• “改变游戏规则”：一种用计算机模拟分子生命的新技术

  堪萨斯大学在本周的《美国国家科学院院刊》上发表了一篇里程碑式的报告，提出了一种用计算机模拟分子生命的新技术。根据第一作者Ilya Vakser，计算生物学项目和计算生物学中心主任，堪萨斯大学分子生物科学教授，对生命过程的计算机建模的研究是在原子分辨率下创建活细胞的工作模拟的重要一步。这一进展预示着对细胞基本生物学的新见解，以及对人类疾病更快、更精确的治疗。Vakser说:“它比现有的原子分辨技术快数万或数十万倍。”“这为描述生理机制提供了前所未有的机会，这些生理机制目前远远超出了计算建模的范围，从而深入了解细胞机制，并利用这些知识提高我们治疗疾病的能力。”到目前为止，通过计算机建模细胞的一个主

  来源：University of Kansas

  时间：2022-10-11

• 利用世界首创的超声技术，克服传统医学光学成像的局限性!

          □19日(星期一)，DGIST院长Yang Kook宣布，由Jin Ho Chang和Jae Youn Hwang教授领导的联合研究小组开发了世界上第一个激光扫描显微镜技术，可以利用超声波临时产生的气泡对生物组织进行更深入、更详细的观察。□光学成像和治疗技术广泛应用于生命科学研究和临床实践。然而，由于组织内发生光学散射，光的透射率较低。因此，对深部组织的图像采集和处理存在着固有的局限性。这极大地阻碍了应用领域的扩展。□为了克服这个问题，2017年，张金浩(Jin Ho Chang)教授的团队设想，可以使用微米大小的气泡，这种气泡通常

  来源：Nature Photonics

  时间：2022-10-10

• 单细胞测序技术揭示了急性肾损伤的关键过程

  急性肾损伤(AKI)是与各种疾病相关的常见并发症，尤其影响重症监护病房的患者。然而，AKI的潜在机制还不完全清楚。就在最近，一个跨学科的研究团队使用单细胞测序技术来揭示与AKI相关的分子过程，研究人员描述了损伤肾细胞的新基因表达模式，可能导致新的治疗方法和生物标志物发现策略。这些研究是在Charité - Universit tsmedizin Berlin的密切合作下进行的;柏林医学系统生物学研究所(BIMSB) Max Delbrück中心;德国柏林风湿病研究中心(DRFZ)，莱布尼茨研究所;和汉诺威医学院肾脏是人体最重要的器官之一。它们从血液中过滤废物，控制体液组成和血压，影响能量代谢，

  来源：Genome Medicine

  时间：2022-10-10

• 李栋课题组与合作者开发合理化深度学习超分辨显微成像方法

  　　近年来，以深度学习为代表的计算超分辨方法能够在不损失其他成像性能的前提下，提升显微图像分辨率或信噪比，表现出巨大的应用前景。然而，针对生物医学研究必需高保真度、可定量分析的图像要求，目前深度学习显微成像方法存在以下三大共性问题： 　　（1）受限于深度学习内秉的频谱频移（spectral-bias）问题，输出图像分辨率无法达到真值（ground truth）水平； 　　（2）受限于超分辨重建以及去噪问题的病态性（ill-posed problem）和神经网络模型的不确定性（model-uncertainty），重建或预测结果的真实性无法得到保障； 　　（3）深度神经网络的训练需要大量数据，高

  来源：中国科学院生物物理研究所

  时间：2022-10-10

• 人类基因组的“暗物质”中发现了新的癌症治疗方法

  癌症是全球第二大死因。在不同类型的癌症中，非小细胞肺癌(NSCLC)是导致患者死亡最多的癌症，而且大部分患者仍然无法治愈。不幸的是，即使是新批准的治疗方法也只能延长患者的生命几个月，只有少数人能长期存活。因此，人们正在寻求以新颖的方式治疗癌症的新疗法。在最近发表在《Cell Genomics》杂志上的一项研究中，伯尔尼大学和因塞尔医院的研究人员确定了针对这种癌症的药物开发的新靶点。基因组的暗物质为了寻找新的目标，他们研究了被称为“长链非编码RNA(lncRNAs)”的一类人们知之甚少的基因。lncRNAs大量存在于所谓的“暗物质”或非蛋白质编码DNA中，构成了我们基因组的绝大多数。人类基因组包

