• Systematic Biology | 张蔚课题组和合作者开发基于深度学习的基因渐渗推断...

  解决分类群之间的演化关系是演化生物学的基本任务之一。在大数据时代，随着测序技术和分析方法的发展，多项研究发现类群之间的杂交和基因渐渗可能强烈的影响了生命之树，并在物种形成和适应过程中起到了重要作用。然而，现有基因渐渗检测方法仍具有一定局限性，如依赖大样本量、受限的系统发育关系或精确的种群演化历史等。因此，在基因流广泛存在的背景下，评估物种之间的复杂关系仍具挑战。同时，基于深度学习的算法已经迅速成为处理统计应用的有效替代方法，特别是与大数据集有关的应用。目前已有涉及基因渐渗推断的基于深度学习的相关方法的应用报道，但多是针对具体分类群的初步尝试，其一般适用性和可推广性受到了限制。 2023年

  来源：生命科学联合中心

  时间：2023-06-07

• NEJM：新药vorasidenib延缓了神经胶质瘤的进展

  关键信息▪一种名为vorasidenib的靶向治疗药物在延缓一种特定形式的神经胶质瘤进展方面取得了积极的效果。▪在一项针对331名癌症患者的研究中，这种药物有效地延长了患者癌症恶化前的时间，且没有观察到不良反应。▪神经胶质瘤需要新的治疗方法，因为目前的治疗方法（包括化疗和放疗）会导致神经功能障碍。异柠檬酸脱氢酶（IDH）的突变状态已成为神经胶质瘤的重要预后标志物。带有IDH1和IDH2突变的复发性二级胶质瘤是一种进展缓慢但致命的脑癌，往往影响30多岁的年轻人。目前的标准治疗方法（也就是放疗和化疗的组合）可能会导致神经功能障碍，使患者难以学习、记忆新事物、集中

  来源：AAAS

  时间：2023-06-06

• 让我们识别他人的神经元

  基础科学研究所(IBS)认知与社会中心(CCS)的研究人员最近宣布，他们发现了能够让我们识别他人的神经元。研究小组发现，处理与不同个体相关的信息的神经元位于海马体的CA1区域。社会动物，包括人类，不断地与他人互动。在这个过程中，识别社会对应物的身份，从记忆中检索有关他们的相关信息，并从当前的互动中更新信息的能力对于建立社会关系至关重要。然而，关于这些过程如何在大脑中发生的研究有限。为了回答这个问题，过去的努力主要集中在小鼠的大脑研究上，特别是在海马体上。海马体被认为是答案，因为它是一个众所周知的负责记忆形成的大脑结构。在海马体中，编号为CA1至CA3的Cornu amoniis (CA)脑区参

  来源：Nature Communications

  时间：2023-06-06

• eLife：更好的饮食能让你的大脑更年轻吗?

  根据内盖夫本古里安大学的一项新研究，转向绿色地中海饮食对大脑健康有积极影响。在DIRECT-PLUS试验的一项亚研究中，体重减轻减轻了大脑衰老。DIRECT PLUS是一项在300名参与者中进行的为期18个月的大规模长期临床试验。这项子研究是由心理学系的Galia Avidan教授和认知与脑科学系的前研究生Gidon Levakov博士进行的。他们的研究结果最近发表在《eLife》杂志上。这项规模更大的研究是由内盖夫本古里安大学的Iris Shai教授领导的，她是哈佛大学公共卫生学院的兼职教授，也是德国莱比锡大学的荣誉教授，以及她以前的研究生Alon Kaplan博士，以及哈佛大学和莱比锡大学

  来源：AAAS

  时间：2023-06-05

• α-突触核蛋白可以作为突触核蛋白病的血清生物标志物

  摘要α-突触核蛋白异常聚集是突触核蛋白病等神经退行性疾病的关键病理特征，包括帕金森病(PD)、路易体痴呆和多系统萎缩(MSA)。α-突触核蛋白的致病β-薄片种子构象存在于多种组织中，提示其作为生物标志物的潜力，但很少有研究能够在血清样本中可靠地检测到这些种子。在这项研究中，我们开发了一种改进的检测系统，称为基于免疫沉淀的实时振动诱导转化(IP/RT-QuIC)，该系统能够检测突触核蛋白病个体血清中的致病性α-突触核蛋白种子。在我们的内部第一和第二队列中，IP/RT-QuIC在区分PD与对照组(曲线下面积(AUC): 0.96(95%置信区间(CI) 0.95-0.99)/AUC: 0.93 (

