响海洋浮游植物的生命活动?它们是否像陆地植物一样拥有精密的光周期感应机制?这些问题一直是海洋微生物生态学研究的热点。以往研究主要集中在模型生物Ostreococcus tauri上,该物种被揭示拥有相对简单的绿色谱系昼夜节律系统。其核心振荡器由Timing of CAB Expression 1 (TOC1) 和Circadian Clock Associated 1 (CCA1) 组
来源:The ISME Journal
时间:2025-11-29
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减轻钙对磷酸盐回收过程中鸟粪石生物矿化作用的不良影响
磷酸铵镁生物矿化技术受钙离子干扰的机制与调控策略研究研究团队通过系统实验揭示了钙离子对鸟粪石(MgNH4PO4·6H2O)生物矿化的关键作用机制,并提出了基于EDTA螯合技术的环境友好型调控方案。该研究由东莞理工学院环境与土木工程学院生态工程研究中心团队完成,主要作者包括陈星通、李永云等,研究成果对污水处理中营养回收技术具有重要指导价值。一、研究背景与科学问题生物矿化技术作为新兴的污水处理策略,通过微生物代谢调控实现磷氮营养素的协同回收。相较于化学沉淀法,生物矿化具有无需额外碱度投加、可处理低浓度磷酸盐(如7.5 mg PO4-P/L)及同时回收有机氮磷等优势(Leng et al., 202
来源:Bioresource Technology
时间:2025-11-29
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一种新型羧酸酯酶HylD3,对邻苯二甲酸酯具有高效的水解活性:酶学特性、催化机制以及通过固定化实现的可回收催化作用
李朝阳|张亮国家先进城市污水处理与回用技术工程实验室,北京水质科学与水环境修复工程重点实验室,北京工业大学,北京100124,中国摘要季节性温度变化会对污水处理厂(WWTPs)中的微生物群落产生周期性干扰,但调控其季节性组成的机制仍不清楚。通过对一个全规模污水处理厂进行为期一年的跟踪研究,本研究表明,温度变化过程而非极端温度是微生物群落演替和确定性组成的主要驱动因素。微生物群落结构和共现网络在不同温度阶段表现出差异:在温度变化阶段(无论是升温还是降温阶段),网络复杂性下降;而在温度稳定阶段(无论是高温还是低温阶段),网络复杂性则趋于稳定。在升温阶段,确定性选择的比例上升至25.5%,这表明升温
来源:Bioresource Technology
时间:2025-11-29
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微生物电化学缓冲区能够实现全氟和多氟烷基物质(PFAS)的解毒,并降低再生水中潜在的风险
PFAS污染治理与生态安全评估的协同创新研究当前全球范围内PFAS污染呈现持续扩散态势,尤其是以PFOA为代表的代表性物质在饮用水源和生态敏感区检出率高达83.6%(Ji et al., 2020)。传统污水处理工艺对PFAS的平均去除效率仅为23-94%,且存在碳源依赖性强、运行成本高等固有缺陷。基于此,研究团队构建了微生物燃料电池-生态缓冲区(MFC-EBs)复合系统,实现了污染治理与生态安全的协同优化。在技术体系构建方面,采用四层复合基质(底层为100mm粒径鹅卵石,中间层为20-60mm级配砾石,上覆10cm厚活性炭或石墨阳极材料)。创新性地引入闭路循环系统,通过1.2-2.3V/m梯
来源:Bioresource Technology
时间:2025-11-29