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自闭症的基因突变提供了新的见解,并指出了可能的治疗方法
发表在《Cell Reports》上的一项新研究的发现,涉及达特茅斯大学Geisel医学院的Luikart实验室和佛蒙特大学韦斯顿实验室的研究人员的合作,为自闭症谱系障碍(ASD)的神经生物学基础提供了进一步的见解,并指出了可能的治疗方法。近年来,研究人员已经建立了某些突变基因与自闭症谱系障碍之间的紧密联系。其中最常见的一种叫做PTEN,通常作用是控制细胞生长和调节神经元改变连接强度的能力。当PTEN突变时,不仅会引起ASD,还会引起大头畸形(头肿大)和癫痫。“在之前的研究中,我们的实验室和许多其他实验室已经表明,PTEN突变会导致小鼠神经元之间兴奋性突触连接的数量增加——我们认为这可能是自闭
来源:The Geisel School of Medicine at Dartmouth
时间:2022-11-08
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AI小胜蛋白质专家团队 机器学习将推动生物技术快速发展
蛋白质是存在于所有生物体内的高度复杂的物质。Vikas Nanda花了20多年的时间研究蛋白质的复杂性。这位Rutgers大学的科学家长期以来一直在研究,构成蛋白质的氨基酸的独特模式是如何决定它们将成为从血红蛋白到胶原蛋白或者任何蛋白的,以及随后神秘的自我组装步骤——某些特定的蛋白质聚集在一起形成更复杂的蛋白复合物。因此,当科学家们想要进行一项实验,让一个对蛋白质设计和自我组装有着深刻直观理解的人类与人工智能计算机程序的预测能力进行对比时,Rutgers大学高级生物技术和医学中心(CABM)的研究员Nanda成为了其中的佼佼者。现在,谁或什么能更好地预测蛋白质序列结合最成功的比赛结果已经出来了
来源:Rutgers University
时间:2022-11-05
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中国科大/中科院深圳先进院毕国强教授团队在开发冷冻电镜原位成像技术取得重要突破
中国科学技术大学、中国科学院深圳先进技术研究院双聘教授毕国强团队,与美国加州大学洛杉矶分校周正洪教授合作,开发了一套基于深度学习的cryoET数据处理算法和软件IsoNet,有效解决了cryoET成像中的缺失锥效应和低信噪比问题,相关研究成果以Isotropic reconstruction for electron tomography with deep learning为题于2022年10月29日发表在Nature communications.研究人员搭建了一套迭代优化的自监督深度学习人工网络算法,并以旋转处理后的cryoET断层三维重构数据自身为训练集,实现了对cryoET断层三维重
来源:中国科学技术大学 | 生命科学与医学部
时间:2022-11-05
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数学科学学院陈松蹊团队提出基于污染过程的空气质量评估方法
空气污染是一个重要的环境和公共卫生问题,尤其在发展中国家。衡量污染排放水平及其对空气质量的影响受到气象条件、污染物区域传输等多因素的综合影响,是空气质量管理中一项紧迫而极具挑战性的任务。北京大学数学科学学院、统计科学中心陈松蹊教授团队利用大数据统计算法筛选污染过程和建模分析,在先前“静稳期数据实验”有效度量本地排放的成果基础上,提出了基于污染过程的空气质量评估方法。近日,该研究的论文“Episode Based Air Quality Assessment”在大气环境领域重要国际期刊Atmospheric Environment上发表。文章以位于华北平原北部的北京、唐山和保定三
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Nature等两篇论文发布突破性成果:癌细胞暴露在高黏度环境中移动得更好,转移潜能增加
视频显示由乳腺癌细胞组成的肿瘤细胞如何在高粘度(8 cP)条件下比在低粘度(0.7cP)条件下分离得更快和移动得更多 人体是由超过10亿个细胞组成的,这些细胞结合在一起形成了我们身体的组织和器官。然而,细胞是一种动态结构,通过不同的技术,在体内移动以完成各种功能,如愈合伤口或将营养物质运送到其他组织。了解癌细胞是如何在这些受限的环境中移动和做出决定是很重要的,因为90%的癌症相关死亡都与转移有关。Konstantinos Konstantopoulos和Miguel A. Valverde 在过