  来源：nature medicine

  时间：2023-06-05

• Nature新研究挑战百年理论：人类大脑的形状决定了其功能

  一个多世纪以来，研究人员一直认为，决定我们经历、希望和梦想的大脑活动模式，是由大脑不同区域通过一个由数万亿细胞连接组成的复杂网络相互交流决定的。现在，由莫纳什大学特纳大脑与心理健康研究所的研究人员领导的一项研究分析了超过10,000种不同的人类大脑活动图，发现一个人的大脑的整体形状对我们如何思考，感觉和行为的影响远远大于其复杂的神经元连接。今天发表在《自然》上的这项研究，汇集了物理学、神经科学和心理学的方法，推翻了强调复杂大脑连接重要性的百年范式，确定了以前未被重视的大脑形状和活动之间的关系。来自莫纳什大学心理科学学院的研究员James Pang博士说，这些发现意义重大，因为它们极大地简化了我

  来源：AAAS

  时间：2023-06-02

• 紫杉醇诱导的乳腺癌周围神经病变

  化疗引起的周围神经病变(CIPN)——神经痛、刺痛或手脚麻木——是某些癌症治疗的常见副作用，包括两种常用的治疗癌症的药物——紫杉醇和多西紫杉醇。一项大型研究对1100多名接受紫杉醇治疗的乳腺癌患者的CIPN进行了跟踪研究，初步结果显示，紫杉醇治疗的患者出现了具有临床意义的、持续的感觉和运动症状，患者的症状比多西紫杉醇治疗更严重。SWOG S1714临床试验的这些初步结果将于6月5日在芝加哥举行的2023年美国临床肿瘤学会(ASCO)年会上进行口头报告。摘要的资深作者，德克萨斯大学MD安德森癌症中心的临床教授Michael J. Fisch医学博士说:“SWOG S1714的这些结果是高度相关的

  来源：AAAS

  时间：2023-06-02

• 与运动方向相关的神经网络

                 A)文中描述的HD网络在斑马鱼大脑中的位置。(B) HD神经元(左)的颜色编码方向调谐与它们的解剖位置(右)非常匹配。(B)斑马鱼(绿色)的高清网络在几十分钟内跟踪航向(金色)。(D)在非同心坐标下，网络相位在转弯时如何变化并始终指向同一方向的示意图。过去的研究发现，一些动物的大脑会生成它们前进方向的表征。例如，昆虫的前进方向是由它们大脑中心区域的神经元活动来表示的，这个区域被称为中央复合体。慕尼黑工业大学的研究人员最近进行了一项研究，旨在识别代表斑马鱼行进方向的类似神经网络，同时揭

  来源：Nature Neuroscience

  时间：2023-06-01

• 免疫系统激活的重度抑郁症患者可能比之前研究估计的要多

  伦敦国王学院精神病学、心理学和神经科学研究所(IoPPN)的一项新研究通过对参与免疫反应的基因表达进行评估，表明免疫系统激活的重度抑郁症患者可能比之前的研究估计的要多。通过确定这种关联的分子机制，这项研究可以为更好地识别那些患有抑郁症的免疫成分的患者铺平道路，这可能有助于提供更个性化的治疗和管理重度抑郁症的方法。这项研究发表在《转化精神病学》杂志上，由国家卫生与保健研究所(NIHR)莫兹利生物医学研究中心(BRC)和惠康基金会战略奖资助。研究建立在先前的发现之上，即许多MDD患者存在激活的免疫反应。然而，这一领域的大多数研究都集中在与炎症相关的蛋白质水平上，比如c反应蛋白(CRP)。使用c反应

  来源：AAAS

  时间：2023-06-01

• 我国学者在人造神经研究方面取得进展

  图1 室温钙钛矿人造突触器件载流子迁移路径及创纪录能耗情况图 图2 神经形态仿生运动-认知神经与猕猴的眼-前庭跨模态感觉神经对照图 　　在国家自然科学基金项目（批准号：T2125005）等资助下，南开大学徐文涛教授课题组相继报道了无热退火兆赫兹级超快低能耗神经形态器件和人造跨模态多感官运动-认知仿生神经。研究成果分别以“基于钝化无热退火钙钛矿神经形态器件的仿生柔性神经肌肉系统（A bioinspired

