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华人学者Cell子刊发表CRISPR新成果
生物通报道：西尼罗河病毒（WNV）是黄病毒科黄病毒属的重要成员，是一种通过蚊子传播的嗜神经病原体。西尼罗河病毒最早是1937年在乌干达一位发热妇女的血液中分离到。这种病毒在非洲、欧洲、中东、北美和西亚很常见，人类、马和其他哺乳动物都可能受到感染。人类感染西尼罗河病毒后会发展成严重甚至致命的神经系统疾病，比如无菌性脑膜炎、脑炎、急性弛缓性麻痹等。目前还没有针对WNV的特效治疗药物，也没有疫苗可以有效预防WNV感染，因此迫切需要开发新型疫苗。西尼罗河病毒感染往往伴随着大量的神经细胞死亡。然而，人们对这种病毒诱导细胞死亡的机制还并不了解。德州理工大学的Haoquan Wu和N. Manjunath领
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卢冠达博士：用CRISPR揭示非编码RNA的秘密
生物通报道：非编码RNA（ncRNA）是指不编码蛋白质的RNA。从上世纪六十年代的tRNA、八十年代的rRNA、到九十年代的microRNA，非编码RNA在不断给人们带来惊喜。科学家们也逐渐意识到非编码RNA并不是基因组中的垃圾序列，而是许多基础生命过程的核心，有着广泛的生物学功能。真核生物的非编码RNA广泛参与了关键性细胞功能的调控。随着测序技术的飞速发展，研究者们发现了越来越多的新型非编码RNA，比如lncRNA、环状RNA、piRNA等等。非编码RNA的丰度、保守性、结构和功能多样性，不仅丰富了我们的细胞生物学知识，还挑战了我们一直以来对真核生物基因组的认识。目前许多非编码RNA的具体功
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利用CRISPR/Cas9来攻克乙肝
生物通报道 在一项新研究中，麻省理工学院的研究人员利用CRISPR/Cas9 系统，对受到感染的哺乳动物肝细胞进行基因组编辑，从中删除了乙肝病毒(HBV)DNA。根据发表在《Scientific Reports》杂志上的研究结果，该研究小组靶向切割了HBV病毒共价闭合环状DNA(cccDNA)的一些特异位点。根据世界卫生组织（WHO）报道，全球有20多亿人曾受到过乙型肝炎病毒感染，大约3.5亿至4亿人罹患慢性HBV感染，在亚洲和非洲发病率尤其高（延伸阅读：Nature Medicine揭示乙肝难愈之谜）。他们面临着形成肝硬化或甚至肝癌的高风险。尽管现有的抗病毒药物可以控制
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Nature发表CRISPR重要新成果
生物通报道 来自佐治亚大学的研究人员报告称，他们利用CRISPR/Cas9技术对可引起腹泻病——隐孢子虫病的单细胞微小寄生虫隐孢子虫(Cryptosporidium)进行了遗传改造，由此开创了研究这类病原体的全新时代（延伸阅读：李劲松课题组Cell Stem cell用CRISPR构建多重基因修饰小鼠）。他们发表在《自然》（Nature）杂志上的研究结果，最终将帮助学术界和产业界开发出针对隐孢子虫的新疗法及疫苗。隐孢子虫通常是通过受到污染的饮用水或是再生水进行传播。当有人吞食下污染水中的成熟卵囊后，在消化液的作用下，子孢子在小肠中脱囊而出，先附着于肠上皮细胞，再
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遗传学界大牛Nature子刊发布CRISPR-Cas9新工具
生物通报道 来自哈佛医学院的研究人员开发出了一种预测软件，可以准确找出最有效的方法利用CRISPR-Cas9基因编辑技术来实现基因打靶。这项重要的研究成果发布在《自然方法》（Nature methods）杂志上。领导这一研究小组的是哈佛医学院著名遗传学教授、Wyss研究所的核心成员George Church。他被誉为是个人基因组学和合成生物学的先锋。1984年，Church和WalterGilbert发表了首个直接基因组测序方法，该文章中的一些策略现在仍应用在二代测序技术中。此外，如今的多重化分子技术和条码式标签也是他发明的。Church还是纳米孔测序技术的发明者之一。
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李劲松课题组Cell Stem cell用CRISPR构建多重基因修饰小鼠
生物通报道 来自中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称，他们找到了一种方法来提高利用小鼠孤雄单倍体胚胎干细胞系(AG-haESCs)生成半克隆小鼠的效率。并证实借助于CRISPR-Cas9技术可构建出多重遗传修饰的半克隆小鼠及实现对其的诱变遗传筛查。这些重要的研究结果发布在7月9日的《细胞干细胞》（Cell stem cell）杂志上。中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所的李劲松（Jinsong Li）研究员、吴宇轩（Yuxuan Wu）和上海生科院计算生物研究所的杨力（Li Yang）研究员是这篇文章的共同通讯作者。在有性生殖中，单倍体配子（卵子和精子）通过受精结合成二倍
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用CRISPR实现斑马鱼高效基因敲入