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激活体内的“隐藏”机制来治愈糖尿病伤口的新方法
印第安纳大学医学院的研究人员正在寻找一种治愈蛋白质来治愈伤口的方法,这种蛋白质在胎儿中很活跃,但在成人中基本不活跃,在糖尿病成人中也不存在。“我们已经从其他机构之前的研究中知道,如果胎儿受伤,它可以再生组织,或修复它像新的一样,”Chandan K. Sen博士说。“但在出生后,这种再生的伤口愈合能力就丧失了。成人的愈合相对低效,通常与不良疤痕形成有关。”在最近发表在《Molecular Therapy》上的这项研究中,研究小组关注的是一种名为含非硒半胱氨酸的磷脂过氧化氢谷胱甘肽过氧化物酶(NPGPx)的蛋白质。NPGPx在胎儿组织中很活跃,但在出生后的皮肤中大多不活跃。Sen说:“自然界本质
来源:Molecular Therapy
时间:2022-11-04
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中国科大/中科院深圳先进院在开发冷冻电镜原位成像技术取得重要突破
中国科学技术大学、中国科学院深圳先进技术研究院双聘教授毕国强团队,与美国加州大学洛杉矶分校周正洪教授合作,开发了一套基于深度学习的cryoET数据处理算法和软件IsoNet,有效解决了cryoET成像中的缺失锥效应和低信噪比问题,相关研究成果以Isotropic reconstruction for electron tomography with deep learning为题于2022年10月29日发表在Nature communications.研究人员搭建了一套迭代优化的自监督深度学习人工网络算法,并以旋转处理后的cryoET断层三维重构数据自身为训练集,实现了对cryoET断层三维重
来源:中国科学技术大学 | 生命科学学院
时间:2022-11-04
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DNA“纳米转运体”化学程序治疗癌症的突破
一种由DNA组成的新型药物转运体已经被设计出来并得到验证,这种转运体比人类头发小2万倍,可以改善癌症和其他疾病的治疗方法。这些分子转运体可以通过化学编程来输送最佳浓度的药物,使其比目前的方法更有效。来自蒙特利尔大学(UdeM)的一组加拿大研究人员在一项新研究中报告了这些细节,该研究将于今天(11月2日)发表在《Nature Communications》杂志上。 &nbs
来源:Nature Communications
时间:2022-11-03
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应用单细胞转录组技术强调了人内源性逆转录病毒在胆囊癌中的潜在功能
10月28日,Lancet旗下国际期刊eBioMedicine 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所崔杰研究组题为Single-cell RNA sequencing highlights the functional role of human endogenous retroviruses in gallbladder cancer的最新研究成果。 胆囊癌 (GBC)是最常见的胆道癌症,其特点是早期诊断困难、发展迅速、总体预后较差,需要继续寻找早期诊断标志物和开发新的治疗策略。人类内源性逆转录病毒(human endogenous retrovir
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新研究为自闭症的基因突变提供了新见解,并指出了可能的治疗方法
发表在《细胞报告》上的一项新研究的发现,涉及达特茅斯大学Geisel医学院的Luikart实验室和佛蒙特大学韦斯顿实验室的研究人员的合作,为自闭症谱系障碍(ASD)的神经生物学基础提供了进一步的见解,并指出了可能的治疗方法。近年来,研究人员已经建立了某些突变基因与自闭症谱系障碍之间的紧密联系。其中最常见的一种叫做PTEN,通常作用是控制细胞生长和调节神经元改变连接强度的能力。当PTEN突变时,不仅会引起ASD,还会引起大头畸形(头肿大)和癫痫。“在之前的研究中,我们的实验室和许多其他实验室已经表明PTEN突变导致小鼠神经元间兴奋性突触连接数量的增加——我们相信这可能是ASD患者表现出的症状的基
