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Science突破性成果:鸟瞰细胞RNA
生物通报道 如同在房地产中一样,在生物学中位置也很重要。活化基因的mRNAs战略性定位在整个活体组织中,它们的位置往往帮助调控了细胞和组织的生长及发育方式。然而为了同时分析许多的mRNAs,科学学家们不得不将细胞碾磨成浆,这使得他们没有好的办法精确确定这些mRNAs在细胞内的定位。现在,哈佛大学Wyss生物启发工程研究所和哈佛医学院的一个研究小组,与Allen脑科学研究所展开协作开发了一种新方法,使得科学家们能够在完整细胞中同时确定数以千计mRNAs和其他类型RNAs的定位——测定碱基序列来鉴别它们,并揭示出它们在做什么。研究人员将这种方法命名为荧光原位RNA测序(FISSEQ),
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从表观遗传组到转录组—高通量技术在科研/临床中的应用策略与解决方案
一、LncRNA研究利器——Arraystar第三代LncRNA芯片在疾病研究中的应用• 创新平台,研究利器:美国Arraystar公司第三代LncRNA芯片及相关检测工具• 行业领袖,硕果累累:发表文章最多的LncRNA研究平台---Arraystar经典案例剖析• 一站式解决方案:从课题设计,高通量芯片检测,到数据分析筛选与整合二、microRNA研究一站式解决方案——生物标记物筛选与功能研究• 一流平台,一站式服务:一站式研究microRNA的完整平台与应用实例• 分子标志物筛选:microRNA分子标志物筛选方案、模型建立与筛
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华人学者Nature子刊发布细胞重编程突破性成果
生物通报道 没有采用移植干细胞的方法来补充失去的细胞,来自德克萨斯大学西南医学中心的研究人员在活体哺乳动物大脑和脊髓中生成了新的神经细胞。尽管研究表明,有一天或许能够再生出来自人体自身细胞的神经元,以修复外伤性脑损伤、脊髓损伤或是治疗阿尔茨海默氏症一类的疾病,研究人员认为,现在断定这些初步研究中生成的神经元是否能够促成功能改善(未来研究工作的一个目标)还为时过早。脊髓损伤可造成不可逆的神经元丧失以及瘢痕形成,最终导致运动和感觉功能受损。科学家们希望再生细胞能够成为修复损伤的一条途径,但成人脊髓生成新神经元的能力有限。生物医学科学家们曾采用移植干细胞的方法来补充神经元,但却面临着其他
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中医药ISO标准实现零的突破
2月25日,国际标准化组织中医药技术委员会秘书处在京召开新闻发布会,宣布国际标准化组织(ISO)已正式通过并出版《一次性使用无菌针灸针》标准。该标准是世界传统医药领域发布的首个ISO国际标准,实现了中医药ISO国际标准零的突破。 ISO是世界上最大的非政府性国际标准化组织,现有161个成员(国家/地区),有“技术领域联合国”之称。我国于2009年向ISO提出成立中医药标准化技术委员会的申请,并于同年获得通过。中医药标准化技术委员会已有33个成员国,主要从事中药原药材与传统炮制规范、中药制成品、中医医疗设备、中医药术语和信息等中医药领域的产品质量与安全控制方面的国际标准化工作。 针灸作为传统医学
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新技术动态追踪mRNA的代谢
每天,人体都会产生新的细胞,以促进生长和维持生命。细胞周期可确保真核生物的发育和生存。为了让这一过程成功,数百个mRNA需要以时间特异的方式合成和降解。不过,测定这些变化十分困难,因为大部分技术都会扰乱细胞的代谢,明显改变其转录行为。2011年,德国慕尼黑大学的的生化学家Patrick Cramer及其同事引入了一种新技术来测定mRNA的合成和衰变。这种技术被称为动态转录组分析(DTA)。它结合了代谢RNA标记和动力学模型,让研究人员能够高灵敏度地追踪酵母细胞中mRNA的变化,从而实现mRNA代谢的监控,以及它如何被基因系统动态调节。Cramer认为,一个主要的好处是,它是一种非扰动的方法,让