生物通报道：近期，来自中国科学院上海生命科学研究院、上海科技大学等处的研究人员报道称，他们利用CRISPR/Cas9系统开发出了一种内含子为基础的基因组编辑方法，实现高效的斑马鱼基因敲入（knockin）。这一重要成果发表在六月十九日的国际肿瘤权威期刊《Oncotarget》。中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所的杜久林（Jiu-lin Du）研究员是这篇论文的通讯作者。其1993年毕业于中国科技大学，1998年在中科院上海生理研究所获博士学位，中科院****入选者，主要研究方向是感觉整合与学习记忆行为产生的分子、突触和神经回路机制，以及血管发育和功能的神经调节。基因敲入动物是生物学研究
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张素春教授Cell stem cell：用CRISPR构建诱导性基因敲除人类干细胞系
生物通报道 来自威斯康星大学的研究人员报告称，他们开发出了一种新策略来快速构建诱导性基因敲除（iKO）人类多能干细胞（hPSC）系。相关研究论文发布在7月2日的《细胞干细胞》（Cell stem cell）杂志上威斯康星大学的张素春（Su-Chun Zhang）教授及助理研究员Yuejun Chen是这篇论文的共同通讯作者。张素春教授是著名的WiCell研究所创始人之一。他的实验室主要研究胚胎干细胞（尤其是人胚胎干细胞）的神经分化，是该领域做的最好的实验室。他的贡献包括曾在国际上首次将人胚胎干细胞分化成神经前体细胞，将胚胎干细胞分化成各种类型神经元及胶质细胞，研究关键基因（如Pax
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国际期刊评论CRISPR基因疗法
生物通报道：在医疗领域，基因编辑技术可以更加准确、深入地了解疾病发病机理和探究基因功能，可以改造人的基因，达到基因治疗的目的等。今年五月份，来自中山大学的遗传学，在世界上首次尝试使用CRISPR–Cas9基因组编辑技术，修改来自人类胚胎的疾病相关DNA，从而引发了科学界的激烈争论。这篇论文发表在五月份的《Protein & Cell》杂志。相关新闻：中山大学基因编辑研究引国际广泛关注。那么这是否意味着，我们将很快把基于CRISPR–Cas9的方法用于治疗人类疾病？近期，Cell旗下子刊、国际期刊《EBioMedicine》发表社论文章指出，基于CRISPR–Cas9的基因疗法还为时过早
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CRISPR先驱Science发表新成果
生物通报道 来自加州大学伯克利分校、德国马克斯普朗克生物物理化学研究所的研究人员揭示出了为识别靶DNA，预先组织形成的一种Cas9-导向RNA(gRNA)复合物的构象。这项研究发布在近期的《科学》(Science)杂志上。文章的通讯作者是加州大学伯克利分校的Jennifer A. Doudna博士。Doudna是CRISPR技术的共同开发者，曾因这一技术获得了“生命科学突破奖”（Breakthrough Prize），是CRISPR专利的有力竞争者。CRISPR序列源于原核生物的一种获得性免疫系统，协同Cas（CRISPR-associated）蛋白家族参与抵抗噬菌体或其他病毒的二
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2015不容错过的十大新闻
生物通报道：一转眼2015年就已经过去了一半，在这半年时间里生命科学领域涌现出了许多激动人心的新成果。在暑假来临之际，BioTechniques杂志盘点了今年最受欢迎的十大新闻，精彩不容错过。1. CRISPR到底有多准？自2012年以来，CRISPR一直是分子生物学领域最火的话题之一。CRISPR-Cas9在基因治疗方面被寄予厚望，但它必须先克服自己的脱靶效应。研究者们已经找到了不少降低脱靶效应的途径，但还没有明确CRISPR-Cas9在整个人类基因组中的脱靶情况，导致这一技术的安全性一直受到质疑。Nature Methods杂志发表的这项研究，为人们提供了全面评估CRISPR-Cas9精确
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Nature：中韩科学家发布基因编辑重大成果
生物通报道 通过数十年的选择性育种，比利时蓝牛（Belgian Blue cattle）现在成为了一种可为人们提供异常大量昂贵牛瘦肉的强壮动物。现在，由来自中国和韩国的科学家组成的一个研究小组说，采用一种更快速的方法他们构建出了与之相当的“健美猪”。不同于常规的基因改造技术将来自一个物种的基因移植到另一个物种体内，这些“双肌型”猪是通过编辑单个基因而生成，相比前者所造成的基因改变没有那么显著。因此，它们的创造者们希望监管机构将对这些猪持宽松态度——这一猪品种有可能会成为首个获得批准、供人食用的转基因动物。领导这一研究的是韩国首尔大学的分子生物学家Jin-Soo Kim，
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权威期刊发布CRISPR新改良
生物通报道：细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR/Cas适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大的基因组编辑工具。该系统使用简单而且扩展性强，很快便成为了生物学领域的香饽饽。2015年基因组编辑热潮在持续发酵，CRISPR/Cas9仍旧是最引人注目的话题之一，相关论文被大量下载和引用。日前，斯坦福大学和安捷伦公司的研究团队进一步改良了CRISPR/Cas9系统。他们对人工合成的sgRNA进行
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中国科学家6月参与发表多篇Nature文章