来源:Cell Reports
时间:2022-11-03
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Nature Chemistry:核糖体功能研究的新方法
图:说明Syroegin等人开发的天然化学结扎方法的原理。将半胱氨酸氨基酸(红色)添加到tRNA(左上蓝色)中,可以使tRNA融合到肽(左下黄色)中。由此得到的核糖体结构(中)和捕获的核糖体内部肽基trna的电子密度图(右)是在UIC实验中通过x射线晶体学得到的。 在被称为核糖体的微小细胞机器中,被称为信使rna (mRNAs)的遗传物质链与相应的转移rna (tRNAs)相匹配,形成氨基酸序列,这些氨基酸作为蛋白质离开核糖体。未完成的蛋白质被称为新生链体,它们被留在核糖体上。科学家们知道,其中一些新生的
来源:Nature Chemistry
时间:2022-11-03
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iScience:一种新的方法可以确定哪些基因与衰老过程相关
图片:来自北卡罗来纳州立大学的研究人员开发了一种新的方法来确定哪些基因与衰老过程相关。这项研究是在秀丽隐杆线虫上进行的,秀丽隐杆线虫是一种被广泛用作遗传和生物学研究模型的动物物种,但这一发现在衰老遗传学研究方面有更广泛的应用。这张图片显示的是秀丽隐杆线虫的头部,上面有荧光标记的蛋白质聚集物。 来自北卡罗莱纳州立大学的研究人员开发了一种新的方法来确定哪些基因与衰老过程相关。这项研究是在一种被广泛用作遗传和生物学研究模型的动物物种上进行的,但这一发现在衰老遗传学研究方面有更广泛的应用。“有很多基因我们还不知道
来源:iScience
时间:2022-11-03
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简单的方法,用更少的健身时间取得最佳效果
Ken Nosaka教授。 对于那些每天都在健身房锻炼的人来说,好消息来了:你可以把日常的重量减少一半,仍然可以看到同样的效果。伊迪丝考恩大学(ECU)的一项新研究表明,有一种肌肉收缩方式最能有效地增加肌肉力量和肌肉尺寸。该团队还包括来自日本新泻大学、西九州大学和巴西隆德里纳州立大学的研究人员。他们让一组人进行三种不同类型的哑铃运动,并测量结果。研究发现,那些只降低一个重量的人与其他人取得了相同的进步,尽管他们只重复了一半的次数。ECU的Ken Nosaka教授说,这一结果加强了之前的研究,即关注“偏心”
来源:European Journal of Applied Physiology
时间:2022-11-03
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Nature Biotechnology | 王晶团队开发m6A单碱基定量测序检测方法
2022年10月27日,北京大学药学院化学生物学系和天然药物及仿生药物国家重点实验室王晶团队联合北京大学生命科学学院伊成器团队在国际顶级学术期刊Nature Biotechnology杂志上发表了题为“Absolute quantification of single-base m6A methylation in the mammalian transcriptome using GLORI”的研究成果。m6A是高等真核生物mRNA内部含量最丰富的修饰,大约0.2-0.6 %的腺苷中存在m6A修饰。m6A依赖修饰酶、去修饰
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Nature Methods:构建人体组织详细图谱的新方法
图像:健康肺的细胞术图像。左边的红色结构是气道;中间黄色圆形结构为粘膜下腺,绿色圆形小结构为血管。 威尔康奈尔医学院的研究人员已经开发出一种计算方法,以前所未有的细节绘制人类组织的结构。他们的方法有望加速器官级细胞相互作用的研究,并可能为广泛的疾病提供强大的新诊断策略。该方法源于科学家们对经典显微镜和现代单细胞分子分析之间的差距感到沮丧。“在显微镜下观察组织,你会看到一堆细胞在空间上聚集在一起——你几乎立刻就能在图像中看到这种组织,”该研究的主要作者Junbum Kim说,他是威尔康奈尔医学院生理学和生物
来源:Nature Methods
时间:2022-11-02