  来源：国家自然科学基金委员会

  时间：2023-06-01

• 《Nature Medicine》阿尔兹海默症新的血液生物标志物

  阿尔茨海默病是一种神经退行性疾病，会导致进行性记忆丧失和痴呆，使患者丧失许多富有成效的生命。在组织层面上，阿尔茨海默氏症的标志是淀粉样斑块的积累——大脑神经细胞之间的蛋白质聚集体——以及神经元内部形成的被称为tau缠结的无序蛋白质纤维团块。几十年来，脑科学家认为淀粉样斑块和tau蛋白缠结的积累不仅是阿尔茨海默病的征兆，也是其直接罪魁祸首。这种假设也导致药品制造商大量投资于针对淀粉样蛋白和tau蛋白的分子，而忽略了其他大脑过程的作用，比如神经免疫系统。为什么有些人会患上阿尔茨海默病，而有些人不会?而且，更令人费解的是，为什么许多大脑中充满了有毒淀粉样蛋白聚集体的人——这是阿尔茨海默病的一个明显迹

  来源：Nature Medicine

  时间：2023-05-31

• 《PNAS》首次发现低黄烷醇饮食会导致与年龄相关的记忆丧失

  由哥伦比亚大学和布里格姆妇女医院/哈佛大学的研究人员领导的一项大规模研究首次证实，低黄烷醇(某些水果和蔬菜中发现的营养素)的饮食会导致与年龄相关的记忆丧失。研究发现，老年人的黄烷醇（flavanols）摄入量与检测正常衰老导致的记忆丧失的测试分数相一致，60岁以上轻度黄烷醇缺乏的成年人补充这些生物活性饮食成分可以提高这些测试的表现。哥伦比亚大学瓦格洛斯内外科医学院神经心理学教授、该研究的联合负责人Adam Brickman博士说:“低黄烷醇饮食的研究参与者的改善是实质性的，这提高了使用富含黄烷醇的饮食或补充剂来改善老年人认知功能的可能性。”这一发现也支持了一个新兴的观点，即衰老的大脑需要特定的

  来源：PNAS

  时间：2023-05-31

• PNAS：低黄烷醇饮食会导致与年龄相关的记忆丧失

  由哥伦比亚大学和布里格姆妇女医院/哈佛大学的研究人员领导的一项大规模研究首次证实，低黄烷醇(某些水果和蔬菜中发现的营养素)的饮食会导致与年龄相关的记忆丧失。研究发现，老年人的黄烷醇摄入量与检测正常衰老导致的记忆丧失的测试分数相一致，60岁以上轻度黄烷醇缺乏的成年人补充这些生物活性饮食成分可以提高这些测试的表现。哥伦比亚大学瓦格洛斯内外科医学院神经心理学教授、该研究的联合负责人亚当·布里克曼博士说:“低黄烷醇饮食的研究参与者的改善是实质性的，这提高了使用富含黄烷醇的饮食或补充剂来改善老年人认知功能的可能性。”这一发现也支持了一个新兴的观点，即衰老的大脑需要特定的营养物质才能达到最佳健康状态，就像

  来源：AAAS

  时间：2023-05-31

• 纤维肌痛如何改变大脑

                 利用磁共振成像的数据，研究人员能够比较健康和纤维肌痛患者的大脑纤维肌痛患者的核心症状之一是慢性疼痛。来自德国波鸿鲁尔大学身心医学和心理治疗LWL诊所的一个团队调查了与这种疾病相关的大脑变化。研究人员利用磁共振数据证明，患者大脑中参与疼痛处理和情绪评估的区域发生了改变。这适用于主要容纳神经细胞的灰质和主要由神经细胞之间的纤维连接组成的白质的体积。研究人员在2023年5月19日的《Arthritis Research and Therapy 》杂志上发表了他们的研究结果。疼痛网络的变化M