  来源：University of Bern

  时间：2022-10-09

• 在人类基因组的“暗物质”中发现新的癌症治疗方法

          图片:转染绿色荧光标记ASOs的三维肺癌球体的显微镜照片。    癌症是瑞士第二大死因。在不同类型的癌症中，非小细胞肺癌(NSCLC)是导致患者死亡最多的癌症，而且大部分患者仍然无法治愈。不幸的是，即使是新批准的治疗方法也只能延长患者的生命几个月，只有少数人能长期存活。因此，人们正在寻求以新颖的方式治疗癌症的新疗法。在最近发表在《细胞基因组学》杂志上的一项研究中，伯尔尼大学和因塞尔医院的研究人员确定了针对这种癌症的药物开发的新靶点。基因组的暗物质  为了寻找新的靶点，他们研究了被称为“长链非编码rna

  来源：Cell Genomics

  时间：2022-10-09

• 突破性研究发现免疫系统的“关闭按钮”

  科学家们已经发现是什么关闭了分子警报系统，该系统在我们的免疫反应中起着至关重要的作用。抗菌超级英雄MR1 (MHC i类相关分子)是一种存在于人体每个细胞中的蛋白质，它具有分子警报系统的功能，当癌症或细菌感染出现时，向免疫系统中的强大细胞、白细胞发出警报。   虽然之前的突破性研究揭示了MR1激活所依赖的细胞机制，但直到现在，人们对MR1警报是如何“关闭”的还一无所知。这项研究由墨尔本大学的Hamish McWilliam博士和Doherty研究所和Bio21研究所的Jose Villadangos教授共同领导，发表在《Journal of Cell Biolog

  来源：Journal of Cell Biology

  时间：2022-10-08

• 检验与生物技术学院马骊团队在Science子刊发文揭示Viperin抗结核感染免疫新机制

  2022年10月4日，检验与生物技术学院分子免疫学研究所马骊团队在Science signaling上在线发表了题为“Viperin impairs the innate immune response through the IRAK1-TRAF6-TAK1 axis to promote Mtb infection”的研究论文。Science Signaling是Science旗下综合性子刊、中科院1区Top期刊（IF 9.517）。马骊教授为通讯作者，周新莹副教授、张泽霖硕士为并列第一作者。本研究受国家自然科学基金、广东省自然科学基金等项目资助。 作为重要的干扰素刺激基因

  来源：南方医科大学

  时间：2022-10-08

• 叶新山团队在糖自动合成领域获重大突破

  2022年9月29日，北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室叶新山研究团队在《自然-合成》（Nature Synthesis）上在线发表了题为《自动液相乘法合成复杂聚糖到1080糖》（Automated solution-phase multiplicative synthesis of complex glycans up to a 1,080-mer）的研究论文，报道了关于糖类化合物合成领域的突破性进展。其团队基于“预活化”一釜多组分糖基化反应和液相乘法合成的原理

  来源：北京大学医学部

  时间：2022-10-08

• Nature Genetics发布癌症传播方式新突破：癌症利用人体组织修复过程将细胞扩散到全身

          图片:英国剑桥癌症研究所理查德·吉尔伯特森教授的团队    图片来源:英国剑桥癌症研究所英国癌症研究中心资助的科学家们发现，癌细胞“劫持”了健康细胞在全身扩散的过程，这完全改变了目前人们对癌症转移的看法。英国剑桥大学癌症研究所的研究小组发现，阻断患癌小鼠细胞中NALCN**蛋白的活性会引发转移。这项研究发表在自然遗传学(29日th9月)，也发现这一过程不仅仅局限于癌症。令他们惊讶的是，当他们从没有癌症的老鼠身上移除NALCN时，这导致它们的健康细胞离开了原来的组织，并在身体各处与其他器官结合。例如，他们发现来自

  来源：Nature Genetics

  时间：2022-10-06

• 叶新山团队在糖自动合成领域获重大突破

  2022年9月29日，北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室叶新山研究团队在《自然-合成》（Nature Synthesis）上在线发表了题为《自动液相乘法合成复杂聚糖到1080糖》（Automated solution-phase multiplicative synthesis of complex glycans up to a 1,080-mer）的研究论文，报道了关于糖类化合物合成领域的突破性进展。其团队基于“预活化”一釜多组分糖基化反应和液相乘法合成的原理，自主研发了新型双模式液相糖自动合成仪；并利用该自动合成仪合成了各种复杂结构的寡糖和多