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PNAS开发新型癌症试纸诊断技术
生物通报道 近年来发展中国家的癌症发病率急剧攀升,目前占据了全世界70%的癌症死亡率。早期检测证实可以改善预后,但发达国家所采用的一些筛查方法,例如乳房X光检查和结肠镜检查术,因太过昂贵而无法应用于具有很少医疗设施的环境中。为了缩小这一差距,麻省理工学院的工程师们开发了一种简单、廉价的试纸检测,有可能提高诊断率帮助人们及早得到治疗。这一诊断方法的作用原理很像妊娠检测,其基于尿液样本,可在几分钟内揭示个体是否罹患癌症。这种方法已帮助检测了一些传染病,新技术采用相同的策略实现了对非传染性疾病的检测。由麻绳理工学院教授、霍华德休斯医学研究所研究员Sangeeta Bhatia开发的这项新
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俄开发出诊断早期癌症技术 1分钟可出结果
科技日报讯 俄罗斯科学院西伯利亚分院热物理研究所科学家近日宣布,他们开发出一种通过激光纳米技术诊断早期癌症的新方法,从采样到分析完成仅需1分钟,且不需要对病人进行穿刺,十分简便易行,准确率可达85%以上。该研究所首席研究员弗拉基米尔·梅列京介绍,现有的诊断方法是根据血液中的血红细胞沉降率间接测量与癌症相关蛋白质的流体动力学半径,初步确定受检者是否患有癌症。研究人员发现,由于纳米粒子可以在不同液体间自由循环,借助激光光谱仪测量尿液中相关纳米粒子半径,可为诊断癌症提供依据。梅列京说:“我们已经研制出专门的激光光谱仪,用于测量尿样中的纳米颗粒。经过充分的试验论证,我们确定了这些颗粒的正常半径范围,如
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知名华人干细胞科学家Nature发布突破性成果
生物通报道 再生医学的力量使得科学家们现在能够将皮肤细胞转化为与心脏细胞、胰腺细胞甚至神经元非常相似的细胞(立即索取人间充质干细胞无血清培养基的详细资料)。然而,事实证明拯救生命疗法的重要前提条件:获得完全成熟的细胞生成方法比想象中要困难得多。现在,来自Gladstone研究所和加州大学旧金山分校(UCSF)的科学家们取得了一项重大的突破:他们发现了一种方法可将皮肤细胞转化为成熟的、全功能的肝细胞,甚至在移植到模拟肝衰竭的实验室遗传修饰动物体内后也能自身旺盛生长。在以往的肝细胞重编程研究中,科学家们很难获得在移植之后存活并生成肝组织的干细胞源性肝细胞。现在Gladstone-UCS
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Nature找到致命性脑癌治疗方法
生物通报道 来自多伦多大学实验医学和病理学(LMP)系的研究人员发现了一种新方法,可有效地靶向以往难以治疗的儿童脑癌形式:室管膜瘤(ependymoma)。Michael Taylor教授、主要作者Stephen Mack以及共同作者Peter Dirks教授将这些创新性的研究结果发表在2月19日的《自然》(Nature)杂志上。他们的研究表明,表观遗传是这种癌症的主要原因,一些获得FDA批准的药物可以靶向这一机制。DNA密码可比作是一个长度为30亿个碱基的指令集,指导细胞该如何运作。在这个比喻里,大多数的癌症都是由于单词拼写错误:一些单词被添加或删除,或是书中的某些章节整个被添加
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罗氏序列捕获技术用于电子医疗档案中药物基因组数据的生成
美国梅奥诊所是一所拥有悠久历史的综合医学中心,在美国拥有多家诊所、自己的医学院以及数千名临床专家和科学家。最近美国梅奥诊所在其医学期刊中发表了一篇文献1,介绍正在进行的一个以药物基因信息指导个性用药的项目,该项目也是美国国家健康研究所(NIH)支持的一个个性化用药研究项目(The Right Drug, Right Dose, Right Time-Using Genomic Data to Individualize Treatment Protocol) 的组成部分之一。在这个项目中,梅奥诊所的科研人员首先通过统计学模型,根据年龄、性别、种族和6种慢性病记录,从病人数据库中选出了在三年内有