  来源：Arthritis Research and Therapy

  时间：2023-05-31

• 翻转自闭症遗传学剧本——父亲重要还是母亲重要？

  最近的一项研究发现，患有自闭症的兄弟姐妹从父亲那里遗传的遗传物质比从母亲那里遗传的要多。多年来，科学家们认为，被诊断患有自闭症谱系障碍的兄弟姐妹往往会从母亲那里遗传比从父亲那里遗传更多的基因特征。几十年来，冷泉港实验室的科学家和合作者已经投入了数百万美元来破译自闭症谱系障碍(ASD)的遗传原因。他们的努力为诊断学家、治疗师和教育工作者提供了有用的见解，帮助改变了人们对这种常见神经发育障碍的看法。现在，他们的研究又向前迈出了一大步，再次推翻了关于自闭症及其基因起源的流行假设。来自CSHL的副教授Ivan Iossifov和Michael Wigler教授已经证明，在许多情况下，父亲往往具有更大的

  来源：Cell Genomics

  时间：2023-05-30

• 基于蛋白质的纳米“计算机”进化出了影响细胞行为的能力

          片:Jiaxing Chen是宾夕法尼亚州立大学医学院和宾夕法尼亚州立大学哈克生命科学研究所的生物信息学和基因组学博士生，他是宾夕法尼亚州立大学研究团队的一员，该团队创建了第一个基于蛋白质的纳米计算代理，该代理具有电路功能。资料来源:宾夕法尼亚州立大学哈克生命科学研究所宾夕法尼亚州立大学的研究人员创造了第一个以蛋白质为基础的纳米计算代理，该代理可以作为电路发挥作用。这一里程碑式的成果使他们朝着开发下一代细胞疗法来治疗糖尿病和癌症等疾病又迈进了一步。传统的基于细胞的合成生物学治疗方法，如破坏癌细胞或促进损伤后组织再生的方法，依赖于在细

  来源：AAAS

  时间：2023-05-30

• 大脑刺激能提高记忆力和注意力吗?大型研究试图解决争论

           研究人员一直在探索，通过头皮上的电极，用电流刺激一个人的大脑，是否能提高认知能力多年来，人们一直在争论用电流对大脑进行非侵入性电击是否能改善人的精神功能，对过去研究的大量分析给出了一个答案:可能。但一些人质疑这一结论，称该分析涵盖了太过不同的实验，无法提供一个可靠的答案。在过去的六年里，测试一类被称为经颅电刺激技术的治疗效果的研究数量激增。这些疗法通过放置在头皮外部的电极向大脑输送无痛的微弱电流。其目标是激发、干扰或同步大脑中的信号，以改善功能。研究人员测试了经颅交流电刺激(tACS)及其姊妹技术，tDCS(经颅直流电刺激)

  来源：nature

  时间：2023-05-30

• 重点实验室在海洋生物“环境记忆”机制解析与应用方面取得新进展

   　　中科院实验海洋生物学重点实验室贝类研发团队承担的中科院战略性先导科技专项 “美丽中国生态文明建设科技工程”——“服务于‘美丽海洋’的生物调控技术与示范”子课题，在牡蛎适应性机制解析及抗性提升技术研发领域取得了阶段性新进展，相关成果近期发表于环境科学领域期刊Science of the Total Environment、Marine biotechnology等。 　　在全球气候变化加剧和极端天气频发的背景下，海洋生物面临着严峻的生存考验。在海洋生物资源保护与利用领域，生物适应潜力预测与适应性提升一直是学术界和产业界共同关注的热点问题。潮间带海域是海洋与陆地

  来源：中国科学院海洋研究所

  时间：2023-05-30

• 我国学者在深度学习处理器体系结构研究方面取得新进展

  图1 支持量化训练的深度学习处理器架构Combricon-Q 图2 用卷积神经网络预测稀疏张量最优存储格式的方法SpTFS 　　在国家自然科学基金项目（批准号：61732002）资助下，北京航空航天大学钱德沛教授团队与中国科学院计算技术研究所陈天石研究员团队合作，在深度学习处理器体系结构研究方面取得新进展。 　　近年来深度学习研究取得了巨大进步，已经开始影响社会的生产和生活，与此同时，算力需求也呈指数

  来源：国家自然科学基金委员会

  时间：2023-05-30

• 老鼠的免疫系统和大脑之间的联系可以解释为什么压力会加重肠道炎症

  来源：medical Xpress

  时间：2023-05-30

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