  来源：北京大学药学院

  时间：2022-10-01

• 《Neuron》新技术解锁难以研究的“嗅觉能力”

          图:左列图像显示小鼠嗅球的僧帽细胞(上)和簇状细胞(下)。右栏的插图显示了每种神经元的电路在嗅球中的组织方式。    自100多年前被发现以来，大脑嗅球中被称为簇状细胞的神经元一直难以研究。簇状细胞和其他被称为僧帽细胞的神经元之间的距离太近，限制了分析每个神经元活动的能力。通过利用荧光遗传标记和新的光学成像技术，冷泉港实验室(CSHL)的神经科学家能够比较神经元的活性。CSHL副教授Florin Albeanu和助理教授Arkarup Banerjee发现，簇状细胞比僧帽细胞更善于识别气味。他们发现，簇状细胞对

  来源：Neuron

  时间：2022-09-30

• 化学学院刘忠范课题组、彭海琳课题组与合作者报道大面积石墨烯无损洁净转移方法

  石墨烯优异的电学和光学等性质使其在高端电子、光电子器件等领域有着广阔的应用前景。化学气相沉积（chemical vapor deposition, CVD）方法制备的石墨烯薄膜材料具有质量高、大面积、层数可控等优点。然而石墨烯薄膜通常需要在金属衬底上制备，为实现其后续功能应用，通常需要将金属衬底上制备的石墨烯薄膜转移至目标功能衬底上，而大面积石墨烯转移过程中通常会产生石墨烯破损、褶皱和污染等问题，严重影响转移后石墨烯的性质。因此，如何实现石墨烯大面积无损、洁净转移仍是石墨烯应用领域的研究技术瓶颈，亟待解决。针对这一问题，最近，北京大学化学与分子工程学院刘忠范教授课题组、彭海琳教

  来源：北京大学新闻网

  时间：2022-09-30

• NEJM：与标准胰岛素输送方法相比，仿生胰腺改善了1型糖尿病的管理

  一项新的多中心临床试验发现，在1型糖尿病患者中，一种被称为仿生胰腺的设备使用下一代技术自动输送胰岛素，在将血糖水平维持在正常范围内方面比标准护理管理更有效。该试验部分在杰克逊维尔的内摩尔儿童健康中心进行，主要由国家卫生研究院下属的国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所(NIDDK)资助，并发表在《新英格兰医学杂志》上。自动胰岛素输送系统，也被称为人工胰腺或闭环控制系统，使用连续的血糖监测器跟踪人体的血糖水平，并在需要时使用胰岛素泵自动输送胰岛素激素。这些系统取代了依靠手指棒检测血糖水平、通过每日多次注射提供胰岛素的连续血糖监测器或没有自动化的泵。与其他现有的人工胰腺技术相比，仿生胰腺需要更少的用户输

  来源：New England Journal of Medicine

  时间：2022-09-29

• 一种测试蛋白质类药物的新方法

  新泽西理工学院(NJIT)的研究人员公布了一项新的实验室技术，他们说这代表了制药实验室如何测试和生产新的蛋白质类药物的“范式转变”，例如正在开发的治疗性单克隆抗体，用于治疗从癌症到传染病等多种疾病。研究人员说，他们在《分析化学》(Analytical Chemistry)杂志上描述的基于电化学的方法，可以在传统方法所需时间的一小部分内完成对新兴生物疗法的安全和质量检测。传统方法通常需要长时间和昂贵的生产用于样本检测的某些生物材料。这项研究是与默克公司、强生公司和俄亥俄大学的研究人员合作进行的，并得到了美国国立卫生研究院379,397美元的资助。“我们在新泽西理工大学开发的这种方法有可能对定量蛋

  来源：New Jersey Institute of Technology

  时间：2022-09-29

• 研究人员发现了控制家中木材中致癌物质甲醛释放的方法

  由马萨诸塞大学阿默斯特分校和北德克萨斯大学联合领导的一项新研究，促进了我们对家中和办公室的木材如何释放甲醛的理解，甲醛是一种强致癌物，其水平可超过某些健康限值。最近发表在《绿色化学》(Green Chemistry)杂志上的研究结果承诺将促进公众健康，他们的解决方案是一种有效、低成本的方式，可以减轻甲醛造成的损害。该团队已经为此申请了专利。甲醛是一种无色无味的气体，是一种强致癌物。即使是较低的暴露水平也与某些类型的癌症和白血病有关。人们早就知道，从刨花板到窗帘和地毯，某些制造的家居产品会向生活空间释放甲醛。木材本身也会释放甲醛，众所周知，高温木材加工会释放大量的化学物质。然而，事实证明，木材—