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基于单细胞定量表征的丝状真菌启动子高通量筛选方法及应用
近日,中国科学院微生物研究所尹文兵研究组在Science China Life Sciences发表论文(Quantitative characterization of filamentous fungal promoters on single-cell resolution to discover cryptic natural products),以丝状真菌构巢曲霉为研究模型,建立了基于单细胞定量表征的丝状真菌启动子高通量筛选方法。 该研究首先建立了构巢曲霉高通量原生质体制备方法,并结合流式细胞仪单细胞荧光检测手段,创建了基于单细胞水平表征的真菌启动子高通量筛选方法,
来源:中国科学院微生物研究所
时间:2022-11-02
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新方法洞悉女性骨骼在分娩后被永久改变
本研究包括的7块股骨(大腿骨)横断面的显微镜图像,按年龄和性别识别。 一组人类学家发现,生殖会以一种前所未有的方式永久性地改变女性的骨骼。这一发现基于对灵长类动物的分析,为生育如何永久改变身体提供了新的思路。“我们的发现提供了生殖对女性机体产生深远影响的额外证据,进一步证明骨骼不是一个静态的器官,而是一个随着生活事件而变化的动态器官,”Paola Cerrito解释说,他是纽约大学人类学系和牙科学院的博士生,领导了这项研究。具体来说,研究人员发现,在经历过繁殖的雌性体内,钙、镁和磷的浓度较低。这些变化与生
来源:PLoS ONE
时间:2022-11-02
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一种预测方法能更好的辨别哪些物种是脆弱的
野火、洪水、污染和过度捕捞等破坏因素都可能改变生态系统的平衡,有时甚至会危及整个物种的未来。但是,评估这些生态系统以确定哪些物种面临的风险最大,从而将保护行动和政策集中在最需要它们的地方,这是一项具有挑战性的任务。大多数这样的研究假设生态系统本质上处于一种平衡状态,在最终恢复到平衡状态之前,外部扰动会导致暂时的变化。但这一假设无法解释生态系统经常处于变化之中的现实,它们不同组成部分的相对丰度随着它们自己的时间表而变化。现在,麻省理工学院和其他地方的一组研究人员提出了一种更好的、可预测的方法来评估这些系统,以便对不同物种的相对脆弱性进行排名,并检测出受到威胁但可能被忽视的物种。他们发现,与目前进
来源:Ecology Letters
时间:2022-11-02
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一种新的秀丽隐杆线虫成虫的光片活体成像方法
图片:被胚胎包围的成年线虫(秀丽隐杆线虫)的程式化图像。 。—活体成像研究的美妙之处在于标本是活的,可以随着时间的推移记录细胞分裂和胚胎发育等动态。然而,活体成像研究的挫折在于标本是活的——扭动、扭曲、逃离视野。而且,它很脆弱,容易被成像设备热损坏或死亡。MBL成像研究专家Carsten Wolff说,最近MBL胚胎学课程出现了解决这一困境的技术方案,这是“MBL合作努力的一个经典例子”。“在2021年的胚胎学课程中,我们开始开发一种能让我们成像成人的技术秀丽隐杆线虫通过使用光片显微镜,可以更长时间、高分
来源:Frontiers in Cell and Developmental Biology
时间:2022-11-02
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Nature Communications︱张晓明课题组应用单细胞技术揭示高致死MDA5抗体阳性皮肌炎核心免疫学特征和治疗...
10月29日,国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所张晓明课题组题为Single-cell profiling reveals distinct adaptive immune hallmarks in MDA5+ dermatomyositis with therapeutic implications的研究论文,揭示了高致死性“MDA5抗体阳性皮肌炎”(Anti-melanoma differentiation-associated gene 5-positive dermatomyositis,简称“MDA5+ DM”)的核心免疫