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新生代技术令小鼠重见光明
生物通报道:科学家们在视杆和视锥受损的失明小鼠中,利用一种可见光激活的小分子,给视网膜神经节细胞(RGC)赋予了感光能力。文章于二月十九日发表在Cell旗下的neuron杂志上。加州大学伯克利分校的Richard Kramer和同事,使用一种被称为DENAQ的小分子,令失明小鼠恢复了视力。这种小分子可以在光学刺激下改变构象,成为一种光敏开关(photoswitch)。在健康小鼠中,视觉是特定感光细胞将光能转化为电能的结果。这些细胞(视杆细胞和视锥细胞)负责感知光线,并将视觉信息传递给RGC,随后由RGC与大脑进行通讯。视杆和视锥退化会导致失明(例如视网膜色素变性等),世界上数以百万计的人受到这
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新技术能进入活细胞取样
据物理学家组织网近日报道,美国加利福尼亚大学圣克鲁兹分校(UCSC)研究人员开发出一种机器人式的“纳米生物间谍”系统,能从单个活细胞内提取出微量样本,进行RNA或DNA测序,而不会杀死细胞。研究人员表示,这种单细胞“纳米生物间谍”技术是一种了解活细胞内部动态过程的有力工具。相关论文发表在最近出版的美国化学协会《纳米》杂志上。 “我们能从活细胞中拿走一个‘生物间谍’,再把它送回该细胞,在几天内这样重复多次而不会杀死细胞。如果用其他技术,你不得不牺牲这个细胞才能分析它。”该生物传感与生物电技术小组负责人、UCSC巴斯金工程学院生物分子工程教授内德·波曼德说。 “纳米生物间谍”平
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新技术可将癌细胞“钓”出大脑
外媒称,医生们公布了一项全新的脑肿瘤疗法——一种细小的钓竿。据英国《每日邮报》网站2月18日报道,这项技术利用纳米纤维将肿瘤细胞“拖”出大脑,借助与癌细胞扩散相同的原理将这种细胞“引诱”出来。专家说,这项技术能够有效治疗最具攻击性的恶性肿瘤——成胶质细胞瘤。据报道,令成胶质细胞瘤难以治愈的一个因素是,来自肿瘤的恶性细胞能够沿着神经纤维和血管入侵新的“领地”,进而扩散到整个大脑。 现在,研究人员掌握了如何拦截这种“迁移”机制的技术,他们利用一种比人类头发丝还细的纳米纤维薄膜将肿瘤细胞“引诱”出来,从而治疗癌症。报道援引首席研究员、美国佐治亚理工学院/埃默里大学华莱士·库尔特生物医学工程系主任拉维
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官方叫停“基因测序”因未获批 无关技术
日前,国家食药监总局和国家卫生计生委联合发出通知,要求在相关的准入标准、管理规范出台以前,任何医疗机构不得开展基因测序临床应用,已经开展的,要立即停止。官方给出的原因是,目前国内使用的基因测序仪及相关试剂、软件,均未获得国家对医疗器械的审评审批,属于“违法医用”。 什么是基因测序? 这一技术为何被叫停?有安全风险还是在准确性上根本不靠谱?一连串疑问,在两部委的“叫停”通知经媒体报道后,很快蔓延发酵。 昨天,新京报记者多方采访,努力呈现基因检测市场乱象,揭开国家叫停基因测序技术临床应用后的上述疑团。 释疑1 何为基因测序? 可判断人体对某些疾病易
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PNAS:软骨再生获重大突破
生物通报道:Duke大学的研究人员将基因治疗与合成支架结合起来,使整个系统在移植后仍能长期引导干细胞分化,生成新的软骨组织。这一技术突破将有望帮助人们在机体所需的任何部位生成替代性的软骨。文章于二月十七日发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上。用干细胞进行组织修复通常需要大量的生长因子,这一过程的成本很高,而且在移植后难以继续。Duke大学的研究人员为了避开了这一限制,对干细胞进行了遗传学改造,让它们在移植后能自行生产所需的生长因子。他们将递送基因的病毒、干细胞与合成材料整合在一起,整个系统就像一台计算机,其中支架提供硬件,病毒提供软件,对干细胞进行编程使其生成软骨组织。Duke大学医学中心的