生物通报道：6月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表，其中主要包括癌症干细胞研究进展，CRISPR-Cas9技术应用，以及水稻研究新进展等。首先来自浙江大学医学院附属第一医院的研究人员揭示了色氨酸的一种代谢产物ITE抑制肿瘤干细胞增殖的分子机制，ITE将有望开发成为具有全新作用机理和重要临床价值的一类抗癌药物。ITE是一种人体必需氨基酸———色氨酸的代谢产物之一。研究人员首先通过生物信息学方法，发现Oct4基因的启动子区域有AhR的潜在结合位点，之后他们通过生化实验证实：AhR的确是看管Oct4基因大门的一位“门童”。随后，研究人员又设计了一系列实验来探究作为AhR配体的
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安徽农科院用CRISPR编辑水稻基因
生物通报道：CRISPR/Cas9系统逐渐成为作物育种的一种重要基因组编辑工具。虽然已有研究证明，目标突变可以传递给下一代，但是它们的遗传方式尚未完全阐明。六月十九日，安徽省农科院的研究人员在Nature子刊《Scientific Reports》发表题为“Generation of inheritable and “transgene clean” targeted genome-modified rice in later generations using the CRISPR/Cas9 system”的学术论文，描述了CRISPR/Cas9介导的、四个不同水稻基因的基因组编辑。本文通讯
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中国学者获重要突破：精子缺乏也能繁衍后代
生物通报道：基因突变会导致精子缺乏，造成男性不育。由于睾丸中缺少功能性的生殖细胞，这些患者无法通过辅助生殖技术（比如IVF）拥有自己的后代，恢复他们的生育能力是一个很大的挑战。南京医科大学、中科院动物研究所的科学家们日前在这一方面取得了重要突破。他们将细胞重编程和基因组编辑结合起来，成功让缺乏精子的突变小鼠生成了功能性精子，并且拥有了自己的后代。这一成果发表在六月十九日的Cell Research杂志上，文章的通讯作者是中科院动物所研究员周琪（Qi Zhou）、南京医科大学特聘教授沙家豪（Jiahao Sha）、和中科院动物所研究员赵小阳（Xiao-Yang Zhao）。（延伸阅读：中国学者C
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2015 Nature、Science你不容错过的那些论文
生物通报道 转眼又到了年中，各位或许都在忙于应付各种考试，准备研讨会，参加会议，撰写论文，完成试验等等各种事务。而遗憾的是，却从未留出足够的时间来享受（或甚至找到）一两篇真正好的研究文章。近日，BioTechnique网站为我们列出了今年值得关注的一些好文章，来看看其中有没有你错过的吧……Cusanovich, D.A. et al., “Multiplex single-cell profiling of chromatin accessibility by combinatorial cellular indexing"Science. 2015 May 22;348(6237
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Nature发布CRISPR-Cas9重大新成果
生物通报道 来自麻省总医院的一个研究小组找到了一种新方法来扩大强大基因编辑工具——CRISPR-Cas9 RNA引导核酸酶的使用及提高其精确性。他们的研究论文在线发表在6月22日的《自然》（Nature）杂志上。在这篇Nature文章中，研究人员描述了一种演化版本的DNA切割酶Cas9。相比于迄今为止使用的自然形式的Cas9，演化版本的Cas9能够识别前者无法靶向的不同范围的核酸序列。论文的主要作者、麻省总医院分子病理学部研究人员Benjamin Kleinstiver博士说：“在我们的论文中我们证实了采用我们设计改进的新的Cas9变体，现在可以靶向过去用野生型Cas9无法改造的人
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Cell子刊：生殖干细胞高效基因组编辑
生物通报道：精原干细胞（SSC）是成年雄性动物曲细精管中唯一能进行终生自我更新的二倍体永生细胞群。这些细胞既具有自我更新潜能，又能定向分化产生精子。对体外培养的精原干细胞进行基因修饰，能将外源基因稳定遗传到后代基因组，不过这一过程还存在一定的技术困难。日本横滨城市大学的生殖生物学家Takehiko Ogawa带领研究团队，用TALEN和CRISPR/Cas9对小鼠精原干细胞进行了基因组编辑。这一成果发表在六月十八日的Stem cell reports杂志上。TALEN技术主要依赖识别特定DNA序列的DNA结合结构域（DBD），融合了核酸酶的DBD可以向目的基因引入双链断裂（DSB）和突变。CR
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用CRISPR实现基因转录活体成像
生物通报道：最近，日本的一个研究小组开发出一种实时成像方法，用于内源基因转录活性和核定位的同步测量。研究人员用该方法来检测亚基因组范围的流动性变化，这取决于小鼠胚胎干细胞中多能性相关基因的活性。Hiroshi Ochiai博士和他的同事Takeshi Sugawara博士、Takashi Yamamoto教授，建立了一种新的实时成像方法，被称为“Real-time Observation of Localization and EXpression (ROLEX)”系统。这个系统可让研究人员使用MS2转录成像和规律成簇间隔短回文重复（CRISPR）基因显像技术，同时测量内源基因的转录活性和核定
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