  来源：Green Chemistry

  时间：2022-09-29

• 靶向时钟蛋白！这一突破性进展助力胶质母细胞瘤药物研发

          图:一种新型小分子药物，首个以生物钟蛋白为靶点治疗胶质母细胞瘤的药物，目前正处于第一阶段临床试验。    胶质母细胞瘤是成年人最常见的恶性脑瘤，是一种侵袭性疾病，一旦确诊，患者平均只能存活15个月。尽管对胶质母细胞瘤的病因和治疗进行了20多年的研究，但预后几乎没有改善。但南加州大学凯克医学院领导的团队最近的研究表明，在当前的标准治疗后，帮助协调一天中身体功能变化的生物钟蛋白可能在胶质母细胞瘤的生长和增殖中发挥关键作用。这一发现带来了一个潜在的突破:发现了一种名为SHP656的小分子药物，它可以靶向时钟蛋白，并可

  来源：

  时间：2022-09-28

• PacBio公布了一种全面的全基因组串联重复分析的新方法

  高质量、高精度测序解决方案的领先开发商PacBio(纳斯达克代码:PACB)今天宣布推出一种新的计算分析方法，使用PacBio原生的长读HiFi测序数据，对人类基因组中超过100万个串联重复序列(TRs)进行分析。串联重复基因分型工具(TRGT:发音为“target”)旨在为科学家提供获得全基因组TRs序列和甲基化状态的完整表征的能力。我们相信TRGT将使科学家更好地理解已知TRs在人类疾病中的作用，并可能导致发现新的致病TRs。串联重复序列是序列重复的基因序列，它们可以在从父母到孩子的长度上增长。重要的是，TRs与许多神经系统疾病有关，如渐冻症和亨廷顿氏舞蹈症，此外还有遗传性精神智力残疾的头

  来源：PacBio

  时间：2022-09-28

• 新机器学习方法更好地描述神经退行性疾病进展

  神经退行性疾病——如肌萎缩性侧索硬化症(肌萎缩性侧索硬化症)、阿尔茨海默症和帕金森症——是复杂的慢性疾病，可出现各种症状，以不同的速度恶化，并有许多潜在的遗传和环境原因，其中一些是未知的。尤其是肌萎缩侧索硬化症，它会影响到随意的肌肉运动，而且总是致命的。不过，虽然大多数人在确诊后只能存活几年，但也有人会患病数十年。肌萎缩性侧索硬化症的表现也可能有很大差异;通常病情发展较慢与肢体起病有关，影响精细运动技能，而更严重的是球部肌萎缩侧索硬化症影响吞咽、说话、呼吸和行动能力。因此，了解肌萎缩性侧索硬化症(ALS)等疾病的进展对临床试验的登记、潜在干预措施的分析和发现根本原因至关重要。然而，评估疾病的进

  来源：mit

  时间：2022-09-28

• AI赋能血检设备，“慧眼”判读抗体强度——苏州医工所提出不完全抗体分级检测新方法

  　　输血是临床上治疗急性失血、贫血和凝血障碍的主要手段，挽救了无数患者的生命。但输血不相容会导致多种输血不良反应，增加溶血性疾病（如新生儿溶血病、自身免疫性溶血病、药物免疫性溶血病）和肾功能衰竭的风险，严重者会导致死亡。不完全抗体是引发溶血性输血反应的主要因素，为有效避免输血不良反应，输血前应借助抗人球蛋白试验方法对患者进行不完全抗体反应强度的检测。如图1所示，不完全抗体检测反应强度分为五级，强度越大，输血不相容的程度越高，如果输入血液与患者自身血液不相容的程度越高，输血不良反应越严重。  　　目前在临床上广泛应用的是微柱凝胶抗人球蛋白试验，但存在易出现假阳性结果、试剂原材料价格

  来源：中国科学院苏州生物医学工程技术研究所

  时间：2022-09-28

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