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Nature突破性论文发表半月后遭受质疑
生物通报道 日本RIKEN中心在上周五宣布,正在对该机构的生物学家Haruko Obokata遭到指控在工作中犯下的违规行为进行调查。上个月末她作为主要作者在《自然》(Nature)杂志上发表了两篇研究论文(延伸阅读:Nature头条:重大突破细胞重编程新技术),证实采用一种简单的方法:施以应力,例如暴露于酸之中或是给细胞膜施加物理压力,就可以将成熟小鼠细胞重编程至一种胚胎状态,这使得她一举成名。在有人于博客网站上指控Obokata论文中使用了重复的图像,以及多次尝试而无法复制出她的结果之后,RIKEN启动了调查。 &nbs
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业界对DNA测序公司新技术褒贬不
美国佛罗里达州马可岛被奉为基因测序领域的圣地,每年都有大批研究基因测序的公司及科研人员会聚于此,分享最新科技成果。两年前,英国牛津纳米孔技术公司曾宣布,该公司已成功研发出对特定DNA片段进行测序的新技术,但很多人认为该方法并不现实。与其他技术相比,这一技术可以阅读更长的DNA片段(因此有望用于对细菌DNA的混合样本进行测序),并能实时显示结果。这种测序采用电泳技术,借助电池驱动单个分子逐一通过纳米孔实现测序。由于纳米孔的直径非常小,仅仅允许单个核酸聚合物通过,因此,可以在此基础上使用多种方法进行高通量测序。而且,纳米级别的孔径保证了检测具有良好的持续性,因此测序的准确度非常高。 经过
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基因芯片技术助力鲑鱼的选择性育种计划
大西洋鲑鱼(Salmo salar)是一种具有较高经济、环境和科学价值的鱼类。在世界范围内,大西洋鲑鱼的产量每年约为140万吨。大西洋鲑鱼也被认为是研究鲑科其它鱼类成员的一个模式种,同样它也是正在进行的基因组测序和组装项目的目标。其基因组序列,对于理解鲑鱼复杂性状的遗传调节非常重要,可用于改良水产业育种计划、居群和进化遗传学研究等。然而,不同于主要的陆生养殖物种,在大西洋鲑鱼中,目前从全基因组多态性变异中还未筛选出可用的高通量高密度基因分型芯片。现有的低密度SNP(单核苷酸多态性)微阵列包含大约6K的多态性SNPs。 通过选择性育种程序对大西洋鲑鱼进行遗传改良,最早在挪威开始于20世
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知晓慢性肾病进展有新方法
东南大学附属中大医院肾脏病研究所所长、博士生导师、中华医学会肾脏病学分会秘书长刘必成教授领衔的慢性肾脏病进展关键机制及其诊断标志物研究成果,近日获得教育部2013年度自然科学奖一等奖。 专家介绍,慢性肾脏病早期临床症状往往不明显,流行病学调查显示,人群对慢性肾脏病知晓率仅有10%,有30%的患者首次就诊时已是慢性肾衰,因此早期诊断和早期治疗十分重要。刘必成研究团队从慢性肾脏病最常见的症状——蛋白尿产生的原因入手,通过建立各种肾脏疾病动物模型、细胞培养以及对临床慢性肾脏病患者肾脏病理标本的研究,详细探讨了早期蛋白尿产生的分子机制,特别是足细胞损伤在蛋白尿形成中的作用。在此基础上,针对临床蛋白尿患
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可以防止血拴形成而不增加出血风险的新方法
瑞典卡罗林斯卡医学院的研究人员,在与一个国际团队的协作中,开发出了一种称为3F7的抗体,3F7能阻止活跃于凝血系统中一种称为凝血因子XⅡ(凝血因子十二)的蛋白质发挥作用。凝血因子XⅡ的被抑制,使得在临床上既能防止血管中形成血拴又不会增加出血的风险成为可能。血拴形成是由血液凝结成块而引起的;一条或更多条血管的血流可以被血凝块阻塞,这样就引发了如中风、心肌梗死或肺拴塞等血拴性疾病。目前,血拴形成是依赖抗凝血剂来预防和治疗的。抗凝血药物有许多种,如华法林(维生素K抑制剂)、新型的口服抗凝血剂(达比加群或利伐沙班)和肝素类药物。所有这些药物是针对凝血系统的不同组分,来防止血液凝结和阻碍血拴形成。然而,